Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 (serotype 7): APP7_2009
Help
Entry
APP7_2009 CDS
T00717
Name
(GenBank) site-specific recombinase
Organism
apa
Actinobacillus pleuropneumoniae AP76 (serotype 7)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SpecificRecomb
Uncharacterised_IM_YidI
Peptidase_M24_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACE62661
LinkDB
All DBs
Position
2214821..2216788
Genome browser
AA seq
655 aa
AA seq
DB search
MPKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPEL
AQAAATLICRWLCQLRLYPILVSSGILGRQGFGREMRNRLYEKLNPSFKDVNDLRDVFIL
LFCDRHDVEWINAISTKIWLNFLNTLDHSVSEQDRAWLYEHIRHEGLFAIKMLSIWIAAE
DLEPELIRLDRTLLDADSPFVALQKEVFLWLAARRQNQYYDDSHLQVMFNQSRELVDRLQ
KKGSIAGSSLGVAHLLERLSQTLDRLAMLMELFSTNRVARLRVLQITKMLAEAAAKQHSI
SDLWKQSVKMLSRSITQHTSDHGEHYITRDKKEYFSMFYSAAGGGVLIALMALFKVYLGG
MIDDKVWKGIAEGLNYGIGFTVIFMLHFTVATKQPAMTAARFAEAVERNPQGSAVNMKLA
QLLVDVLRSQSIAVLGNVIVSMSVAALIAYGYAEHTGKALLDSEMVQYQLSSIDPTKGTL
WFAAIAGLWLFCSGIISGYFDNRSNYLNTRMRLRQHPWLKAIFPLSVREKFADYVHDNIG
SIIGNLGFGMLLGITGVIGYWLGLPLDIRHVAFSSANVGYAVVSESLGWQVLLQSICFVL
MIGAVNLIVSFSLTLWIALRSRNTEIDSWREILKCLWEIIRKRPLSLFLPVQLNK
NT seq
1968 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaaaataaacttgaatgaaacgacccttttaccctttgtcagccggcaaatcgaa
caaaacgacgcttttactctgttaaacggattatgtcagtggcttagagccgacaagccg
gaacaagcggtcgaaaaattagaattttttaccgatttacttaaacaacaaccggaactc
gctcaagcggctgctacgctaatttgccgctggctttgtcagctacgtttatatccgatt
ctcgtcagtagcggcattttaggtcgccaaggtttcgggcgagaaatgcgtaatcgctta
tatgagaaactcaacccgtcttttaaagatgtgaatgatttacgcgatgtgtttattctc
ttgttttgcgatcggcatgatgtggaatggattaatgccatttcgactaagatctggtta
aattttctcaatacgttagatcacagtgtaagcgagcaggatagagcttggctgtatgag
catattcgtcacgaagggttatttgcgatcaaaatgctttcgatttggattgcggcggag
gatttggaaccggagttaattcgtttggatcgaacgctgttagatgccgattcaccgttt
gttgcattgcaaaaagaagtgtttttatggttagcggctcgtcgtcaaaatcaatattat
gacgatagccacttacaggtgatgtttaaccaatcacgcgaattggtggatcgcttacag
aaaaaaggatcgatagccggttcgtcacttggggtggcacatttgcttgaacgtttaagt
caaaccttagatcgtttggcgatgttgatggaattattttctaccaaccgagtcgctcgt
ttacgcgtgttgcaaattactaaaatgttggcggaagcggcggcaaaacagcacagtatt
tccgacttatggaaacaaagtgtcaaaatgctttctcgcagtattacccaacacaccagt
gatcacggcgagcactatattactcgagataaaaaagaatatttcagtatgttttattcc
gctgccggcggtggcgtgctgattgcgctgatggcgctctttaaagtgtatctgggtgga
atgattgacgataaagtctggaaaggtattgcggaaggtttgaactacggcatcggtttt
accgttatctttatgttgcattttacagtagcaaccaaacagccggcgatgactgccgca
cgttttgccgaagcggtcgagagaaaccctcagggaagtgcggtgaatatgaaactggcg
caattgttggtggacgtattgcgttcacaaagcattgcggtactggggaatgtgattgtg
tcgatgagtgtagcggcattaattgcttacggctatgccgaacacaccggaaaagcgtta
ttagacagtgaaatggtgcaatatcagctaagctcgattgacccgaccaaaggaacctta
tggtttgcggctattgccggtttgtggttgttctgctcggggattatttccggctacttt
gacaaccgcagcaactatttaaatacccgtatgcggttaagacagcacccgtggttaaag
gcgatttttccgttatccgtacgagagaaatttgccgattacgtgcatgataatatcggt
tcgattatcggtaacttaggcttcggtatgttgcttggcattactggcgtgatcggttat
tggttagggctgccgttagatattcgccacgttgctttttcttcggcgaatgtcggttat
gcggtggtgagcgaatcgttaggctggcaagtgttattgcaaagcatctgctttgtgttg
atgatcggtgcggtcaatttgatagtcagcttctctctaacgctgtggattgcgctgcgt
tcacgcaataccgaaattgatagctggcgggaaattttaaaatgcttatgggaaataata
cgtaaacgcccgttaagtttatttttgccggttcagttaaataaatag
DBGET
integrated database retrieval system