Malaciobacter pacificus: APAC_1349
Help
Entry
APAC_1349 CDS
T06712
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
apai
Malaciobacter pacificus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apai00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
apai02000
]
APAC_1349
Transporters [BR:
apai02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
APAC_1349
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEP34463
UniProt:
A0A5C2H6M0
LinkDB
All DBs
Position
1349904..1352099
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MKLKIASSVAILLTSQSLLANETLLDDVTVTTASGYEQKLADAPASISVISKEELSKKPF
TNLLDALKDIEGIDIGETRDKSGQGSISIRGMGGDYTLIMIDGKKQNNNGDIYPNNFGGF
QNANLPPLEMIERIEVVRGPMSTLYGADAMGGVVNIITKKITSEWTGSITHGKTFQSDSQ
FGNDTTTDFALMGPLVKDKLGLSLRGSYYDKEASTPITSNGSTFGGAGKTVDNQNWNFGT
SLTFTPNENHTIKADYDISKQKYDNTGSFVGTVDSYENLWYERRGAYSPRVGYAPVQRME
REQYSISHEAQWEVGKSTISAHYIKTGNLGRSLPLNATQRVFMNSLYSNYTDLEDFRANG
TAAEIAEFEALLPRPTRTLESSTMTYDAKYELPLEEHFLIIGAQYVDAELEDGVFGMTDA
AQTKSGVVEDYKQWALFAEDTWAITDNLSFTTGLRYDNHESFGSNLSPRGYAIYNLNDNW
TFKGGVATGYKTPKTTDLFDGITGFGGQGTSPWVGNPNLNPEKSVSSEIAAYYTHEAGHN
FNITIFNNDFEDKIENVTLTQNQLPSEWDGIATSARQKQNVGEAQIKGIELAGKYKITKD
VTFKANYTYTDSQREDTGNPLSSTAKHLYNLTLDWQINKKWNTYINMNAEKDRWRGVEGL
DYYEDYQVFNLGSSYKVSNDVTLNGRVNNLFDKDFSGTTDYTDENGDAATAYSYNLAQKR
REFWVSMNVKF
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaattaaaaattgcaagtagtgtggctatattattaactagtcaaagtttattagca
aatgaaacattactagatgatgtaacagtaacaacagcttcaggttatgaacaaaaatta
gcagatgcacctgctagtatttcagtgatttctaaagaagagttatcgaaaaaacctttt
actaatttattagatgccctaaaagatattgaaggtattgatattggtgaaacaagagat
aaatcaggtcagggaagtattagtattagaggtatgggtggtgactatactttaattatg
attgatggtaaaaaacaaaataataatggtgatatatatccaaataactttggaggattt
caaaacgctaatttaccaccacttgaaatgatagaaagaatagaagttgttagaggacct
atgtctacactttatggtgctgatgctatgggtggtgttgtaaatatcataactaaaaaa
atcactagtgaatggactggatctataacacatggtaaaacttttcaaagtgatagccaa
tttggaaatgatacaactacagattttgctttaatggggccattagtaaaagataaacta
ggattaagtttaagaggtagttattatgataaagaggcttcaactcctattacatcaaat
ggttcaacatttggaggtgcaggaaaaactgtagataatcaaaattggaattttggtaca
agtttaacatttacaccaaatgaaaaccatacaataaaagcagattatgatatttcaaaa
caaaaatatgataacactggaagttttgtaggaacagttgatagttatgaaaacttatgg
tatgaaagaagaggagcatattctccaagagttggttatgcacctgtacaaagaatggaa
agggaacaatactcaatttcgcatgaagcacaatgggaagttggaaaaagtactatttca
gcacattacattaaaacaggtaatttaggaagaagtctacctttaaatgctacacaaaga
gtatttatgaatagtttatattctaactatacagatttagaagattttagagcaaatgga
acagcagcagaaattgctgagtttgaagcacttttaccaagaccaacaagaactttagaa
tcaagtactatgacttatgatgcaaaatatgaactgccattagaagaacattttttaatc
attggagcacaatatgttgatgctgagttagaagatggagtatttggtatgacagatgct
gctcaaacaaaatcaggtgtagtagaagattataaacagtgggctttatttgcagaagat
acgtgggctattactgataatttatcatttacaacaggtcttagatatgataatcatgag
tcttttggaagtaatttaagcccaagaggatatgcaatttataatttaaatgacaattgg
acatttaaaggtggtgttgcaacaggatataaaactccaaaaactacagatttatttgat
ggtattactggttttggaggacaaggaacttctccttgggttggtaatcctaacttaaac
cctgaaaaaagtgtaagtagtgaaattgcagcttattatactcatgaagctggacataat
tttaatattacaatatttaataatgattttgaagataaaattgaaaatgttactttaact
caaaatcaattaccttctgagtgggatggaatagcaacaagtgctagacaaaaacaaaat
gttggtgaagcccaaattaaaggtattgaattagcaggtaaatataaaatcactaaagat
gtaacttttaaagcaaactacacatacacagattcacaaagggaagatacaggtaatcca
ttatcttcaactgcaaaacatttatataatcttactttagattggcaaataaataaaaaa
tggaatacatatattaatatgaatgcagaaaaagatagatggagaggagttgaaggttta
gattattatgaagattatcaagtgtttaatttagggtcttcatataaagtatcaaatgat
gttactttaaatggaagagtaaataacttgtttgataaagattttagtggaacaactgat
tatactgatgaaaacggtgatgcagcaacagcttatagttataatttagctcaaaaaaga
agagagttttgggtaagcatgaatgttaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
