Arcobacter nitrofigilis: Arnit_0553
Help
Entry
Arnit_0553 CDS
T01235
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ant
Arcobacter nitrofigilis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ant00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ant02000
]
Arnit_0553
Transporters [BR:
ant02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Arnit_0553
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF2147
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADG92218
UniProt:
D5UZI1
LinkDB
All DBs
Position
complement(538846..540921)
Genome browser
AA seq
691 aa
AA seq
DB search
MKKEFLKRNLSISLSSLLLTSPLLFAQESTTLNEVNIIENGISNYQSEEKVKLNRTGIDI
EDTAKSIQVFNKTLIEDASLRNIDDIIELSSNTVYTGDTDGKSTNISMRGFSGVPILIDG
LKVTNKISNPEVFALEAVEIQKGPDSLQYGQSSPGGIVNLVKKKPSKETIANIELEINDN
PSYTPKLDIGGSLNEDKSLYFRLISTYQYDEGYTKSNTNTNKIFIAPSLAYDLNDNNTFT
FISEYTKETTPTRFGTNVNSKGELVAPIENVASHPDEEYKRTQKIIGFNFDTIYDTWNSK
FKYKYITHVRDYGNVYLPLSYNESTNTVTRYPADQRGEYKEHALQYTLNKELKILNLKNN
ISIGADYNKAYSSGTSNIALQAYNINLSNPVYEKHINPVNSYPITRDMSGKDSYVKSWGT
FLQDSINLTDDLIFSAGVRYSESKPKNGKKTDAISPSFGLVYHVTDKTSLYTNYSESFTP
NSATDKSGNILDPETGKGYEIGVKQKLFDDRLNLTAAIFKIEKENIALADPDAPSNSGWS
VPSGKQESQGFELDLAGDITSNWSVIASYGYTKTKNKDNDDKNLRNIPKHTANIFTTYKL
STFDLPDFYVGAGARYLGSKYADDANSIKLDSAIIYNATLGYKKGNWKANISVQNLTDEE
YVDGSASGKTSDTRVYVGDPRTVLATISYKF
NT seq
2076 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagaatttcttaaaagaaatttatcaataagcctttcttctcttttattaaca
agtccattactttttgcccaagagagtacaacattaaatgaagttaatattattgaaaat
ggcatttcaaattatcaaagtgaagaaaaagtaaaattaaatcgtacaggtattgatata
gaagatactgccaaatctatacaagtttttaataaaacattgattgaagatgcaagtctt
cgaaatattgatgatattatagaattatcatcaaatactgtttatactggtgatacagat
ggaaaatcaactaatatttctatgagaggattttcaggagttcctattttaattgatgga
ttaaaagttacaaataaaatctcaaatccagaagtttttgctttagaagcagttgagata
caaaaaggtccagactcattgcaatatgggcaatcaagtcctggtggaatagtaaactta
gttaaaaagaaaccttcaaaagagactattgcaaatatagaattagagataaacgacaat
ccatcttatactccaaaacttgatattggtggtagtttaaatgaagataaatcattatat
tttagacttatttccacttaccaatatgatgagggatacacaaagagtaatacaaacaca
aataaaatatttatagctccaagtttagcttatgatctaaatgataacaacacttttact
tttattagtgaatacactaaagaaacaactcctacaagatttggaactaatgttaatagt
aagggagagcttgtagcacctatagaaaatgttgcttcccatcctgatgaagagtataaa
agaacacaaaaaattattggatttaattttgatactatttatgacacttggaactctaag
tttaaatataaatatatcacacatgtaagagattatggaaatgtttatttaccactttct
tataatgaatcaacaaacacagtcacaagatacccagcggatcaaagaggtgaatataaa
gagcatgctttacaatatacacttaataaagagcttaaaatacttaatttaaaaaataac
attagtattggtgctgattataataaagcatattcaagtggaacttctaatattgcttta
caagcttataatataaatctttcaaatccagtttatgaaaaacatataaatcctgtaaat
tcatatcctatcacacgagatatgtcaggtaaagattcttatgtaaaatcgtggggaaca
tttctacaagatagcataaatctaacagatgacttaatatttagtgcaggagtaagatat
agtgaatctaaaccaaaaaatgggaaaaaaactgatgcaattagcccttcatttggatta
gtttatcatgtcacagataaaacaagcctatatacaaattactctgaatctttcacacca
aatagtgctacagataaaagtgggaatattttagatcctgaaacaggaaaaggatatgaa
attggagtcaaacaaaaactatttgatgatagattaaatttaacagctgccatatttaaa
atagaaaaagaaaatattgcattggcagatcctgatgctccttctaatagtggatggtca
gttccaagtggtaaacaagagagtcaaggctttgaattagacttagcaggtgatattaca
tcaaattggtctgtaattgcttcgtatggatatactaaaacaaaaaataaagataatgat
gataaaaacttaagaaatatcccaaaacatacagcaaatattttcacaacatataaatta
tctacttttgatttaccagatttttatgttggtgcgggagctagatatttaggaagtaaa
tatgcagatgatgcaaatagtataaaactagattctgcaattatttataatgcaacactt
ggttataaaaaaggaaattggaaagcaaatattagtgttcaaaatctaacagatgaagag
tatgttgatggatcagcttcaggtaagacaagtgataccagagtatatgtaggagatcca
agaactgttcttgcaacaatcagttataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
