Alpha proteobacterium HIMB59: HIMB59_00004980
Help
Entry
HIMB59_00004980 CDS
T02249
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
Organism
apc
Alpha proteobacterium HIMB59
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
DNA_polI_exo1
HHH_5
HHH_2
HHH
Polysacc_deac_1
Dabb
DNA_pol_lambd_f
IMS_HHH
Polysacc_deac_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS48698
LinkDB
All DBs
Position
450400..453078
Genome browser
AA seq
892 aa
AA seq
DB search
MSESRLILVDGSGYIFRAYYALPPMNNSKGIPTNAVYGFCNMMLRLIDEHPHDKILIILD
AGKNTFRNTLYSEYKANRSEAPEDLIPQFGIIREAIDAFGLDVIEKKDFEADDIIASYVR
YGEENKIPTTVFSSDKDLFQLLSANTRIMDPMKNVEIDEAKVMDKFGVGPDKITDVQALI
GDSVDNIPGVPGIGPKTAAKLINEFGTFEELLAKKDQISNVRIKNLIHDHEESAKISHQL
VILKNDLELPIQIENLKDFDDSPKLNDFFKKYEFKSLIRTSAHETKPHAAKKDIEFKSLI
KTPEIIEYLQSLQSERILAIDLETDSLDVNQANIIGISLSNADQAYYIPFKSPENELTSK
DQTKILKELNLLCEDPSILKIFHNAKYDSVILKRFHVNTVSFQDTLLMSFFINNGLTKHN
LEDLYYYYFGEEKEKFKDVIKNESKRNYKDFSEVPLQAATNYAAHDAYATHKLYEAMQQQ
ISEVSDSWIYYDIDKKLSLVLQEVESNGCKIDLKFLTKLEKDLNKEIENIEKKIFKISGE
EFNIGSPKQLTEIFKKLDVKVTKKTKAGDFQTNVKVLEQLESEGVEIASHILQWRQYSKL
VSTYTSSLAEHADSNDRVHSTFNIAATITGRLSSSEPNLQNIPIRTEIGKKIRTAFIAEK
DHELYSFDYSQIELRVLCEACEDPNLLKAFQEDQDIHQSTGQLVFNKKSINDNDRRMAKI
INFGIIYGISQYGLAKQLGVSNAEAKLFIDNYFQKFPNINDFMKSTVDKAKKLGYVENLF
GRKSHIKDINAKNFMLRSFAERQAINAPIQGTASELIKIAMLDIQDYLQQHKCKSKMTSQ
VHDELLFEIHKDEKDLISQIANLMETSHQKYKSFKTPIKVDFGGGSNWGQAH
NT seq
2679 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgagtcccgattaattcttgtagacggttcaggttatattttcagagcgtactat
gcgctcccccctatgaataattctaaaggcattcccactaatgctgtttatggtttttgt
aacatgatgttacgtctcattgacgaacaccctcacgataaaattttaattattctcgat
gcgggcaaaaatactttccgcaatactctctattctgaatacaaagctaatcgtagcgaa
gcaccagaagatcttattcctcaatttggaattattcgcgaagcgattgatgcttttggc
ttagatgttattgaaaaaaaagattttgaggctgatgatattatcgccagttatgttcgc
tatggtgaggaaaataaaatccccacaacagtctttagttcggataaggacttgtttcaa
ttgctttccgccaatacccgtattatggacccgatgaaaaatgtagaaattgatgaggcc
aaagtcatggataagtttggtgtgggccctgataaaattactgacgttcaagcactgatt
ggcgatagtgttgataatattccaggagttccaggtattggccctaaaacagcagcaaaa
ttgattaatgaattcggtacttttgaagagctattagcaaaaaaagatcaaatctccaat
gttcgcatcaaaaatctcattcatgatcatgaagagtcagccaaaataagccatcaatta
gtgattttaaaaaacgatctcgaactgcccattcaaattgaaaatttaaaagacttcgat
gactccccaaagttaaatgacttttttaaaaaatatgaatttaaatccctcataagaacc
agtgctcatgaaaccaaacctcacgccgcaaaaaaagatatagaattcaaatcactgatt
aaaacacccgagatcatcgaatacctacaaagcctccaatctgaaagaatactcgcaatt
gatcttgaaacagacagtcttgatgttaatcaggcgaatattattggcatttccttatct
aatgcagatcaggcttattatattccttttaaatctccagaaaatgaattgacgtctaaa
gatcaaacaaaaattttaaaagaactcaatcttttatgtgaggatccttcaattttaaaa
atttttcataatgctaaatacgatagtgttattttaaaacgctttcatgtaaatacagtt
tcatttcaagatacgttgttaatgtctttttttattaacaatggtctgaccaaacacaac
ttagaggatttgtattattactactttggtgaggaaaaagaaaaattcaaagatgtcatt
aaaaatgaatctaaaagaaactataaagatttctctgaagtgcctttacaagctgctacg
aactacgctgctcatgatgcttatgctacgcataaattatatgaagcaatgcaacaacaa
atctctgaagtatctgatagctggatatactatgatattgataaaaaactgagtttagtt
cttcaagaagttgaaagtaatggatgtaaaatcgatttaaaatttttaacgaaactcgaa
aaagacttaaataaggaaatcgaaaatattgaaaaaaagattttcaaaatttcaggagag
gaatttaatattggctcccccaagcaattaacagaaatatttaaaaaactcgatgttaaa
gttaccaaaaaaacaaaagcaggagattttcaaactaacgtcaaagtactcgagcaatta
gagtctgaaggtgttgaaattgcctctcatattctacagtggagacaatattccaagcta
gtctcgacctacacttcatcccttgctgagcacgccgatagtaacgatcgtgttcatagc
acctttaatattgctgccacgatcactggacgattaagctcctccgaacctaatcttcaa
aatattcctatcagaacagagattggaaagaagatcagaacagcttttattgctgaaaaa
gaccatgaattatacagttttgattattctcaaattgagcttcgagttctttgtgaggcc
tgtgaggaccctaatttattaaaagcttttcaagaagaccaagacattcatcaaagtacc
ggacaactagtctttaataaaaagtcaattaacgataatgatcgccgaatggctaaaata
attaattttggaattatctatgggatcagccagtatggtttagctaaacagttaggggtt
agcaatgccgaggcgaagttgtttattgataattattttcaaaaatttcccaacattaat
gactttatgaaatccaccgtcgataaagcaaaaaaattaggatatgtcgaaaatctcttt
ggaagaaaatctcatattaaagatatcaatgctaaaaattttatgctgcgctcctttgca
gagagacaggctatcaatgcccccatccaaggtactgcatccgagttaatcaaaatagct
atgctcgatattcaagattatttacaacaacataaatgtaaatccaaaatgacctctcaa
gtacacgatgaacttttatttgaaattcacaaagatgaaaaagatcttatttctcaaatc
gctaatctgatggaaacatcacatcaaaaatacaaatcttttaagactccgattaaggtt
gattttggtggtggatcaaactggggtcaggcccattaa
DBGET
integrated database retrieval system
