Anaerotignum sp. MB30-C6: RBQ60_09140
Help
Entry
RBQ60_09140 CDS
T09679
Name
(GenBank) DUF5979 domain-containing protein
Organism
anv
Anaerotignum sp. MB30-C6
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7601
DUF5979
SpaA
Collagen_bind
DUF11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMI80005
UniProt:
A0AA51GR24
LinkDB
All DBs
Position
complement(1840210..1845003)
Genome browser
AA seq
1597 aa
AA seq
DB search
MKKKMQLLMSWLLFLVMTLNLLSPPREVYAALNVEPLTDFTSQVRQSGVEIQEGGTLKND
ESISVEISFGVPVLGDEPEPANPVQKGDSISIELSESFKLISSHNIPLKMGDILVGHVNF
TTDPSTQMVVANVIFDGDDEVFDGTSNTVKCRFEASFEYDGSGQAGEEGDHVVSMLEKTF
TVHIPPAEIFYEVTKSGNLDLQSKTIQWTVDLSAKQGGADISLEGYQFFDDLSTVGEYIP
NSFTVDGVSDTPIIEGDSIRYSFPGNAQSPQTITFETAIPDNLYYSSDSQSIVNRAQLQD
SMNTVLAEDEYPVSFTPQWIEKEGAPSDSGSSGVYDPKNRTITWTITANHMEATLNNVVI
TDVLPNGLTFQSANLKTWDGTGWQDWTAISPNEAGEYELGTIDSKILLTIVTSVPDDDYT
TGTKSFKNSAKIRWDGSPGEIATDPIEVGIGYNAIGKSGVTNTSTRSVKWTVTVDTRTQA
IPDLKVYDLLVYGDRTSGFHYSQTTGLPAGIENELYPQFDQKYIDGSFSGTGLNITVHPV
IQDGKVVADLLEITGFKNDSLNTFTFDTMVVNPDVFAGNKTSDVWNVASLYSANTKLNEA
TDRVDYTSKLLSKEMLDSSATSNPAAGVNSAITKNANEGFNYVDKSVIFRLSINADGFDL
TNMTNALGQSLGAATVTDTLPEGWEFEEIIPGSNFLIFEGTSGSSRTVQGVDSIADTVVG
LNASISGREATFTFDTLDKPYVILLKAKPTSETVSEYFNANKTTTVRNNLKLSTANWTPG
VSSYQDVTIRSKLLEKTLDKPHAGELLWTVDYKAYDLPQGCTKLNDTLPAGIDLRLDSKG
ELILSDNNISIHELTLKADGSYVLGNEVALVNNGNVLYDNASRVLTFRIPDSTKSYRFSY
ITDITGDPGTISNTVSLHSGDGKQEQTGHPYVITTADGEATLQRNGWIIITKEDGSGATL
SGAEFTLFASDGKTVIRKGITGSNGTLRFRVIPDGNYILKETMAPLGYTKDNKTHTLSVT
TTGSTVVSSINGKTGKGSNAITVQNYLAGIAGDLTITKTVAGNAADKTKKFDFTVTFVGA
NGTYNYIGSGVPDGTIKSGDTVSLAHGESITIMKLPKDISYTVREADYSNEDYSTTTTGD
KGTILADTVQTASFVNTKSAGSLTIVKSVTGNAADKTKKFDFTVTFVGANGTYDYIGSGV
PNGTIKSGDRISLAHGESITIMKLPKGISYTVSEADYSSEDYSTTSTGEKGTILADSPQT
ASFVNGKNKKPTGGGSGGGSTGELTISKTVVGAGKDMDKKFKFNVTFKGSSDSYQYTGNG
VSGGTIQSGDTISLAHGESITITGLPENLEYQVKEIMDSAQGYSVESTGESGTISSKKDR
TAAFTNTKIAESTGSLRIKKKVTGEGGDLSQKFDFRVTFDGASEAYPYTGDRNGTLRSGD
MISLAHGESITITGLPEGTKYSVTEADYTEQGYYPSATGAKGTVSVNRVQEASFNNRWSE
TPIESEIPMEPEIPKGPEVPTDPNKPTDPKAPAEGETLENIGDGGVPTGFMEDDGRKDMP
KTGDNQVGNFGRQGLVLFSLALAAISTSYYVIRKKQS
NT seq
4794 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaaatgcagttgctaatgagttggctgttatttctggtaatgacgctcaat
ttgctttctccccccagggaggtgtatgctgcactcaacgtagaaccattgactgatttt
acatcccaagtgcgccaaagcggggttgaaattcaagaagggggtacattgaaaaacgac
gaatccatttcagttgagatttcctttggggtaccggttctaggggatgaacccgagcca
gccaaccccgttcaaaaaggggatagtataagtattgagctgagtgaatctttcaagttg
atttccagccacaatatccctttaaaaatgggggacattttggttgggcatgtgaatttc
accacggatccttccacccaaatggtggtagccaatgttatctttgatggagatgatgaa
gtttttgatggaacatctaatacagtaaaatgtagattcgaagctagctttgaatatgat
ggcagtggccaggcgggggaggaaggagatcacgttgtttcaatgcttgaaaaaacgttt
accgttcatattccacccgctgagattttttatgaagtaacaaagtcaggaaatcttgac
ttacaaagtaaaaccatccaatggaccgttgacttgtcagctaaacaaggtggggcggat
attagtttagagggctaccaattctttgatgacctgagcacagttggggaatacataccc
aactcatttacagtggatggtgtctcggatacaccaatcatagaaggggactccatacga
tacagtttcccgggaaatgctcaaagccctcaaacaataacttttgagactgcaatccct
gataacctctattattcttctgattcgcaaagcatagtgaatcgggcacaacttcaggat
agcatgaatactgtccttgcggaagatgagtatccagtttcttttactcctcaatggata
gaaaaagaaggagcccccagcgactctggaagctcaggggtttatgatccaaagaatcgt
acaatcacttggaccattactgccaatcatatggaggctacattaaacaatgtggtaatc
acagatgtactgccaaatggattgacgttccaatctgcgaacttgaaaacttgggatggc
acaggatggcaagattggacagcgattagtcctaatgaagctggagagtatgaacttgga
acgattgattcaaaaatacttctaaccattgtaactagtgttcctgatgatgactataca
acgggcacaaaatccttcaagaattctgccaaaattcgctgggatggttcccctggtgag
atagcaacagatcctattgaggttggaattggctacaatgccattggaaagtcaggggtt
actaacacatcaacccgtagcgtaaaatggactgttaccgttgatactagaacacaggct
attccagacttaaaggtgtatgatcttctggtttatggggatagaacaagtggcttccat
tactcccagaccacagggcttcctgcaggcattgaaaatgaactttatcctcaattcgat
caaaaatatatcgatggttctttcagtggtacaggattaaatataacagttcatcccgtt
attcaagatgggaaggtagtagctgatctattggaaattaccgggtttaaaaacgatagt
ttgaacacttttacatttgatactatggttgtaaacccagatgtttttgcaggaaataaa
acatcagatgtttggaatgttgccagcctttacagtgcaaatactaagctaaacgaagct
actgatcgagttgattacacaagtaaattactatccaaagaaatgttagacagcagtgcg
acttctaatcccgccgctggtgtaaacagcgctatcaccaagaatgctaatgaaggattc
aattatgtggataagtcggttattttccgtttgagcattaatgctgatggtttcgatttg
actaatatgacaaatgctttaggccaaagtttaggggcagccactgtaacagataccttg
cctgaaggctgggaatttgaggagattatcccaggttctaacttcctaattttcgaggga
acgagtggttctagtagaacggtccaaggggttgattccattgcagatacagtggtaggc
ttgaatgctagtattagtggaagagaagctacctttacctttgatacactggacaagcct
tatgtgatactacttaaggcgaaacctactagcgaaactgtgtctgaatattttaacgca
aacaaaaccacaactgtgcggaataatttgaaattaagcaccgcaaattggacaccaggc
gtgtcaagttatcaagatgtgacgattcgtagcaagctgttagaaaaaacgttagataaa
ccacatgctggtgaattactttggacagtggattataaggcatatgaccttcctcagggt
tgcaccaagctgaatgatacccttccagcaggtattgatcttcggttggattccaaaggc
gaactaattctatcggacaacaatatttctattcacgaattgacattaaaggcagatgga
agctatgtactgggtaatgaggtagccttagtcaataatggaaatgttttgtatgataat
gcatcaagagttttgactttccgcattccagatagtacgaagtcatatcgttttagctat
attacagatattactggagacccgggaaccatatccaatacagtgtctttacatagtgga
gatggtaagcaggaacagaccggccacccttatgtgattacaactgcagatggcgaagct
acgctgcaaaggaatggctggattattattacaaaagaagatggcagtggggcaaccctt
tcaggtgctgaatttacattatttgcatcagatggaaaaacggtaattcgaaaaggcatt
actggtagcaatggtaccctcaggtttagagtaattcctgatggaaactatattcttaag
gaaacaatggctccactgggttacaccaaagataataagacccatacactttctgttact
accacgggctccacagtcgtttcctctattaatggaaagacaggaaaaggttctaatgcc
attacagtacaaaattatttggcgggcattgccggtgatttgacgataacgaaaaccgtg
gccggaaatgccgctgataaaaccaaaaagtttgactttaccgtaacctttgttggtgcc
aacggcacatataactacatcggcagcggtgtgcctgacgggacaataaaaagtggagac
acagtatcccttgcccacggtgagagtattacgattatgaaattgcctaaggatatttct
tatactgtaagggaagctgattactctaatgaagactattctactaccactacgggagat
aaaggcacaattttggctgacaccgtacagactgcatcttttgtaaatacaaaaagtgcg
ggttccttgaccattgtgaaatcagtgactggaaatgctgctgataaaaccaaaaagttt
gactttaccgtaacttttgttggtgccaacggaacatatgactatatcggtagtggtgta
cccaatggaacaataaaaagtggagataggatatcccttgcccacggtgagagtattacg
attatgaaattacctaagggtatttcttataccgttagtgaggctgattactctagtgaa
gactattctactaccagcacaggagaaaaaggtactattttggctgactccccacagact
gcatcttttgtgaatgggaaaaataaaaaacctacaggtggtggttcgggtggtggctcc
actggagagcttacaatcagcaaaactgtagtaggtgctgggaaagatatggacaaaaaa
tttaaatttaatgttacgtttaaaggatcttcagactcttatcagtacacaggaaatggt
gtatccggtggtacaattcagagcggtgacacaatttctcttgcccacggtgagagtatc
acaattactggtttaccagaaaacttagaataccaagtaaaagagattatggactccgct
caaggatattccgttgaaagtacgggggaaagtggtacgatttcctctaaaaaagatcga
accgctgcctttacaaatactaagatagcggaatctacaggcagtttaaggatcaaaaag
aaggttactggtgaaggtggagacttatcacaaaaatttgatttccgagttacttttgat
ggtgcatcagaagcatacccttatactggcgataggaatggtacactgagaagtggagat
atgatttcccttgctcatggtgagagtatcacgataacaggattacccgaaggcaccaaa
tattctgtaacagaggcagactatacagaacagggatattatccttcagcaactggagcc
aagggcactgtttccgtaaatcgtgtgcaggaggcatcctttaacaatagatggagcgaa
acacctatagagtcagagataccaatggaacctgagatacctaagggccctgaagtgcca
acagatccaaataaaccaacggatcctaaagcaccggcagaaggggaaacattggaaaac
attggagatggtggtgttcccactggttttatggaagacgatggaagaaaggatatgcca
aagacaggtgataatcaagtgggtaactttgggagacaaggcttagttcttttctcactt
gctcttgcggctatttctacttcttattacgtgatacgcaaaaaacaatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
