Alpha proteobacterium HIMB59: HIMB59_00012220
Help
Entry
HIMB59_00012220 CDS
T02249
Name
(GenBank) sigma-54-interacting response regulator-like Fis receiver domain protein
Organism
apc
Alpha proteobacterium HIMB59
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HTH_8
Sigma54_activ_2
Sigma54_activat
DNA_pol3_delta2
nSTAND3
AAA_22
DnaB
ATPase
AAA_24
cREC_REC
DUF6169
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS49402
LinkDB
All DBs
Position
complement(1112151..1113398)
Genome browser
AA seq
415 aa
AA seq
DB search
MSKILIIDDELEICKQVSLILNKNDFNSTYVTSYEEFINLHKKNFDFDLVLVDLWLKNSS
KQGIDIINELKKNYNDLVIISFSGHANIDNAIESVKAGANDFIEKPFETKKLLHIIQKNL
LELKQKVTINNYRNQISFHSKINKIGFSEIIDNYFDKIEKIKSNSSILLYGPSGIGKNYT
ANFIHMTLSSNNPDTFINMNENLMNENDFLKFSSLHSYFTIYFNDFEKFNNLELLNYFDL
VKKNKINASIILDSKNPDLDDIMLKKIDYKFHFKPLMERKNEIMKLFQYYFETFSQKKFE
KIIEIDPSIENLLTKHNWPGNVFEIMNLAQNLINNLVSPPDIVKIDEIKEILDNSPGNSH
LYDMNYKEAKEKFERDFLVQKLKNNNWNMTLTSKMLNLDRVSLYRKIKSLNIKLD
NT seq
1248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaaattttaataattgatgatgagctagaaatttgtaaacaagtttctttaatt
ttaaataaaaatgattttaacagcacatatgtaacttcttatgaagaatttataaatcta
cataaaaaaaattttgattttgatttagttttagtcgatttatggttaaaaaatagttca
aaacaaggcatagatataattaatgaattaaaaaagaattataatgatcttgtaattatt
tcttttagcggtcatgcgaatattgataatgcaatagagtctgtcaaggcaggagcaaat
gattttatagagaaaccatttgaaactaaaaaacttcttcatataattcaaaaaaatctt
ctggagttaaaacaaaaagttacaattaataattatcgtaatcaaatttcatttcattcg
aaaattaataaaattggttttagtgaaattattgataattattttgataagatagaaaaa
ataaaatcaaattcatcaatacttttatatggccccagtggtataggtaaaaattataca
gcaaattttattcatatgacattatcttcaaataacccagatacatttataaatatgaat
gaaaatttgatgaatgagaatgattttcttaaattttcttctctacatagctattttaca
atttattttaatgattttgaaaagtttaataacttagaactattgaattattttgattta
gtaaaaaaaaataagatcaatgcctcaattattttagactcaaaaaacccagatttagat
gacataatgttaaagaaaattgattataaatttcacttcaaaccattaatggaacgtaag
aatgaaattatgaaattatttcaatactactttgaaacgttctctcaaaaaaagtttgaa
aaaataatagaaattgatccctctattgagaatttacttactaaacataactggccagga
aatgtgtttgaaataatgaatttggcgcaaaatcttataaataatctagtatcaccacct
gatattgtgaaaattgatgaaatcaaagaaatacttgataattctccaggtaattctcat
ctttatgatatgaattataaagaagcaaaagagaaatttgaaagagattttttagttcaa
aaattaaagaataataattggaatatgactttaacatcaaaaatgttgaatttagataga
gtatctctttatcgaaaaataaaatcgcttaatattaaactagactaa
DBGET
integrated database retrieval system