Avibacterium paragallinarum: EIA51_08005
Help
Entry
EIA51_08005 CDS
T05728
Name
(GenBank) type I secretion system permease/ATPase
KO
K11004
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial HlyB/CyaB
Organism
apag
Avibacterium paragallinarum
Pathway
apag02010
ABC transporters
apag03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apag00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
EIA51_08005
03070 Bacterial secretion system
EIA51_08005
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
apag02000
]
EIA51_08005
02044 Secretion system [BR:
apag02044
]
EIA51_08005
Transporters [BR:
apag02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
EIA51_08005
Secretion system [BR:
apag02044
]
Type I secretion system
alpha-Hemolysin/cyclolysin transporter
EIA51_08005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
Peptidase_C39
SMC_N
AAA_21
AAA_29
nSTAND3
NB-ARC
ABC_ATPase
Zeta_toxin
AAA_18
AAA_22
DUF87
AAA_16
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZI14558
UniProt:
A0A377IAS1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1670667..1672799)
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MNTKEHKNDYALDALVLLARFHGIAVNTEDIRHQFDLYGAGLDLVNWQLAAKSLGFKVRV
SNKSISRLSFINLPVLVWDGENKQHFILAKIDNRQNKYLIHDLALKQPIVLGADDFAQRY
TGQIILLTSRASVLGQLAKFDFTWFIPAIIKYRRILYEVIAISLVLQILALITPLFFQVV
MDKVLVHQGFNTLNVIAVGLSIIILFEVLLSAIRSYVFSHTTSRMDVELGAKLFRHLLAL
PLAYFEARRVGDTVARVRELEHIRNFLTGQALTSLLDLCFSFIFLSVMWFYSGWLTLVVL
LSLPCYVIWSMIITPILRKKLDEKFARNADNQAFLVESITAINVVKSMAISPKMVEYWDK
QLAGYVKAGFEVSKLAIIGQNGVQLIQKLVMVINLWLGAHLVISGDMSIGQLIAFNMLAS
QVATPVIRLAQLWQDFQQVGISVERLGDILNTPMETAKSKLALPEIKGDIVFENVKFRYK
PEDRDIISDFSLKLSAGEVVGIVGRSGSGKSTIAKLIQRLYIPQSGRIYIDGQDLSVVDP
NWLRRQIGVVLQDSVLLNRSIRDNIAISEPGISMEKVIIAAKLAGAHDFITQLSEGYDTL
VGEQGAGLSGGQRQRIAIARALISNPKILIFDEATSALDYESERIIMQNMNSICRGRTVI
IIAHRLSTIRMANKIVVMEQGNIVESGSHDMLLENENGLYSYLNQLQSGL
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacaaaagaacacaaaaatgattatgcattggatgcactggttttattagctcgt
tttcatggcattgcggttaatacggaggatataagacatcagtttgatctttatggagct
ggtcttgatttagtcaattggcagttggcagcaaaatctttgggttttaaagttagggtg
tctaataaatcgatctctcgtttgtcttttattaatttacccgtgttggtctgggatgga
gaaaataagcaacattttattttggcaaaaattgataataggcagaataaatatttaatt
catgatttggcattaaagcagcctatcgttttaggtgcagatgattttgcacaacgttac
acagggcaaattattttattaacttctagggcttctgtattaggacaattagcaaaattt
gattttacttggtttattccagccattattaaatacagaagaattttgtatgaggtgatt
gccatttcattagtgctacaaattttggctttgattacgccactgttcttccaagttgtt
atggataaggttcttgttcatcaaggatttaatactttaaacgtcattgccgttggtttg
agtattattattttatttgaagtcttattaagtgcgatacgtagctatgttttttctcac
accacaagtcgtatggatgtggaattaggagcaaaactcttccgccatctattagcatta
cctttagcttattttgaggctcgtcgagttggagatacggttgcaagagtgagagaatta
gaacacatccgtaattttttaacaggtcaggctcttacttcattattggatttatgtttt
tcgtttattttcttaagtgtaatgtggttctatagtggatggcttacgttggttgtttta
ttgtcattaccttgctatgtcatatggtcaatgataattacgccgatattgaggaagaaa
ttagatgaaaaatttgctcgaaatgcagataaccaagcctttttagtggaatctattact
gccattaatgttgttaaatctatggctatttcgcctaaaatggttgaatattgggataag
caattagctggttatgttaaagccggatttgaagtgtctaaattagcaataataggacaa
aacggcgtacagttaattcaaaaattagtgatggtgattaacctttggttaggtgctcat
ctagtaattagtggcgatatgagtattgggcaattaattgcctttaatatgttagcaagc
caggttgctacgccagttatacgtttggctcagctatggcaagattttcagcaggtaggg
atatcagtagagcgtttaggtgatattctgaacacaccaatggagacagcaaaaagtaag
ttagctctaccggaaattaagggggatattgtttttgaaaatgttaagtttagatataaa
cctgaggatagagatattatttcagatttttcgttgaaattatcagcgggagaggttgtc
gggattgtaggtcgttctggttcaggtaaaagtactatcgctaaattaattcaacgatta
tatattccgcaatctgggcgtatttatattgatggacaagatctttctgtggttgatcca
aattggttacggcgacaaattggggttgtgttacaggatagtgttctattaaatcgaagt
attagagataatattgcaattagtgaacctggaatttcaatggagaaggtgatcattgca
gctaaattggcaggtgctcatgattttattacgcaattatctgaaggttatgatacattg
gttggcgaacaaggtgcgggattatctggtggacaacgtcagcgaattgctattgcgaga
gcgttgatttctaatcctaaaattttaatttttgatgaagcaactagtgcattagattat
gagtctgagagaataattatgcaaaatatgaattcgatttgtcgcgggcgtactgttatt
atcattgctcatcgcttatctacgattagaatggctaataaaatcgttgttatggaacaa
ggaaacatcgtagagagtggctctcatgatatgttattagagaatgaaaatgggctatat
tcatatttaaatcaattacagtcagggctttaa
DBGET
integrated database retrieval system