Apibacter sp. B2966: G8C43_08180
Help
Entry
G8C43_08180 CDS
T06471
Name
(GenBank) HAMP domain-containing histidine kinase
Organism
apib
Apibacter sp. B2966
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HATPase_c_5
HisKA
HATPase_c_2
Rtt106_N
AvrB_AvrC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QII72745
LinkDB
All DBs
Position
complement(1910056..1911492)
Genome browser
AA seq
478 aa
AA seq
DB search
MYKRFPLSLRIFLVMILVEVSTIFAMGLITFYQYIRIAEEYNNKRLERKEQLIIETFDYL
ISNRNTKPEEVKNKIGNKIYEISDINNIDINFYSLDGKYILGNKLPNPKTEFVPKEILKN
LNVNNDRIEVINKLPNSEESFTSVYRYIYNNDYQPITIINFPFLHDEAFLKKDFYSLLYR
YLVIMLIVLIVSGIFSWFFSLTLTRKIKDIAYRLRDTGALTHNRPLLYNYIDEVSPLVKA
YNIMLNKFREQTDALVKKEKDNAWQEMARQVAHEIKNPLTPMRLEIQSFQLRFNPEDPQI
HEKLDSLTRSLIQQIDTIASIAGAFSDFAKMPLKKDEKLNVIEVAKISLEIFPSQQISLD
TLDELVILNIDPNLLNRILTNLIKNAFQSIPEGRTPHIIVKIRQDIRMVYFSVIDNGNGI
PEEIKGKIFTPQFSTKTSGSGLGLAIIKKLIEEYNGSITFVSEEGKGTIFKFEIPKGE
NT seq
1437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacaaaagattcccattatccttgcgaatttttttagtgatgatccttgttgaggtc
agcactatatttgccatgggattgataactttttatcaatatataagaattgcagaggaa
tataacaataaaaggctagaaagaaaggaacaattaattatagaaactttcgattatctc
atttccaatcgaaatacaaaaccggaggaggttaaaaataaaattggcaataaaatttat
gaaatttcagatattaataatatcgatataaatttttattctctggatggaaaatatatt
ttagggaataaattacccaatcctaagactgaatttgttcctaaagaaatcttaaaaaat
ctgaatgtaaataacgaccgtatagaggttataaacaagcttcccaattcagaagaaagt
tttacgtccgtatatagatatatttacaacaatgattatcaacctattacaattataaat
tttccttttttacatgatgaagcatttctaaaaaaagatttttattccttattatacaga
tatttagttatcatgcttatcgtattaattgtaagtggtattttttcatggttcttttca
cttactttaaccagaaaaattaaagatattgcttatcggcttagggataccggcgcactt
actcataatagaccccttttatataattatattgatgaagtgagtccattggttaaagct
tacaatattatgctgaataaatttagagagcaaactgatgcactggttaaaaaagaaaaa
gataatgcttggcaggaaatggcgagacaggtggctcatgaaattaaaaatccgcttacc
cctatgcggctcgaaattcaaagttttcaattaagatttaatccagaagatccacaaatt
catgaaaagttggattcattaacccgttcattaatacaacaaatagatactattgcctcg
attgccggtgcattttcagattttgcaaaaatgcctctaaaaaaggatgaaaaattaaac
gtaattgaagttgctaaaatttcgttagaaatatttccatctcaacaaatttcacttgat
acacttgatgaattggtcattttaaatattgatcctaatttattgaaccgcatattaacc
aatttaattaaaaacgcttttcaatcgataccggaaggaagaactccccatattattgta
aaaatcagacaagacatacgaatggtttatttttctgttattgataacggaaatggaatt
ccggaagaaataaaaggcaaaatttttactcctcaattttcaactaaaaccagtggaagt
ggtttaggtttagctataattaaaaagctaattgaagaatataatgggtctataaccttt
gtgtctgaagaagggaaaggaactattttcaaatttgaaatccctaaaggtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system