KEGG   Abyssogena phaseoliformis symbiont: CVPH_1119
Entry
CVPH_1119         CDS       T07717                                 
Symbol
rnb
Name
(GenBank) exoribonuclease II
  KO
K01147  exoribonuclease II [EC:3.1.13.1]
Organism
aphf  Abyssogena phaseoliformis symbiont
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aphf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:aphf03016]
    CVPH_1119 (rnb)
Enzymes [BR:aphf01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.1  exoribonuclease II
     CVPH_1119 (rnb)
Transfer RNA biogenesis [BR:aphf03016]
 Prokaryotic type
  3'processing and CCA adding factors
   3'processing factors
    CVPH_1119 (rnb)
SSDB
Motif
Pfam: RNB HTH_RNase_II
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBB23046
UniProt: A0A7U3V397
LinkDB
Position
complement(1119072..1120877)
AA seq 601 aa
MINALVAYKGKPARIVSQTMHKFALEFADGSLRSVREKDFRFIHPEFVQVDDACAHADIA
VLEDFQEEILTLEEITQWLFDEYSAKNAWCSCILIEDGLYFYWQKDKVFIRLTAQVKSIQ
TKRDAQIIEAKNLKHCVDNLVNNTFDEQDLPYIEEIEKVALNQSKYAKILANIGIENTPE
SAYKLLLRLDYFKPSFNPYPARHDISKDEKIDVSMAQVERVDLTHLFSYAIDNADSNDAD
DAISIDGDKIWVHVADVSLIATAGSELDAYAQERASNLYLPEQIIHMLPVSATKMYALGL
AETSSALSIGFTLESGEINNIEVLHSLIKVTNISYDDADGMLVSNEHLSRLQGITKAHKQ
YRDNCGAISLNLPNVDVSFKQGQVSITPQSSSQSRELVAEMMVMAGRVVAQFAADNDIVV
PYAIQDEGEFPQETLDNKDALSLSESFKATKFFKRSATSTKYLPHFGLGLKAYLRITSPL
RRYLDLLAHQQLSCFIKGEDILGKEDVKKIIGIYNANMSSVGRTVRSSNDHYKCVYLLDN
PSWQGEGIVVDTRGDKALFMIPELGMMTQIKFKILPKLDEKIALKVTTVNLVDYRANFKA
I
NT seq 1806 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgattaacgctttagttgcctacaaaggtaaacctgcgcgtattgttagtcaaacgatg
cataaatttgcattagagtttgctgatggttctttgcgctcggtacgggaaaaagatttc
cgttttattcaccctgaatttgttcaagtagatgatgcttgtgcacatgcagatattgct
gttcttgaagatttccaagaagagatactaacattagaagaaataacgcaatggttgttt
gacgaatacagtgccaaaaacgcttggtgtagttgtattttaattgaagatggtttgtat
ttttattggcaaaaagataaagtttttatacgcttaactgctcaagttaaaagcatccaa
actaagcgtgatgcccaaattattgaggctaaaaatcttaaacactgtgtggataatctt
gtcaataatacctttgatgagcaagatctgccctatattgaagagattgaaaaagttgca
ctaaaccaatctaagtacgctaagattttggccaatattggtatagaaaatacacctgag
tctgcttataaattattattaagacttgactatttcaagccaagctttaatccctatcca
gcgcgtcatgacatttctaaggatgagaaaattgatgttagcatggcacaagttgaacgc
gttgatttaacgcatttattcagttatgcaatagacaatgctgattcaaacgatgctgat
gacgcaattagtattgatggcgataagatttgggttcatgttgccgatgtatctttgatt
gctactgctggctctgagttggatgcttacgcacaagagcgtgcttctaatttatatttg
cctgagcaaattattcatatgttgcctgtttctgcaacaaaaatgtacgcattggggttg
gctgaaacatcaagtgctttatcgatagggtttactttagaatcaggtgagattaataat
attgaagtgcttcatagtttgatcaaagtgactaatatcagctatgatgatgcagatggg
atgttagtgtctaatgaacatttatccagattacaaggtattacaaaggcgcacaaacaa
tatagagacaattgtggtgcaatcagtttaaacctgccaaacgttgatgttagctttaag
caaggccaagtgtcaattacgccacaaagctcaagtcaaagtcgtgaattggtggctgaa
atgatggtaatggcgggtcgtgttgttgcacaatttgctgctgataatgacattgttgtg
ccttatgcgattcaagatgaaggcgagtttccacaagaaacactggataataaagatgca
ttgtctttatctgagtcatttaaagccacaaagttttttaaacgctcagctacatctacc
aagtatttaccacattttggcctaggtcttaaagcgtatttacgtattaccagtccactt
agaaggtatcttgatttactcgcacatcagcagcttagctgttttatcaaaggtgaagac
atactaggcaaggaagatgttaaaaagattatcggtatttataatgccaacatgtccagt
gttggcagaacagtgcgttctagtaatgaccattataaatgcgtctatctgcttgataat
ccatcatggcaaggtgaaggtattgtggtagacacacgtggtgataaagcgttgtttatg
attcctgaattgggtatgatgacgcagattaaatttaaaattttgcctaagctagatgaa
aagatagcactaaaggtaacaaccgttaatttagttgactaccgtgctaatttcaaggcg
atttag

DBGET integrated database retrieval system