Anastrepha obliqua (West Indian fruit fly): 129249214
Help
Entry
129249214 CDS
T09777
Name
(RefSeq) protein rotatin homolog
KO
K16484
rotatin
Organism
aoq
Anastrepha obliqua (West Indian fruit fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aoq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
aoq03037
]
129249214
Cilium and associated proteins [BR:
aoq03037
]
Primary cilia and associated proteins
Other primary cilia associated proteins
129249214
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RTTN_N
IL34
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129249214
NCBI-ProteinID:
XP_054744875
LinkDB
All DBs
Position
5
Genome browser
AA seq
1989 aa
AA seq
DB search
MSLQLDHATVRKLSHESSEIRLRTLEQIWNKLSRALEHNEQLQFKAGDLCKQLIRWFGFQ
PLCAVSRVLKLLLLILRSNYSEEAIQQLGVERFKKEIEKVKLLLKKHPTESQAVDEINRL
LSEYQENQMKDETDKVTEAFNLLSLPATGEVGCAKYEKLISHFEPTDFEQVWSKPTPADF
TALSFIADLLTTDIGKVEMRNALLHLEITMQDYPAEYMLQAPHVFLALMHLFRFDDDIES
KSVLEDVARPINAYLKLLLARLKLRCNVSAYSIDTTISKTLGNTQLKISTVLREVFEKGV
KLLEICVREFRKEARQIFEILNNCMELYRNQRLLIDAYILKKLNKIILNFQVCFEKDEHF
TLQRINCLLIICLLDDALLHNSKMQSYKDDSQMLEFLLRDYTFKENFPQRYKNIQLRVQK
NVGRYQKLERYDNCFRAAVSLLQHPQDFESARIIINGPDICIALENLKSVKLVEHIISAI
IDCNALYVSQPELRAKANHLLILLLRLKHEPLRTYVYKMLAMAIKRHFACLMESERYCIG
LTHEQLLDSQVLGIPLSSEFLLNLIYECGEGARESIRKISEDILMLILKSQNLVGEYWAK
YVELLLPVLSLLQCCTKSPQIIKLLQNLLDPDSKQLPFLAVLQGNITFMFYHDSTVRNEA
LTRLIYMMNSVPEAEKYVPNLLYISDIIPNDLCILKKPRVYQGIFVDATDFCERETLHNL
LSLLEMPDVDPVIRKTTLMQLNVMCQQWHNLAAFCEESAHYLILRALENSLLAASYEDYT
GAAIPAIGVLCKVLLYDAAVRRELSETPNMYVLLLRALCLYQNDIQLRQDACICLFLLLY
ANFLVVLGNQRVEAPRLLSHLEIPLNCEFQSFEQGSISFAEYNSVFESKLEETLYVRHLL
AHSFCDKQIPIPKLYLQQQKSYDFDVDLQLTLRDWRLMNATIPKQNIQRFLRAMFNATNH
ESLMNASVSLQLQLLVRDQQSGTAATLMPDKLATELYSLIGKYLQLPPGNECDFDLFEEL
LDLCDLCVRLPLPAVSICLMEELIADFQHAMIALLKNTDLSLRLNWKLCTLLGNVVRAVK
SVNSRDKGDVRIFHSNLFELIFQLITQYFQKRDLHRVRCLLHLQKVLSAFDIDVLDEQLL
GYCRRFIKLSLALRSSTYTGAQWQIDCLTIVCQLYAQMEQPTHNFKLSDCTVKYLSGLCG
HCNRQVRALAWCILTYLSRYEERNDVRKSLTSGIDFIEKTLSYLPGGFMACCLCTFLDIG
ETNVVRQLAANLFTKFLSDNGKYNDAYELLTRHRFLPTADEAVRGTCVFEEQLPTQIDSN
SVISITSCELISLFCRICLRMLQINADFATDLCASDFMIRLYELLKVPSAQSNPAYYTMC
GDLCHLYGSCYSVNFVFLQRTLCRDHAWLMHFYQLLDQPLASDSVIVNVLQLLLVICKDN
LAYEKLCQKIAKAPEFLVKHFLRAFNVGNVDTPLQRCSLAALSLLLIKSQNKLPKHDERK
TFLTVLEDHIEIRDSTIIKEGRIACKTTNMDEIVSNRQCGDMSRDSSAYKIAPVDNEKIE
DIAMAGSTSSLPGVVRKSAAAFIFVELFRLFQHLYTVPACKFNTAPSKAQVQVGETLGVL
LGLSPEARLAANGLKLFDKITQIFTTFFEQFKCTATTYVRRYGESKKVALIKNFQLLLNI
HLHWFAAPDAALTDNSQSVALSKLTMQLWPWLPYSCELKELVLQVCTYHSEHSFVVCQQF
SSLFSGYAHSLLQLVIKLVVAETTKLKANKADDFPVISTGLRVVMNCCSCADGRITIIKA
HMLDMFDGLHPFHLKSPKVKAEILRSWLQFWELFSRYQEGAQVRNLRALCDVISRTSTQS
ATRVILLRILRNMCFLPSNRSAIMNSADFICVVDTIVAHPLDSKSTSNAVLECASYEEQL
IVCVGVWKLASAGVKYVALLRSTTLARHLRQLHEQLAALKDTDSKKFSSISFANDLLYVL
DVVLNIFNN
NT seq
5970 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgctacaactcgatcatgccacggtacgaaagctatctcacgaatcttcagaaatt
aggctgcgaactttggagcaaatatggaataagctgagtcgtgccttggaacacaacgag
caactgcaatttaaagcaggggatttatgcaaacaacttatccgttggtttggatttcaa
ccattatgtgctgtatcgcgagttcttaaattgttgctattgattttgcgttccaactac
agcgaggaagccattcaacagttaggcgtggagcgtttcaaaaaagaaatagaaaaagta
aaactattacttaagaaacatcccaccgaatcccaagcagtagatgaaataaatcgtttg
ctaagtgaataccaagagaatcaaatgaaagatgaaacggataaagttacagaagctttt
aatttgctttcccttcctgctacgggtgaagtggggtgtgctaaatatgagaagttgata
agccattttgaaccaactgatttcgaacaagtgtggtcaaaaccgacaccagccgatttt
acagcgctctcatttatagcagatttgttgacaaccgatattggaaaagtggaaatgaga
aatgcccttcttcatctggaaattacaatgcaagactatccagccgaatatatgcttcag
gcgccacatgtttttttggctctcatgcatttgttccgatttgacgatgacatcgaaagc
aagagtgtgttagaagatgtagctcgccctatcaatgcatacttgaagcttcttttagcc
cgtctcaaactgcgctgtaatgtaagtgcatattcaatagacacaacaatatcaaaaaca
ctcggaaacacgcaattaaaaatcagtacagtattacgtgaagtttttgaaaaaggtgta
aaactattggaaatttgtgtgcgagaatttcgtaaagaagcccgtcaaattttcgagatc
ctaaataactgtatggaattatatcgcaatcaacggctactcattgatgcatatattctg
aagaagttaaacaaaattattcttaactttcaagtttgtttcgagaaggatgaacatttt
acattacaacgaattaattgtctgttgattatatgcctactggacgatgcattactgcat
aatagcaaaatgcaatcctacaaggatgattcccagatgttggagtttctgctgcgtgac
tacacatttaaagaaaattttccgcaaaggtacaaaaacattcaactgcgcgtccaaaaa
aatgttgggcgatatcagaagttagagcgatatgataactgttttcgagcggcggtatca
ttgttacagcatcctcaagatttcgaaagtgcacgaattataattaatggaccagatatt
tgtatcgctttagaaaatttaaaaagtgtaaaactcgttgaacatataatcagtgcgatt
atcgattgtaatgcactttatgtatcacaacccgagttacgtgcaaaagctaatcacctt
ttaattctgctactgcgacttaagcatgagccactgcggacgtatgtctacaaaatgctt
gctatggctataaagcgtcattttgcttgcttaatggaatctgaacgctactgcattgga
ttaacccatgaacagttactagattctcaagtgttaggtataccgttgagtagtgagttt
ttactcaatctgatttacgaatgtggcgaaggagctagggaaagcattcgcaaaattagt
gaggatatacttatgctaatattgaagtcacagaacttagtaggtgaatattgggcgaaa
tatgtggaattattgttaccagttttgtcgttgttacaatgttgcacaaaatctccacaa
attataaagcttttgcaaaatttgcttgatccagattcaaagcaattaccatttttggcg
gtattgcaagggaatataacattcatgttttatcacgatagcaccgtgcgaaatgaagca
ttaactcgactcatatacatgatgaattcggtgccggaagctgaaaagtacgtgcctaat
cttctttatataagcgacataatacccaacgatttgtgcattttgaaaaagccgcgagta
tatcaaggaatctttgttgatgctaccgatttttgtgagcgagaaactttgcataatttg
ttgagcttgttagagatgcccgatgtggaccctgtgatacgtaaaacaacactaatgcaa
ttaaatgttatgtgccaacaatggcataatttggcagcattttgtgaggaaagtgcgcac
tatttgatactacgagcgctcgaaaactcattgctagctgcatcgtatgaagattacact
ggagctgcaattcctgctatcggtgtgctctgcaaagttttgctctatgacgccgctgtg
cgccgcgaactctccgaaacgccaaatatgtatgtgttactattacgagcactttgtctt
tatcagaatgatatacagttgcgtcaagacgcttgtatttgtctttttttactgctttat
gctaatttccttgtagtattgggcaaccaacgggtggaagcgccaagattgttaagtcat
ttagagataccactgaattgcgaatttcagtctttcgagcaaggcagtatttcctttgct
gaatacaatagtgtttttgagagcaaattagaagaaactttatacgtgcgccatttgtta
gctcacagcttttgcgacaaacaaatccctatacctaagctgtacctgcaacagcaaaaa
agctacgattttgatgttgacttgcagttaacgttacgcgattggcgtttgatgaatgct
acgatcccgaaacaaaatattcaacgttttttacgagcgatgttcaatgctacaaatcac
gagtcgttaatgaatgcaagtgtttcgctgcaactacagctgcttgtccgagatcagcaa
tctggtactgctgccacattgatgcctgataaactagccactgagctatatagtttaatt
ggcaaatacttacaactaccaccgggtaatgagtgtgattttgatctttttgaagaattg
ctagacctttgcgatttgtgtgtacgcctgcctttaccagcagtgagtatctgcctaatg
gaggaactcattgcggactttcaacatgctatgatagcacttcttaaaaacacggattta
tcactccgattaaactggaaattgtgcacattacttggaaacgtagtcagagccgttaaa
tccgtaaacagccgcgataaaggagacgtgcgcatttttcatagtaacttatttgagttg
atctttcaattaataacgcagtactttcaaaaacgggatctacatcgagtacgttgctta
ttacatctacagaaagtattgagtgccttcgatattgacgttctcgatgagcagctcctt
ggttactgcaggcgttttatcaaattatcacttgctttgagatcgtctacctacacaggt
gcacaatggcagattgattgccttaccattgtatgtcaattgtatgctcaaatggaacaa
ccaacacataattttaagctcagtgattgtaccgttaagtatttgagtggtttatgtggt
cactgcaaccggcaagtgcgcgcgcttgcctggtgtattttaacatatctgtcgcgctat
gaagagcgtaatgatgtaagaaaatcgctaacatcaggtattgactttatagaaaaaacg
ctatcttatcttcctggaggttttatggcatgctgtttgtgcacatttttagatatcggc
gaaacaaatgtggtacgccagttggcggccaatttatttactaaattcctcagtgataac
ggtaaatataacgatgcatatgaattgcttacgcggcatagattcctcccaaccgcagat
gaggctgtacgtggcacctgtgtatttgaggaacaattacctacacaaattgattccaat
tcagtaatcagcataaccagctgcgaattgataagccttttttgccggatttgcttgagg
atgctgcaaatcaatgccgatttcgccactgacttgtgtgcaagcgattttatgatcaga
ttgtatgagttgctgaaagtgccatcggcgcaatccaatcctgcgtactacacaatgtgc
ggcgatttgtgtcacttgtatggctcgtgttattctgtaaattttgtttttctgcaacgg
actttatgtcgtgatcatgcttggttaatgcacttttaccagttgctcgatcagccactt
gcgtctgattccgttatagtcaatgtactgcagcttctgttagttatatgtaaagataat
ttagcctatgaaaagttgtgccaaaaaattgctaaagcacctgaatttcttgtgaaacac
tttttacgcgcttttaacgtgggcaatgtcgatacccctttgcaacggtgttctctggca
gcgcttagtttattactaattaaatcccaaaataaattgcccaagcatgatgaacgaaaa
acgtttttgacagtacttgaagatcatattgaaataagagattcaaccatcatcaaggaa
ggtcgtattgcgtgcaagacaacaaatatggacgaaattgtatcgaacaggcagtgtggc
gatatgagtcgcgattcaagcgcttacaaaattgctcctgtggataatgaaaaaatcgaa
gacatagccatggcaggcagcactagctcattgccgggagttgttcgtaaatctgcagct
gcttttattttcgttgagctgtttcggctttttcagcacctatatacagttccggcttgc
aaatttaatactgcgccatccaaagcacaagtacaagttggtgaaacattgggtgttctt
ttgggtctttctcccgaagcgaggttggcagcaaatgggctgaaactttttgataaaata
acgcagatctttactacgttttttgagcagtttaaatgcactgccactacgtatgtgcgt
cgatatggggagagcaaaaaggtagcattaattaaaaattttcaattgctgttgaacata
catttacattggtttgcggctcctgatgcagcgcttactgataattcgcaaagtgtcgct
ctctctaagcttacaatgcagttgtggccgtggctaccatattcttgtgaattaaaggag
ttggtattgcaggtgtgcacatatcacagcgaacactcatttgtggtatgtcaacaattt
tcttcgctgttttccggatatgcccattcattgctacaactagtcattaagttggttgta
gctgaaacaacaaagttaaaagcgaataaagctgacgattttccagttatcagcacagga
ctgcgcgtcgttatgaattgttgctcttgcgctgacggtcgcatcaccatcattaaggca
cacatgttggacatgttcgatggcctgcatccgtttcatttaaagtcgcctaaagtgaaa
gcggaaatattgcgctcatggttgcagttttgggaactattttcgcgctaccaagaaggt
gcacaagtccgcaatttacgagctttatgtgatgtaatatcacgaacttctacccagagt
gcaacacgcgtaattttgctgcgtatattacgtaatatgtgtttcttgcctagtaatcgc
tcagcaataatgaattcagcggatttcatttgtgtcgtcgatacgattgttgcccatcca
ttagattcgaaatccacgtcaaatgcggtactggaatgtgcatcctatgaagaacaattg
attgtgtgtgttggtgtttggaaattagcatcagcgggtgtcaagtatgttgcgctgttg
cgcagcactactttggccaggcatctgcggcaattacatgaacaactagcagcgctcaag
gatacagactccaaaaagttctccagtatctcttttgcgaacgacttattatatgttctg
gatgtagttttaaatatatttaataattag
DBGET
integrated database retrieval system
