Alkaliphilus oremlandii: Clos_0100
Help
Entry
Clos_0100 CDS
T00607
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat
Organism
aoe
Alkaliphilus oremlandii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW17670
UniProt:
A8MFN1
LinkDB
All DBs
Position
128668..129990
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MDYKNDHRYSRWNGSGNCNCGHCRQCIICLGGITGATGPTGPTGATGPTGPTGTTGATGS
TGPTGSTGATGSTGPTGPTGPSGGPAGPTGPTGPTGITGPAGATGPTGATGVNGVTGATG
PTGATGANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTGPTGATG
ANGVTGATGPTGATGADGVTGATGPTGATGADGVTGATGPTGATGADGVTGATGPTGATG
ANGVTGATGPTGPTGSTGATGPTGATGAAGDGAIIPFASGVTPAVLTTVLGSVLNTGSIV
GFGSNITGVSGLGGAINITLIGDLAFNVPRDGILDSLSATFNVTVGLSLIGSTVTVSATV
YSAPAGSNSFTPVPGATVNLVPAYTGLISVGDIATGSISGINFPVTTGMRLMLVFSSAIT
GGLDIASTLTGQASGGIGIS
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattataaaaatgatcatagatactcccgttggaatggaagtggaaattgtaattgt
gggcattgtagacaatgcattatatgtctaggtggaataacaggagcaaccggtccaact
ggcccaactggagcgacaggtcctacaggtccaactggaactacaggagcaacaggttcc
acagggccaacaggttccaccggagcgacgggttcaacaggtccaacaggtccaacaggt
ccatctggaggtccagcaggtccaacaggtccaacgggtccaactggtataacgggaccg
gcaggagcaacaggtccaacaggtgcgactggggtcaatggagtaacaggagcaacaggt
ccaacaggtgcgactggggccaatggagtaacaggagcaacaggtccaacaggtccaaca
ggtgcgactggggccaatggagtaacaggagcaacaggtccaacaggtccaacaggtgcg
actggggccaatggagtaacaggagcaacaggtccaacaggtccaacaggtgcgactggg
gccaatggagtaacgggagcaacaggtccaacaggtgcgactggggccgatggagtaacg
ggagcaacaggtccaacaggtgcgactggggccgatggagtaacaggagcaacaggtcca
acaggtgcgactggggccgatggagtaacaggagcaacaggtccaacaggtgcgactggg
gccaatggagtaacgggagcaacaggtccaacaggtccaacaggttccactggagcgact
ggtccgaccggtgcaacgggtgcagcaggagatggagctattatcccatttgcttctgga
gtaacacctgccgttttgaccactgtactaggtagcgtattgaacacaggtagcatcgta
ggttttggttcaaacataacaggtgtaagtggtctgggtggtgcaattaatattacgcta
attggtgatctagctttcaatgtacctcgtgatggtatattagactccttatctgcgacc
tttaacgtcactgttggcttgagtttaattggatctaccgttacagtttctgcaacagta
tattctgcaccagctggaagtaactcctttacaccagttccaggagcaacagttaatctt
gttccagcttatacgggtctgatttctgtaggagatattgctacaggttcaatcagcggt
attaatttccctgttacaacaggtatgcggttgatgcttgtattttcttcagctattaca
ggtggtcttgatatagcatctacgttgactggtcaggcaagtggcggtattggaatcagc
taa
DBGET
integrated database retrieval system
