Avibacterium paragallinarum: EIA51_08310
Help
Entry
EIA51_08310 CDS
T05728
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
apag
Avibacterium paragallinarum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
ESPR
DUF659
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZI14612
LinkDB
All DBs
Position
complement(1745758..1751886)
Genome browser
AA seq
2042 aa
AA seq
DB search
MIMNKVFKIKYSVVKQEMIVVSELANNKDKTASQSNNHKQPLFFSFLPKLKPLSLFIGTI
LSASLLFSPSAFGRSVEMLKGKVGSSSNWLAGQGARSIALNPSSESSDTNGQAAEDSVAI
GNEATIDLNAKKSIAIGRYAKNKGSAESSIAIGYGAENESTASNSVTIAKAINRFEKSIV
IGLSAYTQLDPRKTNKETRQGSVVIGENAKSAGNQSVSLGQNAWSKTNSISIGAGTFAEG
KSTIAIGTDKISGNNYNDKLPNTAWNGIGTPPANSIWDIFSDLYMGRKNASTDYSTSDRD
PKKPEAFYRYSDFKTKYIDNPSSSPTYAGKVGAIALGSRTIAAGEMSTAVGSLAFALANK
STAMGLRSFVARDAEGGTAVGEESRTFAKNSVAIGNKTEASNAGSMAYGYKAKAVGAGAI
AIGAEVAAGAEFDSSKAGNLLLNTSAYATLKNADKSDNTKAENAITAFTKSFDNVLTNGL
PLIAENETYLTTSAGDIKKTLATTGDGGKNAIAIGNKTFASKANSVALGSYALANARNAF
ALGSYSFVDPSATDTIAIGVGSHATGSSSFLAGSWISTLSDRTVVLGYSASISSGSVNSL
AIGANAFVGRDSSSSLALGMGSTIAKNAKSPDSLAIGKDARIDAKDIDNGTLYEPQVYDE
NTRTFRKFNADSDYMRQAMALGFNAKVSRGASKMETGINAMAIGANAQATLQNSTALGVD
SKTDYTWEQLEADPWVSKGGISIPTSGKTGIISVGSKGSERRIVNVASGSLDTDAVNVAQ
LKTLEERFLFEIDLLQNVGEVQYLSVEKTNINGQAGRVASQIRKGESYERYVKLKAQLLY
LDAREKLNGEKFNETSLNKIRSAVRELEAEYNGDLKTTASTLNQVATQLEKEATANNFNK
FNQYKTKIENATNADSKRTVDGLTTQAIAQLKANSNYLNDGAKGQDSIAFGWQAKTSGDN
NGLAGKQAIAIGFQANSSAENAISIGTNSDTSMTGAVAIGKGATVTAGGKPSIALGQDST
VANSAISRTSSVMINGLTFNNFAGSPETLGVLSIGTAGKERKIVNVAAGDISQTSTEAIN
GSQLYATNFMLNKLAQSVKTNFGGNANLATDGTITFTNIGGTGQDTIHDAINNVLTKLIS
LSATEEEVVSGEAVYDALKGAKPTVSAEANKGITGLVDVVKKANSPITVEPSTDNNKKKT
FTVGLMKDIEGVNSITFDKSGQDLNQVTGRMSSAGLTFKKGDTTNGSTTTFAEDGLTIDS
TTNSAQTNLVKVSRDGFSVKNGSDESKLASTKLSIGAENAEHVEVTKSGIALKADNTSDK
SSITLAQDAITLAGNATGTAIKLTGVADGNITVNSKDAVNGGQLRTLLGVDSGAKIGGTE
KTTISEAISDVKQALTDATLAYKADNKNGKTVKLTDGLNFTSTTNIDASVEDNGVVKFTL
KDKLTGLKTIATESLNASQNIIAGGTVTVGGETEGIVLTKSGSGNDRTLSLSGAGNAATD
GIKVSGVKAGTADTDAVNKGQLDKLFKAINDALGTTDLAVTKNPNQTSIFNPINGTAPTT
FKDAVDKLTTAVNTGWGSKVGILATGIDGIDAGNKKISNVADGDISPTSGDVVTGRQLYA
LMQKGIRVYGDEVSPTKTQTTAPTASSTQGGATTANTAGGVAPAGNVATGDIAPTQPALP
EMKTALVGDHLAVPLGGSLKIHGDHNVKTTISAGNQVGISLQPNISIENNLVIGSNKPEK
AKLAAQEGNALVITNKDDGNAAMVFNNEKNMLVLSDKKAKPRAVLDGQNGALTLVGNDDS
QVTLSSKKGKDIDGNDLSRLSVTTERTNADGQLEKVETSFATMDDGLKFKADGDKVINKK
LNETVEIVGDENVTTSITDDNKVKVSLNKKIAIDEVKIPNTDPDAQKGDSIVINNGGIHA
GNKVITGVKASDDPTSAVNRGQLNTVIDNVQNNFNQVNQRIGDLTRESRAGIAGAMATAS
LQNVALPGKTTISVGTATFKGENAVAIGMSRLSDNGKVGIRLSGMSTSNGDKGAAMSVGF
TF
NT seq
6129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattatgaataaagtttttaaaattaaatattctgttgttaaacaagaaatgattgtg
gtttcagagttagcaaataataaagataaaacagcaagtcaaagtaataatcataaacaa
cctttatttttcagttttttaccaaaacttaaaccgcttagtttatttataggcactatt
ttaagtgcgtcattattattctcaccatcagcttttggtagaagtgttgaaatgcttaag
ggaaaagtgggtagttctagtaattggttagcgggtcaaggagctaggagtattgctttg
aaccctagttctgaatcgagtgacacgaatggacaagcagcagaagattcggtggcaatt
gggaatgaagcgacgatagatttaaatgcaaagaaaagtattgcgattggacgttatgca
aaaaataaaggttctgcggaaagctctattgccatcggttatggggcagaaaatgaaagt
acagcatcaaattctgtgactattgccaaagcgattaaccgttttgaaaaatctattgtg
ataggtcttagtgcttatacacaattagatccccgtaaaactaataaagaaacccgtcaa
ggttctgtggtgattggggaaaatgcgaaaagtgctgggaatcaatctgtttctttaggg
caaaatgcgtggtcaaaaaccaattctatttctattggggcaggaacctttgcggaaggg
aaatcaaccattgctatagggactgataaaatatcagggaataactataatgacaaattg
cctaatactgcttggaatggaataggtacgccacctgctaattccatttgggatattttc
tctgatttatatatggggcgaaaaaatgccagtacagattatagtacaagtgatcgcgat
ccaaagaagccagaggctttttataggtattctgattttaaaactaaatatattgataac
ccaagttcctctcctacttatgcaggtaaagtaggggcaattgccctaggttcccgcacc
attgccgcaggggaaatgtccactgcggtcggttccttagcctttgcattggcaaataaa
tccacagcaatggggttacgttcttttgttgcgagagatgcagaaggcggaacggcagtc
ggggaagaatcgcgaacttttgctaaaaattccgttgctattggtaataaaactgaagcc
tcaaatgctggctcaatggcttatggttataaggcgaaagcggtaggtgcgggggcaatt
gcaattggggcagaagtcgcagcaggggctgaatttgatagcagtaaagcaggaaattta
ttactaaataccagtgcttatgctactttaaaaaatgccgataaatcagataatactaaa
gccgaaaatgcgattactgcatttaccaagtcttttgataatgtgcttactaatggatta
ccgctgatagcggaaaatgagacctatttaaccacttcagcaggtgatatcaagaaaaca
ttagctacaactggagatggagggaaaaatgccattgcaattggtaataaaacctttgcc
tctaaagcaaattctgtggcattagggagctatgccttagcgaatgccagaaatgccttt
gcactaggttcttattcttttgtggacccttcagcaaccgatacaatcgcaattggtgtg
ggaagtcatgccacaggatcaagcagtttcttagcgggttcttggatatcaaccctttca
gatcggacagttgtgctagggtattccgcttcaattagctcaggttctgtcaattcatta
gcaataggggcgaatgcctttgttgggcgtgatagttcttcttcattggcattaggtatg
ggttctactattgcgaaaaatgccaaatctcctgacagcttagccattggtaaagacgca
cgaattgacgctaaagatatagataatggtactttgtatgagcctcaagtttatgatgaa
aatactcgaaccttcagaaaatttaatgcagatagcgattatatgcgtcaagcaatggca
ttaggttttaatgcgaaggtttcgcgtggtgcgagcaaaatggaaacggggattaatgca
atggcgattggtgctaatgctcaagcaactttgcaaaattccaccgcacttggggtagac
tctaaaacagattacacttgggaacagttagaagccgatccttgggtatctaaaggggga
atcagtatcccaacttcaggaaaaactgggattatttcggtgggctcaaaaggctcagaa
cgtcgtattgtgaatgttgcgtctggttctcttgataccgatgcagtgaatgtggctcag
ttgaaaacccttgaagaacgtttcctatttgaaattgatttattacaaaatgtcggtgag
gtgcaatatctctctgttgaaaaaacgaatatcaatggacaagcggggagagtggctagc
caaattcgtaaaggggaaagttatgagcgatatgtgaaattaaaagcacaattgctctat
ttagatgcacgagaaaaattaaatggagagaagtttaatgaaacttcattaaacaaaatt
cgttcggcagtgcgagaacttgaagcggaatataatggcgacttaaaaacaactgcgtca
actctcaatcaggttgcaacacaattagagaaagaagcaaccgcaaataacttcaataaa
tttaatcaatataaaacgaagattgagaatgcaaccaatgcggattcaaaaagaactgta
gacggcttaaccactcaagccattgcacagttaaaagccaatagtaactatcttaatgat
ggtgcaaaagggcaagacagtattgcatttggctggcaggcaaaaacctcaggagataat
aatggattagcagggaaacaagccattgcgattggtttccaagcgaattcttccgctgaa
aatgccatttctatcggtacgaattcggatacctcaatgacaggggcagtggcgattggt
aaaggtgcaacggttactgcgggtggaaaaccttccattgcattggggcaagattcgacg
gttgccaattccgcaattagccgtacaagttcagtgatgataaatggtttaacattcaat
aattttgcaggttcccctgaaacactcggtgtgttaagtatcggaacggctgggaaagag
cgtaaaattgttaatgttgcagcaggcgatatttcgcaaacttctactgaagccattaac
ggctcacagctttatgcaacgaactttatgttgaacaaactggctcaatccgttaaaacg
aattttggcggtaatgcaaaccttgccactgatggcacaattacatttacaaatattggc
ggcacagggcaagatacaatccacgatgcgattaataatgttctcaccaaattgatctcg
ctttcggcaacagaagaagaagtggtgtcaggggaagctgtctatgatgcacttaaaggt
gcaaaaccaacggtttcagcagaagccaacaaaggcattactggcttggtggatgtggtg
aaaaaagcaaattcaccgatcacagttgagccttctaccgataacaacaagaaaaaaacc
ttcactgtcggcttaatgaaagacattgaaggggtaaacagcattacctttgataagtca
gggcaagatctaaatcaagttacgggcagaatgagcagtgcgggtttaaccttcaaaaaa
ggcgacacaacaaatggttcaaccaccacttttgcagaagatggcttaaccattgatagc
acaacaaattctgctcaaacaaacttagtgaaagtaagtcgtgatggcttctcggtgaaa
aatggcagcgatgaaagcaaattagcctcgacaaaattatctatcggtgcggaaaatgca
gaacacgttgaagtaactaaatcgggcatagccttaaaagcggataacacctccgataaa
tctagcatcaccttagcccaagatgcgattactcttgcggggaacgcaaccggaacggcg
attaaattgactggtgttgcagatggcaacattacggtaaattcaaaagatgcggtaaat
ggggggcagttgcgtaccttattaggggttgatagcggggctaaaattggcggtactgag
aaaacaacgatcagtgaagccatttctgatgtgaagcaagctcttaccgatgcgacattg
gcatataaagcggacaataaaaacggtaaaacagttaaattgactgacggattgaatttt
actagcacgaccaatattgatgcttcagtggaagataacggtgtggtgaaattcacctta
aaagataaattaacaggcttaaaaactatcgcaactgaatctttgaatgcttctcaaaat
atcatcgctggcggtacggtaacagtgggcggcgagacagagggcattgtgctaacaaaa
tctggctcaggaaatgaccgcactttatctttatctggtgcaggcaatgcagcaacagat
ggcattaaagtctctggcgtgaaagcagggacggcagacaccgatgcggtgaataaaggt
cagttagataaactttttaaagcgatcaatgacgcattaggcacaacagatttagcggta
accaaaaatccaaatcaaacctctatctttaatccgataaacggcacggctccaaccacc
tttaaagacgcggtggataaattaaccaccgctgtgaatacaggttggggatcaaaggta
ggtattttggcaacaggtattgatggtattgatgctgggaataagaaaattagtaatgtc
gccgatggggatatttctccaaccagtggtgatgtagtgacaggtcgtcagctctacgcc
ttaatgcagaaaggtattcgcgtgtatggtgatgaagttagtccaacgaagactcaaaca
acagcacctacagcatctagcactcaaggtggggcgacaacggcgaatacggcgggtggt
gtagcaccagcaggtaatgtagcaacgggggatattgcgccgacacagccagcattgcca
gagatgaaaacggcattggttggtgatcacttggctgtgccgttaggtggaagcctcaag
attcacggagatcataatgtgaaaacaacgatttctgcgggtaatcaagtggggatttca
ttacagccaaatatttctattgagaataacttggtaattggttcaaataagcctgagaag
gcaaaattagccgcacaagaaggtaatgctttggttatcactaacaaagatgacgggaat
gcggcgatggtctttaataacgagaaaaatatgcttgttctcagtgataaaaaggcaaaa
ccaagagcggttcttgatggacaaaatggggcattaactttagtcggcaatgatgattct
caagtcaccctttcctctaagaaaggtaaagatattgatggaaatgatttgagccgtctc
tctgtgacgactgaaagaacaaatgctgatgggcaacttgaaaaagtggaaacctcattt
gctacaatggatgatggcttgaagttcaaagccgacggggataaagtgattaataagaaa
cttaatgaaaccgttgaaattgttggtgatgagaatgtgacaacatctattactgatgat
aataaggtgaaagtttcactgaataagaaaatcgcgattgatgaggttaagattccaaat
acagatcctgatgctcaaaagggagatagcattgtaatcaacaatggtggaatccacgca
ggtaataaagtgattactggcgttaaagcgagtgatgacccaaccagtgcggtgaatcga
ggtcaattaaatactgtgattgataatgttcaaaataatttcaatcaagttaatcaacgt
attggcgatttaacacgggagtcgcgtgcaggtattgcaggtgcaatggcgacggcaagc
ctacaaaatgttgctttaccagggaaaacaacgatttccgtaggtacagcaacgttcaaa
ggggagaatgctgttgcaatagggatgtctagactctctgataatggaaaagtaggtatc
cgtttatctggtatgagtacgagtaacggagataaaggggcagcaatgagtgttggattt
accttttag
DBGET
integrated database retrieval system
