Acyrthosiphon pisum (pea aphid): 100159500
Help
Entry
100159500 CDS
T01076
Name
(RefSeq) endoribonuclease Dcr-1
KO
K11592
endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-]
Organism
api
Acyrthosiphon pisum (pea aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
api00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
api03036
]
100159500
Chromosome and associated proteins [BR:
api03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
100159500
microRNA pathway
RISC loading complex
100159500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ribonuclease_3
Dicer_dsRBD
Dicer_platform
Dicer_dimer
Ribonucleas_3_3
PAZ
Helicase_C
Dicer_PBD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100159500
NCBI-ProteinID:
XP_029341322
APHIDBASE:
ACYPI000864
UniProt:
A0A8R2NLP4
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(119152570..119166532)
Genome browser
AA seq
1717 aa
AA seq
DB search
MALTFDDYVNTKTFTPQEYQVEILSSAKNKNVIISLEGITNKVFVILKLIQELAFKMHRK
SEKRKWTLLVLEEAEVDQYMFSIRHLTDLKPLEIRSVDHSDFINYDVIVTTENLCLEIFE
KNCLHFDQLSLAIFNNCQKIIVENSTYFKICNFIKSNSQCRILGIVHPLFELDSDPLFIE
NQLKFISHKLFSSIETASDIVSLLRSCCKPKEVLIECAVQSEDFPNIGIKSIVQSLTDFL
NDHNYNPENIYGDDEELREELKKIPCPKNVPLQMISEFSDVLKTMGPYCADKVALTLLYR
IENLKVKTPYERHYALLCIVSTLLIQIRAKFDNIFYNYSNIDKVLKFSSPRVLRIINTLK
QFKPKSFNSNNNLAEVCKDQEGNKDKIIKSKSAKRNCKLTRRYYNKTHRKQRQSRDPCEE
NVCAIILVNSKMTASVLYHLFLDLKNSNEEDFGWIEPQYMVDNNADPITEPEEFEIERKT
QENILKRFRQRNCNVLIGTKELETGINLPRCNLVINYNLPLSYKSYLMSKSKARTLDAYY
VLMFDEHATSKILSCCQLYKDINQMLLSHCTLKDIDMEKEIYADRFNWFVSPFKPGKKED
SAFVDMATAIGLVNRYCAKLPSDTFTKLSPIWKIQSIVYENQPMFVCSIRLPINSPIKHE
IHGHPMPCEILAKRIAALEVCRQIYSQGQLDDTLQPITKESFHALFNTDEIIPDTEDSLI
TCKTKDSMPGTYKRRQHYYKRTAEALNDCRPVEGKPCHLYAILLNITCPIPEQENTKSRR
IHPPEESIHGFGILTTKHIPSIPAFPIYPRCGEVYVRLKRIKTDMFLTQHQLDNIATFLN
YTFSNVLCFKKCRVEFNPTTTHNCYYIVPTLRDASGSIDVDWKILDNVQTFRDNKLSIIT
NEDRIHFQPDIEVLKDAVVTPWYRNQEQPEYFYVEEICTHLNPKSPFPDPTEKYKTFEDF
YYHKYSLKIQNLEQPLLDVDPTSARLNFLTPRYMNCKGEYLPTSSDATKRAKRYDLSHKQ
ILVPELCNIHLFPASMWRDAVSLPSILYRINALLLADEIRTIVAKDTSLGLVNLSFDHIW
KPLDFGWPIKDVLIRRKEQKEISTIKVIEPVETVKRFIDEVEKEEKIDELNDPNWMEIGT
WSNDMADFAMNNIDNTTKERYSYPNSLMIQSNSESSTFSDVESDDGIQVNEVKSSSNIDS
SSLLKLPWELNSNTGYGLSDINILLNNTSFMPEDDKCIKNEIYKNNKTIDSINEVNDLQT
ETFSFDFQPDLNYHPGPSPSILLQALTTANAIDGYDLERLETIGDSFLKYAVTAYLYCTH
NNVHEGILSDLRSNHVSNLNLYRLGKLKMFGERMISTKFEPRSNWLPPCYIGPHKLEKAV
INSNISITQHITNDKSIADCVEALIGAYLISCGTRGALLFMSWLGITVLNTLDDSKLGYL
KLPPSPLLRNVNDPEGELTKLMDGFESFEQHLGYYFQDRSYLLQAMTHASYYPNCLTDCY
QRLEFLGDAVLDYLITRHLYEDKRRHPPGALTDLRSALVNNTIFASLAVKNGFHKYLKHL
SPGLSEVVYRFVAIQEENGHTIDEEFCFSGEDDFEDAEDVEAPKVLGDIFESVAGAIYLD
SNMSLDAVWKVYHKIMENEIKQFSKNVPISPVRELLELEPNTAKFSKPEKLVDGRRVRVI
VEILGKGVFKGIGRNYRIAKCTAAKCALNHLKEKIKK
NT seq
5154 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgttaacatttgatgattatgttaatactaaaacatttactcctcaagaataccaa
gttgaaattctgagttcagctaaaaacaaaaatgtaattatttcattagaaggtataaca
aataaggtatttgttattttgaaactaattcaagaacttgctttcaaaatgcacaggaaa
tctgaaaaaagaaaatggactttacttgttttagaagaagcagaagttgatcaatacatg
ttttctatccggcatttgaccgatttaaaaccattagagatcagatcagtagatcattcg
gattttatcaattatgatgtaattgttactactgaaaacttatgcttagaaatatttgaa
aaaaattgcttacacttcgaccagctaagcttagctatattcaataactgccagaaaata
atcgtggaaaatagtacttattttaagatttgtaattttatcaagtcaaatagccaatgt
agaattttaggtattgttcatccattatttgaattggattctgatccattattcattgaa
aatcaattgaaatttatatcacacaaattgttttcgtctatcgagactgccagtgatatt
gtttctttattacgcagctgctgtaaacctaaagaagttctcattgaatgtgctgtccaa
tcagaagatttccccaatattgggataaaatctatcgtacagagtttaacagatttttta
aatgaccataactataaccctgaaaatatatatggagacgatgaagaattgcgtgaagaa
ttaaaaaaaataccctgtcctaaaaatgtacccttacaaatgatatctgaattttcggac
gttttaaaaactatgggcccatattgcgcagataaagttgccttgacactcctgtataga
atagaaaatttaaaagttaaaactccgtatgaaagacactatgctttgttgtgcatagtt
tctacattattgattcaaataagagctaagtttgataatattttttataattatagtaat
atcgataaagtgcttaaatttagttctccacgtgtattacgaatcattaatactctaaaa
caatttaaaccaaaatcttttaattccaataataaccttgctgaagtatgcaaagatcaa
gaaggaaataaagataaaatcatcaaatctaaatcagcaaaacgtaattgtaaattaact
aggagatattataataaaactcatagaaagcaaagacaatcaagagatccgtgtgaagaa
aatgtttgtgcaataattctcgttaacagcaaaatgacagcttctgttttgtatcattta
tttttagatttgaaaaacagtaacgaagaagattttggttggatcgaacctcaatacatg
gtagataataatgcagacccaattactgaacctgaagaatttgaaatcgaacggaaaact
caagaaaatattttaaaaaggtttcggcaaagaaactgtaatgtacttattggaactaaa
gaattagaaacaggaattaatttacccagatgtaatttagtaattaattataatttacca
ctttcatacaaatcatatctaatgtctaaaagtaaggcaagaacattagatgcttactat
gttttaatgtttgacgaacatgctacttcaaagattttatcttgttgtcaactgtataag
gatattaaccagatgttattaagtcattgcactttaaaagatattgacatggaaaaagaa
atctatgctgacagatttaattggtttgtttcaccattcaaaccaggaaaaaaggaagat
tcagcatttgtggatatggcaacagccattggacttgtgaataggtattgtgcaaaacta
cctagtgatacttttaccaaattatctccaatttggaagatacaatcaatagtatatgaa
aatcaaccaatgtttgtgtgtagcattcgtcttccaattaattcacctattaaacatgag
atacatggtcatccaatgccatgtgaaattttagcaaaaagaatagctgcattagaagta
tgtagacagatttattctcaaggtcaactagatgacacccttcaacctattacaaaagaa
tcatttcatgctttgttcaatactgatgaaataatcccagacactgaagattccttaata
acttgcaagactaaggattctatgcctggaacatataaacgccgccaacactattataaa
agaactgctgaggcactgaatgattgtagaccagttgaaggcaagccttgtcacttgtat
gctatattattaaatattacttgtcctataccagaacaagaaaatactaaaagtcgaagg
attcatccgcccgaagaatccattcatgggtttggtatacttacaacgaaacatattcca
agtattccggcatttcccatatatcctcgatgtggtgaagtatacgtgcggctaaaacga
attaaaacagatatgtttctaacacaacatcaattggataatatagctacatttttaaat
tatacattttccaatgtactatgttttaaaaaatgccgtgtggaatttaatccaactact
actcacaattgttattatattgtgcccactcttagagatgcaagtggatcaatagatgtt
gattggaaaatcctagataatgtgcaaacatttagagataataaactaagtattataact
aatgaagatagaatacattttcaacctgatattgaagtattaaaagatgctgttgttaca
ccttggtatagaaatcaggaacaacccgagtatttctacgtagaagagatttgtacacac
cttaatccaaaatcaccatttcctgatcctacagaaaaatataaaacatttgaagatttc
tattatcacaaatacagtttaaaaatccaaaatctagaacaacctcttttggatgttgat
cctacttctgccagactaaattttcttacaccaaggtacatgaattgtaaaggtgaatat
ttacctacaagtagtgatgcaactaaaagagctaaacgatatgatttaagtcataaacaa
attcttgttccagagctttgtaatatacatttatttccagcatcaatgtggcgtgacgct
gtttctttaccatctatattgtatcgcattaatgctttattgttagctgatgaaattcgt
actattgttgccaaggatacatctttaggattggttaacttaagttttgatcacatctgg
aaacctttagattttggatggcctataaaagatgtattaataagaagaaaagaacaaaaa
gaaattagtacaataaaagttattgaaccagttgaaactgttaaacgatttatagatgaa
gtagaaaaagaagaaaagatagatgaattaaatgaccctaattggatggagatagggaca
tggtctaatgatatggctgactttgcaatgaataatattgataatacaacaaaagaaagg
tattcatatccaaatagtttgatgattcaaagcaatagtgaatcaagcacattcagtgat
gttgaatcagatgatggaattcaagttaatgaagtaaaaagtagttccaatatcgatagc
tcatctttattaaaattaccatgggaattaaattcaaacactggttatggactttcagac
ataaatattttattgaataatacttcatttatgcctgaagatgataaatgtattaaaaat
gaaatatataaaaataataaaacaattgatagtatcaatgaagttaatgatttacaaact
gaaacatttagttttgattttcagccagacttaaattatcatccaggaccaagtcctagt
attttacttcaagcactaactacagcaaatgcaattgatggatatgatttggaacgtttg
gaaacaataggagattcgtttttaaaatatgccgttaccgcttacttatactgtacacac
aataatgttcatgaaggaatactgagcgatcttagatcaaatcatgtcagtaatttgaat
ttgtatcgtcttggtaaattaaaaatgtttggtgaacgtatgatatctacaaaatttgag
ccccgtagtaattggctaccaccttgttatattggaccacataagttagaaaaagccgtc
attaattctaatatatcaattactcaacatattactaatgacaaaagtattgctgactgc
gtagaagctttaattggtgcttatttgatatcttgtggtactcgtggtgcattactattt
atgtcttggcttggcataacagtattaaatacattagatgattcaaaattaggttatctc
aaactgccgccttctccacttctacgtaatgttaatgatcctgaaggtgaattaacaaag
ttaatggatggatttgaatcttttgaacaacatttaggatactattttcaagatcgtagt
tatctattacaagcaatgactcatgcttcttattatcccaattgtttaacagattgttac
caacgattagagtttctgggtgatgcagttttggattatttaattacacggcatttatat
gaagacaaaagaagacatccacctggagctttgacagatcttcgttcagcactagttaat
aatacaatatttgcatcccttgctgttaaaaatggttttcataagtatttaaaacattta
tctccgggtttgtctgaagttgtttatagatttgtagctatccaagaagagaatggtcat
actattgatgaagagttctgtttctcgggagaagatgattttgaagatgctgaagatgtt
gaggcaccgaaagtccttggtgatatttttgaatcagttgcgggtgcaatttatttggat
agtaatatgtcattagatgcagtatggaaagtttatcataaaataatggaaaatgaaata
aaacagtttagtaaaaacgtaccaatatctcctgtcagggagcttctagaattagaacca
aatactgctaaatttagtaaacctgaaaaattggtggatggtcgacgtgtccgggttata
gttgaaatacttggcaaaggagtatttaaaggcattggtcgtaattatagaatcgcaaaa
tgcacagcagccaaatgtgctttaaatcatctaaaggaaaagataaagaaatag
DBGET
integrated database retrieval system