KEGG   Apibacter sp. B2966: G8C43_00520
Entry
G8C43_00520       CDS       T06471                                 
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
apib  Apibacter sp. B2966
SSDB
Motif
Pfam: SpvB TcdB_toxin_midN FG-GAP_3 FG-GAP RHS_repeat RHS DUF7383
Other DBs
NCBI-ProteinID: QII71313
LinkDB
Position
127321..137310
AA seq 3329 aa
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DBGET integrated database retrieval system