Alteromonas pelagimontana: CA267_010935
Help
Entry
CA267_010935 CDS
T06582
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
apel
Alteromonas pelagimontana
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
apel02000
]
CA267_010935
Transporters [BR:
apel02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CA267_010935
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJR81260
UniProt:
A0A6M4MF41
LinkDB
All DBs
Position
2462392..2465211
Genome browser
AA seq
939 aa
AA seq
DB search
MFKRTHLASAVFLAMSCQMAYAQEAQDDANSNNADNSSQAVEVIEVSGIRSSLNQALSIK
RQNMQVVDAIVAQDIGKFPDNNVVEALQRVTGIQVTDRGAGEVNTVTIRGLTDVTTTVNG
RNLFTASGRAVALADIPAALLKSVNVYKTRSASQIGSGIAGQIDISTQRPFNFDEGKVVV
AARGIYQEQADKTDPQLSLLASDRWEVGGGEFGALINVAYTRTNYRDQSITAGAVLPFAT
ENPSASLANGAAFGPLQRIFPADCSPQCWTPGLDTGLPFAPGSTLNLNGTEEEYYLSRDA
VFGSDFTGERERPAVNVSLQWAPDDRSVYTFEAFYNGYRNESFNSLFFTFVDWWGDAGAL
EAPVLYEGTNIIKERQVNAPYGFMSGDLSTAETDTYMYALSGEWDITDDFRLESEIYYQD
SEYTTDFVAMRTERTAYGLDVDFNDGDGIPGLAFWDDPATDINEADLTDQALWTANQMYD
SGTASEGKALTWTLDGEYFLYDGFIQRVGFGLFYDDRSATDSSRATDGSVVRPFNEYDDG
LVYTTTNFFDGNANFPSSWIVPNGNYLYSNREEFRDIYGFSENSLTLKKNFDIDEVTTAA
YVEADFLTSLGGRDLDGQIGLRYEHAETEMTFFDTTVTPSIMSSADSSNGKLLPSLVARY
HLTDNLMARVAYTETIRRPTFTDLNSFVTYMEDISGVGYGTATGGNPDLEPVESQNLDLT
LEYYFGEGSSVYATWFQRDIEGLVYGSRTAIEFEGSEDIEAGTYIVSQPANTSNGKLDGW
ELGAVYFPENLPAMLDGFGIQASATFLDSSQDIPQFNETGDLTHYINQSIFGVSDLSYST
VFIYEKENFGMRLSYVWRDDFLNNYEAASFAGPLGIYRSPEKSLDFQLSYDVTEDMTVTF
DATNITEEIYQSYYEYPDTYNFGSSLYSRTFALGVRYTF
NT seq
2820 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaacgaacacaccttgccagtgctgtctttttagcaatgtcttgccagatggcc
tacgcacaagaagctcaagacgacgctaattcgaacaatgccgacaattcaagtcaggct
gtagaggttattgaagtttcaggtatccgcagcagcttaaatcaagcccttagtatcaaa
cgccagaacatgcaggttgttgatgctatcgttgctcaggatattggtaaatttcccgat
aacaatgtggttgaagccctacaacgtgtaaccggtattcaggttacagaccgtggagcc
ggtgaagttaatacagtaacgattcgtggtttgacagacgtaaccactaccgtcaacggt
cgtaatctttttaccgcttctggtcgcgctgttgctttggcggatattcccgcggcatta
ttgaaaagcgtcaacgtgtataaaacccgttctgcttctcagattggtagtggcatagct
gggcaaattgatatctctactcagcgtccctttaatttcgatgaaggtaaagtggtagtc
gcagcccgcggcatttatcaggagcaggcagataaaactgaccctcaattaagcttgctg
gctagcgatcgctgggaagttggcggcggtgagtttggcgcattgataaacgtcgcttat
actcgtacaaattatcgtgaccaaagtattacagcgggtgcagtgttacctttcgcaact
gaaaatcccagtgcttctcttgcaaacggcgccgctttcgggccacttcagcgtattttt
cctgccgactgttctcctcagtgttggacccccgggctagataccggattaccctttgct
cctggctcgacacttaatttaaacggtacagaagaagaatattatctttctcgtgacgct
gtgttcggcagtgattttaccggtgagcgggaacgtcctgctgtaaatgtatctttgcag
tgggcgcctgatgatcgttctgtttacacgttcgaagccttttataacggctaccgtaac
gaaagtttcaactctttgttcttcacttttgttgattggtggggcgacgcgggtgcgctg
gaagctcctgtattgtacgagggaaccaacatcatcaaagagcgtcaggtaaatgctcct
tatggctttatgagcggcgatctatcgactgcggaaacagatacctacatgtacgcgcta
agtggtgagtgggacataaccgacgatttccgcctggaatccgaaatttattatcaggat
tctgaatacaccactgattttgttgccatgcgtaccgaacggactgcgtatgggcttgat
gtcgattttaacgacggcgacggtattcctgggctcgcgttctgggacgatccggccaca
gacattaatgaagctgacttaaccgatcaggctctatggaccgcaaaccagatgtatgac
agtggcactgcatcagaaggtaaagctctgacctggaccctggacggcgaatacttcctt
tatgatggctttatacagcgcgttggttttggtttgttctatgatgatcgctcagcaaca
gatagcagcagagcaacagatggttctgtggtccgtccgtttaatgagtacgatgacggt
ttagtttacaccaccactaatttctttgatggaaatgctaattttccttcatcatggata
gtgcctaacggtaattacctctacagcaatcgtgaagagttccgtgatatctatggcttt
agtgaaaattcactgacgcttaaaaagaactttgatatcgatgaagtgactaccgcagct
tatgtggaagcagattttctgactagcctgggcggccgagacctggatggtcaaattggg
ttgcgctacgagcacgccgaaactgaaatgacgttttttgatacgactgtcacgccatca
ataatgagttcagccgatagcagcaatggcaaactcctgcccagcctggtagcccgttat
caccttactgacaacttgatggcacgggtagcttataccgaaaccatccgccgtccgact
tttaccgatttgaattctttcgtgacttatatggaagacatcagtggtgttggatatggt
acagcaacaggtggaaatcctgatctggagcccgttgaatcgcagaaccttgatctaacg
ctggaatattatttcggtgaaggaagttcagtttacgcgacatggttccagcgcgacatt
gaaggccttgtctacggttctcgtaccgccattgagtttgaaggttccgaagatattgaa
gctggaacttacatcgtttctcaaccggcaaatacttcaaatggtaagctggacggttgg
gaattaggagcggtttatttccctgagaatctgcctgctatgctggatggttttggtata
caagccagcgccacattcttagattcaagtcaggatattccacagtttaatgaaacgggc
gatcttacccattacattaaccagtcaatttttggggtttctgacctttcttatagtacg
gtatttatttacgagaaagaaaacttcggaatgcggttgtcttatgtatggcgtgatgat
ttcctcaacaattacgaggcagcctcatttgctggtccattaggtatttatcgtagtcca
gagaagagcttggatttccagcttagctatgatgtgacagaagatatgacagtgacgttc
gatgctactaatatcaccgaagaaatttatcagagctattatgagtatccagatacttat
aactttggtagttctctctacagccgtacttttgcgcttggagtaagatataccttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
