Amphiprion ocellaris (clown anemonefish): 111574806
Help
Entry
111574806 CDS
T06018
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
aoce
Amphiprion ocellaris (clown anemonefish)
Pathway
aoce04330
Notch signaling pathway
aoce04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aoce00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
111574806 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
111574806 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
EGF_3
NOD
NODP
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111574806
NCBI-ProteinID:
XP_023135349
Ensembl:
ENSAOCG00000006028
LinkDB
All DBs
Position
19:20845471..20874178
Genome browser
AA seq
2473 aa
AA seq
DB search
MEGNIPWIILSLLLFMYICEGFRCVDKYRPCENGGTCLDSPSRCICRPGFIGPLCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSQVLNGIPQYSCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGYQGKNCRNDIDECRKPGVCLNGGLCINTHGSFRCQCQPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTYCEIDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGTLCESNINNCQPDPCHHGTCVDG
IASYTCNCDAGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDLVNKYICQCQHGTSGRNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCREDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNINECASSPCMNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCSPNPCANHAVCTHTADYLGYQCKCQQGWQGQLCNTDINECISNPCKNRGT
CTNMRGGFTCACRAGYTGLTCETDINDCAPNPCQNGGSCTDGVNSFHCNCLPGFTGPRCA
LEINECQSSPCKNDGTCTDYVNSYTCTCKPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGVCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGFTGNRCQTPVDWC
RRSSPCQNGGRCRQKDASFICDCTNGWSGRYCDIPRVSCETAARQRGLQTDELCHHGGHC
VNTGNTHYCKCNSDYTGSYCESQVDHCEDKPCRNGATCRGYVGGYQCDCMPGYTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINVDDCDSPLRMRSAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGERCEGDINECLSNPCSPSNSLDCIQLPNDYQCICKPGFTGR
RCQSRFSVCESQPCQNGGACSLTSSSSLGYTCTCQLGYTGPNCERSMSCRELSCYNGGSC
ALTTRGARCTCLSGYGGPQCQRRSNEGCSSKPCHNGGMCTEETSFPFFQCQCQSGWTGKR
CEQKIDSVEPSIPSCPLADCHSKANDGVCDKECNTFPCRWDGGDCSLAVNPWARCPDRRC
WHVFNNSQCDESCNNADCLYDNFDCRTKEKVCNPIYETYCIDHFADGLCDQGCNTEECGW
DGLDCAAKVPENLADGVLVLVVLLPPEELLRTSTAFLQKLSAILHTSLRFRLDDNGEAMI
RPYTRREARLKRELQPQHEIIGSKVYLEIDNRLCSQGAEDCFPTADSAAEYLGALSAVEM
LRFPYPLKEAWSERMPTDPIPSWAKLILVGIASLFLLIILVIGMLIARRKREHSTLWFPE
GFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDSDCPEAKRLKVEEP
SMLSDSEDAVDCRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLML
ASFCGGGLEPEVAEEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAA
KRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAAR
LAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATVALLKNGANKDMQDLKEETP
LFLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQG
HGGPGHHLTGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSGLGGQHASSLKESVK
ARNKKLTLDMQSALLESSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHSSMS
VPNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQLNDLGAGGMSLQGRVSMASDVNHGYVLSSGQMGLNM
GMVSPVSVPFDWHNRMTPSSQCGQQVVNIVQSNQAAMHPQSQAMQQQNMLMHQQQIYRNA
MLQPTPVTSTPTISPVKLPSIAEQQQQQQQQQLMNHSITNQQSIARMGTSTPPTPQTSQP
PPSFFQQQQMSQQPSQSQPPAQPPQASTPTAQPAQALPSQPSGSTAGKEDYPTPPSQHSY
SSALDATPKHYLHLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAVPAQTQIT
QIPEANGKMQVFA
NT seq
7422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatattccatggattattctgtcactcttattgtttatgtacatttgcgaa
gggttccgttgtgtggataagtacaggccttgtgaaaatggagggacatgcttagattca
ccctctcgatgcatatgtcgtcctggattcattggccctctctgtcagcacctggatccc
tgtcatcgatcaccatgcctgaatggagcagcttgcaagagccaggtgctcaatggtatc
ccacaatactcctgtgtgtgccagagagggtttagaggccaagactgctctctcattgat
gcctgtgccacaagtccctgtgccaatggggcccgttgtgtcaattggaacaaccactat
aactgttcctgcccacctggctaccagggaaagaactgtcgcaatgacattgatgagtgc
cgcaagcctggcgtgtgcctcaatggcggcctctgcattaacacccatggctccttccgc
tgccagtgccagcctggatacagcgggcgcacatgtgaggtgtccacactgccctgcgcc
ccatctcagtgcctgaatggaggcacctgtcgacagaccagcgaccattcctatgagtgc
gcttgcctaccaggttttgagggacacaactgtgagaataatgtagatgactgtccaggt
cacaagtgtatgaatggaggaatatgtgtggatggagtcaatacctacaattgccaatgt
ccaccagaatggacagggcaatactgcgctgaagatgtcaatgagtgtctcatgcagccc
aacgcctgccataatgggggtacatgtttcaacaccattggtggccatacctgcgtttgt
gttaatggttggactggagatgactgcagtgagaacattgatgactgtgcgatagctgtt
tgcttcaatggtgccacctgccatgatcgtgtagcatcctttttttgcgagtgcccagtt
ggaaagacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcatgtgtgagcaacccctgcaatgag
ggtgcagtgtgtgacaccaatcctcttaatggccgtgccatatgcacctgtcctgctggc
tttgttggaggggcctgcaaccaggacatggatgaatgttcaattggggcgaacccatgt
gagcattttgggaaatgtgtgaatacagagggctccttccagtgtcagtgtggtcgggga
tatgccggcccacgttgtgagattgacatcaatgaatgcttgtccatgccctgccaaaat
gatgccacttgcctggaccgcattggagagttcacctgcatctgcatgccaggctacatg
gggacttattgcgagattgatgtagatgactgtgagagcaacccatgcgtgaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaatggcttcacatgcacctgccagccaggctttactggcacc
atgtgtcaaatcgacatagatgagtgcgccagcacgccctgccagaatggagcaaaatgc
tacgaccgacccaatgggtttgagtgccgctgtgctgaaggttatgaagggacactctgt
gaaagtaacatcaacaactgtcagcccgacccatgccaccatggtacttgtgtagatggc
attgctagctacacctgtaactgtgatgctggctatacaggttatcgctgtgagaatcag
ctcaatgagtgccacagcaacccttgtcagaatggaggcaagtgtgtggatcttgtcaac
aagtacatctgccagtgccaacatggaacctcaggcagaaactgtgaaataaactttgac
gattgtgccagtaacccctgtgactatggcatttgcaaagatggcatcaaccgttatgac
tgtgtttgcaaacctggcttcactggtcccaaatgtaatgtggaaatagatgagtgtgca
tctagcccctgcagaaatggaggaacatgtgtggatgaagagaatggatttcactgtcaa
tgtcctgagggtttcaagcccccttactgctactctcaggtggatgagtgcggcagcagc
ccatgtgtccatggctcatgcagggaggacatcaatggttaccgctgtgactgtgagccc
ggatgggtggggaagaattgtgatctggaccgaaatgactgtttgccaagtccctgccag
aatgctggcacatgcatcgaccagctcaatggttttacctgcaagtgtcgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaacgaatgtgcatccagtccctgtatgaacaaa
ggcacgtgtgtggacggcgtggcaagcttcacctgtctgtgtgagctcccttacagtgga
cccacctgtgctgaggtcctcaccccttgctctcctaacccctgtgccaatcatgctgtc
tgcacccacacagcagattacttgggttaccaatgtaaatgccagcaagggtggcaaggt
cagttgtgtaacaccgatataaacgaatgtatctcaaacccctgcaaaaaccgcgggacc
tgcactaacatgcgtggaggcttcacgtgcgcttgcagagcaggatatactgggctgact
tgtgaaacagacatcaatgactgtgctccaaatccctgtcagaatggaggatcttgcaca
gatggtgtgaactccttccactgtaactgcctgccaggcttcacggggccccgctgtgct
ttagagatcaatgaatgtcagagttccccctgtaagaatgacgggacatgcacagactat
gttaactcgtacacctgcacctgtaagcctggttttactggcattcactgtgaaaccaac
atccctgattgcaccgaaagctcctgcttcaatggaggggtatgcacagacaaaatcaat
ggctactcctgtacctgccgctctggcttcaccggctcccactgccagtatgaagtcaat
gagtgtgattcccagccctgcctcaacggaggcatctgtcaagatgccctggagtccttc
cgttgctcctgccccaagggctttactggcaaccgctgccagacaccagttgattggtgc
aggcgctcatctccgtgccaaaacggaggacgctgtcgtcagaaagatgcatctttcatc
tgtgattgtaccaacggctggtcaggacgttactgtgatatcccaagagtgtcctgtgag
acagctgctcgccagagagggctccagacagatgagctatgccaccatggtggtcattgt
gtcaacactgggaatacccactactgtaaatgtaattctgactacactggcagctattgc
gaaagtcaagtggaccactgtgaagacaaaccttgtcgcaatggcgccacctgtagggga
tatgtgggagggtaccagtgtgattgtatgccaggttatactggacagaactgcgagata
gaaatcaatgagtgccagtctcatccgtgccagaatggaggcacatgcattgatctggtg
ggacattatatctgctcctgcccccccggaacattgggtgttctctgcgaaataaatgta
gatgactgtgactcacccttgaggatgcgcagtgctcctcctaagtgcctgaacaatggc
acctgtgtggacagagtgggtggatatcgctgcaattgtccccctggtttcacaggagaa
agatgtgagggagacataaatgaatgtctctctaacccctgcagtccttccaacagtctt
gactgcatccagttgcccaatgactaccaatgcatctgcaagcctggctttacaggtcgg
aggtgtcagagcaggttcagtgtttgtgagtctcagccttgtcagaatggaggagcctgt
tctctaaccagcagttcttccctcggatacacttgcacgtgtcaacttggttatactggg
ccaaattgtgaaagaagcatgtcctgtcgggagctgtcctgctataatggaggtagctgc
gcacttaccacaagaggggcgcgttgtacctgcctgtcaggttatggtgggccccagtgt
cagcgtcgcagcaatgaagggtgctcctccaagccttgccacaatggaggaatgtgcact
gaagagactagcttcccattcttccaatgccagtgtcaaagtggctggacaggtaaacgg
tgcgagcagaagatcgacagcgttgagccttcaataccctcatgtcctctggcagactgt
cactccaaagccaatgatggtgtttgtgacaaggaatgtaacacattcccttgtcgctgg
gatggtggcgactgttctctagcagtgaacccctgggctcgttgtccagaccgtcgctgc
tggcatgtcttcaacaacagccagtgtgatgagtcctgtaacaatgctgactgtctatat
gacaactttgactgcagaaccaaggagaaagtttgcaatccaatatatgaaacctattgc
atcgaccactttgctgatggactctgtgaccaaggctgcaacacagaagagtgtggctgg
gatggcttggactgtgcagcaaaggttccagaaaaccttgctgatggtgtcttggttttg
gtagttctactgcctcctgaggagcttctccgtaccagtacagctttcctgcagaaatta
agcgcaatcctacacacttcactgcgcttcaggctagacgacaatggagaggccatgatt
cggccttacacccgccgagaagcacggctcaagcgggagctacagcctcaacatgagatc
attggttccaaagtctacctggaaatagacaaccgtttgtgctctcaaggcgccgaggac
tgtttccccacagctgacagtgctgcagagtacctgggagccttgtcagcagtggaaatg
ctccgtttcccttatcccctcaaagaagcttggagtgaaaggatgccaactgaccccata
ccgtcctgggccaagctgattctggtggggattgcttctcttttcctcttgatcatcctt
gtgataggcatgttgattgctcgtagaaagagagaacacagcaccctttggttccctgaa
ggcttcttcctcaaaaaggaacccagcagcaacaagaaccgtagggaacctgtaggccag
gatgctctgggaatgaaacacatgccaaaaactgtggaggaatctcttcttggagatcat
agtgaccagtggatggactcggattgcccagaagcaaaaaggcttaaggttgaggagcca
agtatgctctcagacagtgaagatgcagtggactgcagacagtggacacagcatcacctt
gcagccgcagacatccgggtcccacccaccatggccctcacgccacctcaaggagagttt
gaaagtgactgcatggatgttaatgtccgaggcccagatggttttacacctttgatgctg
gcatcattctgtggaggcggtttagagcctgaggtagcagaggaagaggagaatgaggag
tgctctgcaaacataatctctgacctgatataccagggtgcatcccttgctgcccaaaca
gaccgcactggtgagacagcactccacctggctgctcgctacgcccgtgctgatgctgct
aagaggctgctggatgccggggcagatgccaatgctcaggacaacacagggcgcacccca
cttcatgctgcagtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattctcatccggaatcga
gccacagatcttgactctcgtatgtatgatggctccactgcactgattctggctgcgcgg
ttggcagtagagggcatggtagaggagctcatcacttgtcatgctgatgtcaacgcagtt
gatgaattgggtaaatcggccttgcactgggctgctgctgttaacaatgtggatgccact
gttgccctgctaaagaatggcgcaaacaaagatatgcaagatctcaaggaggaaaccccg
ctgttccttgcagcccgtgagggcagctgtgaagctgtaaaagtgctgctggctcacttc
gcaaacagagaaattacagaccatatggacaggttgccaagagacattgctcaggagcgc
atgcaccatgacattgtgcagcttcttgatgagtacaacacagtaaggagtccccagggc
catggagggcctggacaccacctcacaggggggcacactctgtctcctctcatgtgccct
cccagtgccttcctacctagtctgaagaacaccccacaaggcaagaagaaccgtcggcct
ggggccaagggttctggcctgggaggccaacatgcttccagcctgaaggagtcagtgaag
gctcgcaataagaagctgaccctggacatgcagagcgccttactggagagctcagttact
ctgtccccagtcgactcactggactcaccacacggtggagccagcaatgctggctacatc
accaaccccacttcgcctgtggccatgcagtcaccagggcttttccactcctccatgtct
gtcccaaacaccccaatggtacacagtagcatgttggagggaggtggcccctttgctgtg
tctctagcccagctcaatgacctgggagctggaggaatgtccttgcagggacgtgtctct
atggcttcagacgtcaaccatggctatgtgctgagttcaggccagatggggctcaacatg
ggcatggtcagtcctgtcagtgtgccctttgactggcacaaccggatgaccccctcctcc
cagtgcggtcagcaggtagtgaatattgtgcaaagcaaccaggcagccatgcacccccag
agtcaagccatgcagcagcaaaacatgctgatgcaccaacagcagatctaccgtaatgcc
atgctgcagccgacgcctgttacctccacacccactattagcccggtgaagttgccttcc
attgctgagcagcagcaacaacagcaacagcagcagctcatgaatcacagcatcaccaac
caacaaagcattgcccgcatgggcacctccaccccgcccacaccccagacctcacagccc
ccaccgtccttcttccagcagcagcagatgtctcaacagccttctcagtcccagcctcct
gctcagcccccacaggcatccacgccaacagcccagcccgctcaagctctgccctcccag
cccagtggcagcactgcaggaaaagaggattatccaacccctccctcccagcacagctat
tcatccgcactagatgccacgcccaagcattacctccatttgcctagtgagcacccatac
ctgaccccctctccagagtctcctgagcactggtccagtccttctccccactgtgtctct
gattggtcagattccacacccagcccagcagttgctgtccctgcccagacccaaattacc
caaattccagaggccaatggcaagatgcaggtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
