Asparagus officinalis (garden asparagus): 109843528
Help
Entry
109843528 CDS
T05243
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC109843528 isoform X1
Organism
aof
Asparagus officinalis (garden asparagus)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
NAD_binding_8
PP-binding
Hexapep
Amino_oxidase
AMP-dom_DIP2-like
Catalase
Pyr_redox_3
DAO
Thi4
GMPPB_C
FAD_binding_3
Pyr_redox_2
FAD_binding_2
GIDA
FAD_oxidored
ACP_SdgA_C
Pyr_redox
HI0933_like
DUF6708
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109843528
NCBI-ProteinID:
XP_020268051
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(60642564..60654843)
Genome browser
AA seq
2317 aa
AA seq
DB search
MDSRKSIDDQFSKLHPCLPVRTRIGIIGAGPSGLAAAYALAKLGYSNVCVLEKHHTVAGM
CESVDIGGRVYDLGGQVIAANSAPTITHLANEIGAEFEEMDAHKLALIDRCTGNYKDLQV
ADDYVSLISLTLKLQDEANKSGKIGIHALSNAASDPTLDFVKLHGLKSVPKSVAYGYTAS
GYGFVQDMPYAYIHEFTRTSMAGKIRRLRGGYTSMWQKLSLSLPFEVLCSTEVLKISRIA
DCVHVMVRDADGEEKLMEFDKIILSGSLAFRNRRVYRSSSTLEVLENEVVEFNGLERGLF
GEVQTIDYYTTVLKVKGFEHLPMGFYYFEEFMEDPTTIGNPVAMQRFYADTGVFLFWSYG
DSVKIRGPMVTKLVIDAVESMGGVVEEVVLQRRFKYFPHVNAENMKNGFYEKLESELQGF
QNTYYVGGLLAFELTERNSSYSIAMICKHFANDNAVPKFPYVKRLFPLVSNNKPRYPRDL
GELPGIKFPNLPSLDSYLKFWGTNEITKNATLYTWINEEGKVVNKRSYGEVHSNASLVAY
KLLTSSKPVLKPGDRVLLVYLPGLEFVDAFFGCLRARIIPVPVLPPDPLQRGGQALLKIE
NISRSCNAVAILSTSSYHAAVRAGFVKSMIMLSKSNQKSSAQWPDLPWIHSDSWVKNFKD
LAVDSKENLSDLQANDLSFLQFTSGSTGEAKGVMITHGGLIHNVKMMRRIYRSTSRTVLV
SWLPQYHDMGLIGGLFTALVSGGTAVLFSPMTFIRNPLIWLKTMSDYQATHSAGPNFAFE
LVLRRLEADNGKDKPRTYDLSSIIFLMVAAEPVRQKTLKRLIEITRPFGLSQEVLAPGYG
LAENCVFVSCAFGEGRPIFIDWQGRVCCGYVNPGDPDVEIRIVEAETDRELEDHGKEGEI
WVSSPSAGIGYWGNEVQSQKTFYNKLQNCADKKFTRTGDLGRIIDGKLFITGRIKDLIIV
GGRNIYSADVEKTVENSSELLRPGCCAVIGVPEEVLSSKGITFPDASDEVGLVVIAEVRE
GKPVNKDVVEQIKTKVAEEHGISVASVKLIKPKTICKTTSGKIRRFECLKQFVDGTLAMA
ADPASAKKSLFRSFTTGSHRDRRELRLIHNRTPSHSIEPVNSEKDMKEITDFLRDLVSAQ
TGISIEKISATESLVSYGIDSIGVVRAAQKLSDYLGVPVGAVDIFTATCISDLASFSQNL
LKKSKPQYATLLEVNKDLDFVLPNIEKTGLQKLGMGALQLLALIYASSLLIVPAYLSSNM
QLNLVSVTSTETNLLPMYIFSFFLAPFAWIFYVILTCISLSLFGKPFLQPNYILTPEVSI
WSVDFVKWWALNKAQEAAGKMLAVHLRGTVFLKHWFEMQGAQIGRSVLIDTIDIMDPSLV
SIGEGAVIAEGVLIQSHEVRNGVLSFLPVKIGRNASVGPYAVLQKGSLVGENSEVQPLQK
IVEGNPVQKSGNAAKIQQKDTLIEYLSPFYQFMGIYGVGLLSALSGAILYLLYIFWFQSP
LSLHHFTFVCLASVFHWLPATLAAYAAIIKDVPSYPLVFAFYFAFAYITHGFILSLLTAI
SSQFLAGKHGTEQTHFRTWFRQRINISCHLRFARLLSGTEAFCMYLRLFGAKIGRHCSIR
AINPVANLEQISIGDGVHLGDFSCIVPGFYSSAGFTSGEIVVNRNSVVGSQSLILPGSVI
QEDVVLGALSIAPMNSVLVRGGIYVGSETPTMVKNMLVASDKRIDEMDTQYKKILGNLAG
NLAITTMKVNSRYFHRMGVGGRGVLKIYSDLPGVPTHKIFRAGKCHNVTIRHSNSLSADD
DARIDARGAALRILQDESLTPLLDLTLKTGKAFYARTIAEFAAWLVCGLPAREQQVKRAP
HIRDAVWGSLRNADSYTELHYYSNFCRLLRFDDGKEMYVKFKLRPFDSRISEDAGKVEPK
GILPPETGAIPREENDTRPLLFLADDFRRRVDSPDGVRYVFQLQIRPYVSSDKSDQEVAL
DCTRPWDEMEFPCMDIGEIIINENLSAEETEELEFNPFLKCPEVDVIPATSCTESASIDH
GRSLVYEICQHIRNRVPLPASWRGFLEQSDAKVDLSGCPMAAAVLTENKSDGRKLTLARN
WYQTLWATLCQPLLQTFVPYFTLCLVIFLPLKWMLLLKEEKKLPLHWMLPFFWVCSGIMA
SLVCVVMKWILVGRKKGGQSVQMWSFGVFMDTVWQALRSLVGEFFMEMTCGSLLFVSWMK
LMGANVGIGEGVYINSMGAMLNPEMVDIERFGSVERQAILFGHIYEGGGRVKFGKIMVEE
GGFIGSRAVVMPGVRVENGGDLGALSLAMKEEVVRSR
NT seq
6954 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcaagaaaatccatagatgatcagttctccaagttgcatccatgtctgcctgtg
agaacaagaattggcataatcggtgctggaccaagtggtttagctgctgcttacgctctt
gctaagcttggctatagtaatgtatgtgttcttgagaaacatcatacagttgcaggaatg
tgcgagtcagttgatattggaggaagggtttatgatttgggcggtcaagtaattgccgca
aacagtgctcccactataactcacttagcaaatgaaattggggcagaattcgaagagatg
gatgcacacaagctagctcttattgatagatgcactgggaattataaagacttacaagta
gctgatgattatgtttctctcatttccctcaccttaaaactacaggatgaagcaaataaa
tctggtaaaatcggaattcatgcactcagtaatgctgcttcagatccaactcttgatttt
gtcaagctccacggtttgaaatctgtgccaaaatcagtggcatacggatacacagcctct
ggttatggatttgttcaagacatgccatatgcatatatccatgagtttacacgcacttcg
atggctggaaaaattcgccgcctgagaggaggttacacaagcatgtggcaaaagcttagc
ctttctctaccttttgaagtcctctgtagcacagaagtgctgaaaatcagccgtatagct
gattgtgtacatgtaatggttagggatgctgatggtgaagagaaactgatggaatttgac
aaaatcattctctctggttctcttgctttcagaaatagacgggtttacaggtcatcttcg
actttagaagttttggaaaatgaggtggtagaatttaatggacttgaaagggggttattt
ggcgaggttcaaaccatagattactataccactgttctgaaggttaagggatttgagcat
ttgcctatggggttttattactttgaggaattcatggaggatcctacaactataggaaac
ccagtggcaatgcagaggttttatgctgatactggtgttttcttgttctggtcttatggt
gactctgtaaaaattcggggaccaatggtaaccaagcttgtgattgatgctgtggagtcc
atgggaggagtagttgaggaagtagttttacagcgaaggtttaaatacttcccgcatgtt
aatgctgaaaatatgaaaaacggtttttatgaaaagttggaatctgaactccaaggtttt
cagaatacttattatgtaggaggtcttttagcctttgagttgacagaaagaaattcttct
tactccattgctatgatctgcaaacattttgcaaatgataatgctgtgccaaagttccca
tatgtcaagagattgtttcctctggtctccaataacaagcctcgttaccccagagatcta
ggtgaactcccaggaataaagtttccaaacctgccttctttagacagttacctaaagttt
tggggaactaatgaaatcactaagaatgccactctctacacttggatcaacgaggaaggg
aaggttgtaaacaagaggtcttatggagaggttcactccaatgcatcccttgttgcctat
aaactcttaacaagcagcaagcctgttcttaaacctggtgatagagttcttctggtttat
ctccctggtttggagtttgttgatgccttctttgggtgcctgagggctagaattattcca
gtccctgtgttaccccctgatccactgcaaagaggtggccaagcactactgaagatcgaa
aacatttcaagaagttgcaatgctgtggcaattctatcgacatcttcttaccatgcagcc
gttcgtgctggctttgtgaagagcatgataatgctttcaaagagcaaccagaagtcttct
gctcagtggcctgatcttccctggatccattctgattcatgggtcaagaattttaaagac
cttgcagttgactccaaagaaaacctctcagatctgcaggcaaatgatttgagtttcctt
cagtttacatctggctcgactggcgaagcgaagggggtgatgatcacccatggtgggctt
atccataatgttaagatgatgcggaggatatataggagcacttccagaactgtattagtc
agctggcttcctcaatatcatgacatgggattgataggaggccttttcacagctttagtg
agtggagggactgcagttctcttctccccgatgacatttatcaggaatcctctcatctgg
cttaagactatgagtgattatcaagcaacccacagtgccggtccaaacttcgctttcgag
ctagtgcttagaagattggaggcagacaacgggaaggataaaccccgaacctatgatctt
tcttcaataatttttcttatggttgcagcggaaccagttagacagaaaaccctgaaaagg
ttaattgagattacccgtccttttggtctatctcaggaggtgctagctcctggttatggt
ctcgcagaaaactgcgtgtttgtaagctgtgcttttggtgaagggaggccaatcttcata
gattggcaaggtcgtgtttgctgtggatatgtgaatccaggtgaccctgatgttgaaata
agaattgtcgaggcagaaaccgatagagagctcgaggatcacggaaaagagggagagatt
tgggtaagtagccccagtgctggaattgggtattggggcaatgaagtacagagccaaaag
acgttctacaacaagcttcagaactgcgctgacaaaaagttcacaagaacaggagaccta
gggaggattattgatggaaagctgttcattactggaagaataaaggatctcattattgtt
ggaggacgaaatatatactctgctgatgtagaaaaaactgttgaaaattcttcggaattg
cttcgtccaggttgttgtgctgtgattggtgtcccagaggaagttctgtcttcaaaggga
ataacttttccagacgcttcagatgaagttggtctagttgtgattgctgaggttagggag
gggaagccagtaaacaaggacgttgtcgagcaaatcaagacaaaggtagctgaagagcat
ggtatttctgtagcttctgtgaagctgatcaagcccaaaactatctgcaagacaacttca
gggaagatcaggaggtttgaatgcttaaaacagtttgttgacgggacactggccatggca
gctgatccagcttcagctaaaaagtctctttttcgatctttcactacaggtagccacaga
gatagaagggaattacggctgatacacaacagaactccttcccattctattgaaccggtt
aattctgaaaaggatatgaaggagatcactgatttcttgagagatttagtgtcagcgcaa
acaggcatttccattgagaagatatcagcaacagaaagccttgtctcctacggaattgat
tcgattggagttgttagagcagctcagaagctgtcagattatcttggtgttccagttggt
gcagtcgatatctttacagcaacttgcatttcagatttagctagcttttctcagaatctg
ctgaaaaagtctaagcctcagtatgctactttgctagaagttaataaagatttggatttt
gtcctaccaaatattgagaagactggattacagaaattgggtatgggagctctccaactt
cttgcacttatttatgcttcttccctcttaattgttcctgcatatctttcgagtaatatg
caattgaacttggtctctgtaacgtctacagaaactaatctactaccgatgtacatattt
tcttttttccttgctccttttgcttggattttctatgtcatcctcacttgcatttctcta
tccctatttggaaaacctttcttgcaaccaaattatattttaaccccagaggtctctata
tggtctgttgatttcgtgaagtggtgggcactcaacaaagctcaagaagctgcagggaaa
atgttggctgtccatctacgtggaacagtatttttgaagcactggtttgagatgcaggga
gctcagataggccgatcagtcttaatcgacaccattgatatcatggatccctcactagtt
tcaattggagaaggggctgtaattgcagaaggggtgttgattcagagccatgaagtgaga
aatggggtcttaagcttcctcccggttaagattggtcgtaatgcatcagttggaccttac
gctgtccttcagaaagggagcttggtgggagaaaattctgaagtccagcctctccagaag
atagtggaaggaaaccctgttcaaaaatctggaaatgctgctaaaattcaacagaaagat
acactgattgagtacctttcaccattctaccagttcatgggcatttatggagtcggtctc
ctcagtgctctttctggtgctattctttatttgttgtatatcttctggttccaaagtcct
ctatcactacaccactttacatttgtatgccttgcatctgtcttccactggttaccagcc
actcttgctgcatatgctgctatcattaaagatgtgccgtcatacccattggtgtttgct
ttctactttgcttttgcgtacatcacccatggcttcattctcagtcttctcactgctatt
tcaagtcaatttcttgctggaaaacatggaactgagcaaacccatttcagaacatggttc
cgccaacgcattaacatttcttgccatcttagatttgccaggctcctctcggggactgaa
gccttttgtatgtatttaagattatttggggccaaaatcggtcgtcattgttctattcga
gccatcaatccggttgccaacctcgaacagatctccattggtgatggcgtccacctgggt
gattttagctgcattgtgcctggattttattcctcagcagggttcaccagtggagaaatt
gtggtcaacaggaattcagtggttggaagtcaaagtctcattctccctggctcagtaatt
caagaagatgttgtccttggcgctctttcaatcgcacccatgaactctgttctcgttagg
ggcggcatctatgtaggttctgagacccccactatggttaagaacatgttggttgcttca
gacaaaaggattgatgaaatggacacccaatataagaaaattcttggaaatcttgctgga
aatttagccatcacaaccatgaaggtcaactcaaggtatttccaccgaatgggtgtgggt
ggtaggggagttcttaagatttattctgatcttcctggagttcccactcacaagattttt
cgtgctggcaagtgccacaatgttactatccggcatagcaacagtttgagtgctgatgat
gatgctaggattgatgctcgaggcgctgctctgagaattctacaggacgagtcattaaca
ccacttcttgacctgactcttaagacgggaaaagcattctatgcaagaactattgcagag
ttcgccgcttggctggtttgtggcctccctgcaagggaacaacaggtgaagagagctcca
cacatccgtgatgctgtctggggatcactgagaaatgccgactcgtacacagaattgcat
tactactctaacttctgccgacttcttcgttttgatgatggtaaggaaatgtacgtgaaa
tttaaacttcgcccttttgattcgagaatcagtgaggatgctggtaaggtggagcctaag
ggaatacttcccccagaaaccggtgcaattcccagggaagaaaatgacacgcgtcctctt
ctgttccttgctgatgactttcgccgacgtgtggattctcctgatggagttcgctatgtt
ttccagctacagatcaggccttatgtgtcatctgacaaatccgatcaagaagtggctcta
gattgcacaaggccatgggatgaaatggagttcccttgcatggacattggtgaaataatc
atcaacgagaatctttctgctgaagaaacagaggaactcgagttcaacccattcctcaag
tgtcctgaggttgatgttataccagctacatcttgcactgagagcgcatcaattgatcat
ggtcgctcactcgtgtatgaaatctgccagcacatccgcaatagagtgccacttccagca
tcatggcgaggattccttgagcagtctgatgccaaggtggatctctctggttgtccaatg
gctgcagctgtgttgacagagaacaaaagtgacggtcgcaaattgacactggccagaaat
tggtatcaaactctctgggctacactttgccagccattgcttcagacgtttgtgccatac
tttaccctctgtttggtgatctttctgccgctgaaatggatgctattgctaaaggaagaa
aagaagcttccactacactggatgctgcctttcttctgggtctgttcaggaatcatggct
tctctagtctgtgtcgtgatgaaatggattcttgtggggaggaagaaaggtggtcagtca
gtgcaaatgtggagctttggagtcttcatggacacggtttggcaagctttgaggagtttg
gtcggcgagttcttcatggagatgacatgtggttcacttctgtttgtttcgtggatgaag
ctgatgggcgcaaatgtgggtattggagagggagtgtatataaatagtatgggggcaatg
ttgaacccagagatggtggatattgagaggtttgggtctgtagagaggcaagcgattctc
tttggacacatttatgaaggaggagggagagtgaaatttgggaagattatggttgaggag
ggaggttttattgggagtagggctgtggttatgcccggtgtgagggtggagaatggagga
gaccttggtgctctctcacttgcaatgaaggaagaagttgtgaggtctaggtga
DBGET
integrated database retrieval system