Arcobacter nitrofigilis: Arnit_1517
Help
Entry
Arnit_1517 CDS
T01235
Name
(GenBank) Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type
KO
K07326
hemolysin activation/secretion protein
Organism
ant
Arcobacter nitrofigilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ShlB
POTRA_2
POTRA_3
HTH_52
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADG93173
UniProt:
D5V606
LinkDB
All DBs
Position
1516055..1517671
Genome browser
AA seq
538 aa
AA seq
DB search
MYKIIFISILVFSFLHAKTVDDVIKKQNLFENQKKVYKDKEKQKEEKIFHYDIKKPKVEE
KDKGKCFNIIKINDQNITLLSQKAKAKVFNKYLNKCNTINDIKNLINDVTSLYIDKGYIT
SRVYIKGQNIKDGILTLHAVEGKIEDIKSKKLYTKNSFFRLKGDYLNLRDLEVGIENLNR
LNSNNAKLNLKPGSNTGLSIVEIENETSSPISGYITYNNFGTDPTGKHQFGLNANIDNPI
GFSDLFSINYNTTNKQNTQNNSIGDSYSYSFPIGRLLYTLSYSESSYKQVIPANFNKFYS
KGKNKNYTLDLNYKLFHNQNNKINLGYFINYYVSKNYINEALVETSTYNLSKTGFKLNYI
YQSQTFQMYTTLQHVRGVHWFNNENPTALDDKFKVFIFDNYISKSFDNFRYSLDFHAQRS
SQQLFSVNQISIGGPYSVRGYKEDGLSGNSGYYYRNELAYIINNETLKNLSLTPYIALDG
GWVRKQEDTDGGNLLGKAIGLKASYKKLYYDMYYSKAIKTYDVTENKNFLGFNVSYRF
NT seq
1617 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacaaaataatatttatatcaattttagtcttttcttttctacatgcaaagacagta
gatgatgtaatcaaaaaacaaaacctctttgaaaatcaaaaaaaagtatataaagacaaa
gaaaaacaaaaagaagagaaaatcttccattatgatattaaaaaacctaaagttgaagag
aaagacaaaggtaaatgctttaatattataaaaatcaatgatcaaaatatcactctttta
tctcaaaaagcaaaagcaaaagtttttaataaatatcttaataaatgtaatactattaat
gatataaaaaatctaataaatgatgtaacatctttatatattgataagggttatattact
tcaagagtatatataaaaggtcagaatattaaagatggtatcttaactttacatgcggta
gaaggtaaaattgaagatattaaatcaaaaaaactttacacaaaaaattctttttttaga
ttaaaaggtgattacttaaacttgagagatttagaagtaggtatcgaaaatttaaatcgt
cttaattctaataatgcaaaattaaatttaaagccaggtagtaatacaggattaagtatt
gttgaaatagaaaatgaaacttcatctcctattagtggttatattacttataataatttt
ggtacagatccaacagggaaacatcaatttggcttaaatgctaatattgataatccaatt
ggatttagcgatcttttctctataaattacaatacaaccaataaacaaaacacacaaaat
aattcaataggagatagctatagctactcttttccaattggtagattattgtatacatta
agttattcagaatcaagctataagcaagtaataccagcaaatttcaataaattttattca
aaaggtaaaaataaaaattatactcttgatttaaattataaactctttcacaatcaaaat
aataaaatcaatcttggatattttataaattattatgtcagtaaaaattatataaatgaa
gccttagtagaaacatcaacttataacctatcaaaaacaggatttaaactaaactacatt
tatcaatcacaaacttttcaaatgtatacaaccctgcaacatgtaagaggtgtacattgg
tttaataatgaaaatccaacagctcttgatgataaattcaaagtttttatctttgataat
tatatttcaaaaagttttgataattttagatattccttagactttcatgctcaaagatct
tctcaacaactattctctgttaatcaaataagtattggtggtccatatagtgttagggga
tataaagaagatggattaagtggtaatagtggatattactatagaaatgaattagcctac
ataattaataatgaaactttaaaaaacttaagcttgactccttatatagccttagatggt
ggatgggttagaaaacaagaagatacagatggtgggaatcttttagggaaagctatcgga
ttaaaagcaagttataaaaagctctattatgacatgtattattctaaggctataaaaaca
tatgatgttacagaaaataaaaactttcttggatttaatgtaagttataggttctaa
DBGET
integrated database retrieval system