Acyrthosiphon pisum (pea aphid): 100166428
Help
Entry
100166428 CDS
T01076
Name
(RefSeq) endoribonuclease Dicer isoform X1
KO
K11592
endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-]
Organism
api
Acyrthosiphon pisum (pea aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
api00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
api03036
]
100166428
Chromosome and associated proteins [BR:
api03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
100166428
microRNA pathway
RISC loading complex
100166428
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ribonuclease_3
Ribonucleas_3_3
Dicer_dimer
Helicase_C
PAZ
ResIII
DEAD
Dicer_platform
Dicer_dsRBD
dsrm
Phage_DsbA
Topo_C_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100166428
NCBI-ProteinID:
XP_001945890
APHIDBASE:
ACYPI007300
UniProt:
A0A8R2FDC6
LinkDB
All DBs
Position
A2:65477666..65520009
Genome browser
AA seq
1691 aa
AA seq
DB search
MDQPPKDTSEIVPRKYQLELLEDCKKANTILYLPTGSGKTYIATMLVKSMGDCLTKPIGQ
GKKWTFFIVQSVPLVSQQAGNLRRHLPWNIGTFSGDMNVDFWSQQQWNEILEKCHILVMT
AQIYLNNLRHGYMHIKDANLLIFDECHHAVALHPFKQIMQVLHDTDLKTDERPRILGLTA
TLINANTKNVKEELTKLQITFNATIKTRYDDNIQIFSARPKEFIRLYDEYILDDEIKAIV
KRLNTNTCNLRKIQAPMKIEPIKENNETYYLEYQKQASKNFANYFLDIEANLVDGGAYIA
YLVTWHFMVEIEKKRKICTDAKRLTIMSLVLSELTITRKMLYDYMNKHLIIHKGHSTKLH
NTSPKLKKLIEILSSIKLTDTCLVFVDRRTTAKILYHYIKDYIEEFNQVNIVCEFIVGAR
GIFSPDCKEMVYKKQQNNDIIKKFNDNVINVLITSEVLEEGVDIQTCNYVIRYDSPKNFP
SYIQSKGRARSTDSKFILMVPNQLKFQKTQTEYNKMEEEIVKLLVDNDIDDENNDEKMTE
VFHTETDRALLTHEIAISIINRYCYSLPQDRFTDLSPEWYMAQNHNMSKKYKLKLPINSV
IKTPIDGLFCTNKKNAKKSAAFNACIALYKIGALDENLMPINIKNTAIFNDLKWFPHWDE
GDVEATKYKLKAGTNKMKRMVHIESPTYLHGSYPQVNQSSYLHVLHCVPDYIKLEESKYE
TFDKLLRSNEEFGILTSNKLPQVSNFPIFLPFGNVNVSIEVNVEILYLDHKSHKELENFH
NKLFVDVLGVKDFIARSYDNGDNSYLVVPILSTDNIYNVDWNVINVSKFVETEEPTMEQR
KSKFYEEYLKTPNVISPWYRNIVPVQRYIVTDVYWDMTPESSFPTSEYDTYATYFSDKYS
IQVAHKNQPMIKVKSLGVSKINYLVPRISTGKIDKRSEYIEILVPEFCTWHKFPSVYWLK
ALMLPTLLYRLDKLLLAEDLLVKINSLCNIEVEDNANKDTVMIDNFSGNHEGKKKNIILP
ISETLKYLENSHDNNMVDEWNSNNFPIDIERQKNTTMLDVLNYHTFMYAINKSKSNESID
SQKSKSSSLNEFISKSKHKSPDGKSKHITECKKRRLSSYNKEQIEEINTFMIQSKPEPMI
FQKLVELNIVNFVEMNDILKNVLTEMNTLNLTNNSPPKLSSLSIEVSKQNIGPKQSDILK
VITPPFANDMFNYERMETYGDSFLKFAVSLVLFDAFPSDNEGVLTELKMKLVGNRNLLYV
GRNLNLGSYLVVNVFDPNMDWIPPCFGVPIKLKEIIEEGNFQSDVLHQITIPRDNQTTGI
LSDETWIEIETELLKFKRLSDMPISDSDEEDGIPQIGHSQSDLFLHKQSVSDKMVADCVE
SLIGTYVYKRGVEVGFKVLQGLGIIPKQFIDTFKPKPIDDLYDGLDFSKILPGYELLERR
IGYSFKHKHLLAQALTHPTYQFGFSECYQRLEFLGDAILDFLITTYIIEHCYHKTPGEIT
DIRSSLVNNITFASLSARIGLHRFILAKSVQMTEAIDRFYEHQQKNNHKIGQEVLYLIEE
SDCYAAESVDVPKVLGDLFESLIAAIYLDCNRDLNFVWAICYRFLEKEIKEFCDNVPKNP
IRILHETKLQPNFSKPDASDKAADKGLGTMMRLEIMLNNKIMRIYGFGQNKKEAKVAAAK
MALKNMKKMLS
NT seq
5076 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccaaccaccaaaggatacttcagaaatagttcctcgaaaatatcaacttgagctt
ctagaggattgtaaaaaagcaaacactattttatacctaccaactggaagtggcaaaaca
tacatagctacaatgcttgttaaaagtatgggcgattgtttaactaaaccaataggtcaa
ggaaaaaaatggacattctttattgtccaatctgtaccacttgttagccaacaagcaggt
aatttaagaaggcatttgccatggaatataggaacatttagtggtgatatgaatgttgac
ttttggtctcaacagcaatggaatgaaatattagagaaatgccacattctggttatgact
gctcaaatttatttgaataatctgcgtcatggctacatgcatatcaaggatgctaatctt
cttatttttgatgaatgccatcatgctgtagcattacatccattcaaacaaataatgcaa
gtacttcatgataccgatttaaaaactgatgaacgtccccgtattcttggacttactgct
actttgatcaacgctaataccaaaaatgtcaaagaagagttaactaaattgcaaataaca
tttaatgccactataaagactagatatgatgataatattcaaattttttcagcacgtcca
aaagaattcataaggttatatgatgagtatattttggatgatgaaattaaagctattgtg
aaaagattaaacacaaatacttgtaatctgagaaaaattcaggctcctatgaaaattgaa
ccaattaaagaaaataatgaaacttattatttggagtatcaaaaacaagcttcaaagaat
tttgccaattatttccttgatatagaggcaaatcttgttgatggaggagcgtatatcgcg
tatttagttacatggcattttatggttgaaatagaaaaaaaaagaaaaatatgtacagat
gcaaaaagacttactattatgtctttggtattatcagaattaacaataactcgtaaaatg
ttgtacgactacatgaataaacacttaattattcacaaaggtcattcaactaaattacac
aatacgtctcctaaactgaaaaagttaattgaaattttatcttctattaaactcactgac
acttgtttagtatttgttgatcgccgaacaactgctaaaattttatatcattatatcaag
gattatattgaagaatttaatcaagtaaatattgtatgcgagtttatagttggtgcaaga
ggaatatttagtcctgattgcaaagaaatggtgtataaaaaacaacaaaataatgacatt
attaagaagtttaacgataacgttattaatgttctcataacatcagaagtactagaagaa
ggggttgatattcaaacttgcaattatgttattagatatgactctcctaaaaattttcct
tcttatatacaatctaaaggaagagctcgttctactgatagtaaatttattttaatggtg
ccaaatcagttgaaatttcaaaaaactcaaactgaatataataaaatggaagaggaaatt
gtaaaactattggtagacaatgacattgatgatgaaaataatgatgaaaagatgacagaa
gtttttcatactgagactgaccgtgctttattaactcatgaaattgctataagtattatt
aataggtactgttattctttaccacaagatcgattcacggatttgagtccagaatggtat
atggcgcaaaatcataatatgtctaaaaaatacaaactaaaactgcctattaatagtgtt
attaagactcctattgatggattattttgtacaaataaaaaaaatgctaaaaaaagtgca
gcatttaacgcgtgcattgcattatataagattggagcattagatgaaaatctgatgcct
ataaatattaaaaatactgcaatatttaatgatttaaaatggtttccacattgggatgaa
ggagatgttgaagcaactaaatataaattaaaagcgggaactaataaaatgaagagaatg
gtgcatatcgaaagtccaacatacttacacggatcttatccacaagtaaatcaatcatca
tatttacatgttcttcactgtgttcctgattacattaaactggaagaaagtaaatacgaa
acatttgataaattattaaggtcaaatgaagaatttggaattttaacatcaaataaacta
ccacaagtatcaaattttcctatatttttaccttttggtaatgtgaatgttagcatagaa
gtaaatgttgaaatattgtatcttgaccacaaaagtcataaggaactagaaaatttccat
aacaaattatttgtggatgtgttgggtgtaaaagattttattgcaagaagttatgacaat
ggagataattcatacttagtagtacctattttgtctacagataatatttataatgtggat
tggaatgttatcaatgtaagcaaatttgttgaaacagaagaacctactatggaacaaaga
aaatcaaaattttatgaagaatatctcaagacacctaatgtaatttcaccgtggtacaga
aacatagtaccagtacaaagatatattgtcactgatgtttactgggatatgacacctgaa
agttcttttccaacttctgagtatgatacttatgcaacatactttagtgataagtatagc
attcaggttgcccataaaaatcaacctatgattaaagtaaaatcattaggagtgtcaaaa
attaattatttagttcccagaatttctactggtaaaattgataaacgaagtgaatacatt
gagatacttgtaccagaattttgtacttggcataaattcccatcagtttattggttaaaa
gctttaatgctgccaactttattatatcgattagataagttattactggctgaggatctt
cttgtaaaaattaattctttatgtaatattgaagtagaagacaatgcaaacaaagacaca
gtaatgattgataattttagtggtaatcatgaaggcaaaaagaaaaatattatattgcca
ataagtgaaacattaaaatacttagaaaactcccatgacaataatatggttgatgagtgg
aattcaaacaattttccaattgatattgaaaggcaaaaaaacacaacaatgttggatgtt
cttaattatcatacatttatgtacgctataaataaatccaagagtaatgaaagtattgat
agtcaaaaatcaaaatcatccagtttaaacgagtttatatcaaaatcaaaacacaaatca
ccagatggaaaatcaaagcatataacggagtgcaaaaaacgtagactttcatcatataat
aaagaacagattgaagaaatcaatacatttatgatacaatcaaagccagaacctatgatt
tttcaaaaattagttgaactcaacatcgttaacttcgttgaaatgaatgatatactaaaa
aatgtgttaactgagatgaacactttaaatttaacaaataattcaccaccaaaattgagt
tctctgtccatagaagtctcaaaacaaaatatcggaccgaaacagagtgatattttaaag
gttataacaccaccatttgctaatgacatgtttaattatgagcgcatggaaacatacggc
gatagtttcctgaaatttgctgtatcattggtattatttgatgcgtttccatcagataat
gaaggagttcttactgaattaaaaatgaaattggttggtaatcgaaatttgttgtatgtt
ggcagaaatttaaatcttggatcttatttagtggtaaatgtttttgacccaaacatggat
tggatacctccatgctttggtgttcctataaaattaaaggaaatcattgaggagggaaat
tttcaatcagatgtacttcatcagataaccattcctagagacaatcaaactaccggaata
ttatcagatgaaacttggattgaaattgagactgaactcttaaaatttaagcgattgtct
gatatgccaatatcagatagcgacgaagaagatggtataccacaaattggtcattcacaa
tctgatctatttctacacaaacaatcagtatcagataaaatggttgctgactgtgttgaa
tcattgattggtacatatgtatataaacgtggagttgaagttggctttaaggttctccaa
ggtttgggtattataccaaaacaattcattgatacatttaagcctaaaccaattgatgat
ttatatgatggattagatttttcaaaaattttgcccggatatgaattacttgaacgaaga
attggttactcatttaaacataagcatctattagctcaagctctaacccatccaacctac
caatttgggttttctgaatgttatcaacgacttgaatttcttggtgatgctatacttgat
ttcttgattacaacatatataatagaacattgttatcacaaaactcctggtgaaataact
gatattagatcttcgctagtaaacaacataacatttgcttcattgagcgcaagaattgga
ctgcatagattcattttagcaaagtctgtacaaatgactgaagcaatagatcgtttttat
gaacatcaacaaaaaaacaatcataaaattggccaagaagttttatatctaatagaagaa
agtgattgttatgcagctgaatctgtagatgtaccgaaagtattgggagacttatttgag
tcactaattgctgcaatttatttagactgcaacagagatttaaattttgtatgggctatt
tgctatagatttttggaaaaagaaatcaaagaattttgtgacaatgttcctaaaaatcct
atacgtattttacatgaaactaaattacaaccgaatttcagtaaacctgatgcttctgac
aaggcagcagataaaggcttaggaacaatgatgaggttagagataatgttgaacaacaaa
atcatgagaatatatggatttggtcagaataaaaaagaagctaaggttgccgctgccaaa
atggcgttaaagaatatgaaaaaaatgttatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
