Abyssogena phaseoliformis symbiont: CVPH_0968
Help
Entry
CVPH_0968 CDS
T07717
Name
(GenBank) ATP-binding cassette subfamily B, bacterial
KO
K24821
ATP-binding cassette, subfamily B, heavy metal transporter
Organism
aphf
Abyssogena phaseoliformis symbiont
Pathway
aphf02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aphf00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CVPH_0968
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aphf02000
]
CVPH_0968
Transporters [BR:
aphf02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
CVPH_0968
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_29
ABC_ATPase
RsgA_GTPase
AAA_22
DUF87
AAA_16
AAA_24
nSTAND3
DEAD
Sigma54_activat
ATP-synt_ab
AAA_18
THSD1_N
AAA_33
G-alpha
NB-ARC
MMR_HSR1
Zeta_toxin
nSTAND1
AAA_21
NACHT
KH_2
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBB22928
LinkDB
All DBs
Position
complement(975199..976995)
Genome browser
AA seq
598 aa
AA seq
DB search
MMRGNDKQTQAYDFKTRDVKVLKKLLPYLLKMRVRVVLATMFLIFAKLANVTVPVVLKEI
VDSLDQTNLLLILPLGLLFAYGVLRLASSLFNELRDAIFARVRYHAMHLIALGVFKHLHT
LDLSFHLDRRIGGITRDIDRGTQSVSTLLSIFVFNIIPSFFEICLVIGILWLNYDIFFAG
ISLLTVVFYVGFTLAITTWRMKYRYQMNDMQSEANTNAVDSLINYETVKYFNQEDFEINR
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LLLQLFMPLGSLGIVYRQIKHNFIDMNNMFDLLDRQSEVSSSKEAPKIQVSQGKVEFKCI
SFAYKGKDKVLEDVSFVIESGQKVAIVGQSGSGKSTLAKLLFRFYDVISGEILIDGQNIK
ALNQRSVQSVIGVVPQDTVMFNESIYYNIAYGKQDASRQEVEKVAKLSFIDKFIDKLPQG
YDTLVGERGLKLSGGEKQRLAIARVLLKNPPILIFDEATSALDSYSEKMVQKALKELASK
HTILVIAHRLSTIVDADKIIVLGDGRVQESGTHAQLLESNGEYAKLWQLQVNEKSDEI
NT seq
1797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gttttaaaaaagcttttgccttatttattaaaaatgcgtgtgcgcgttgttttggcaaca
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ggtgaatatgctaaattatggcagttacaagttaatgagaaaagtgatgaaatttga
DBGET
integrated database retrieval system
