Apibacter sp. B2966: G8C43_09435
Help
Entry
G8C43_09435 CDS
T06471
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
apib
Apibacter sp. B2966
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_1
TPR_8
TPR_17
TPR_19
TPR_14
ANAPC3
TPR_12
TPR_16
TPR_6
TPR_CcmH_CycH
RMD1-3
TPR_9
CFAP70_TPR_C
TPR_11
TPR_7
ARM_TT21_C
CFAP70_mid_TPR
ARM_TT21_4th
NatA_aux_su
TPR_15
CABIN1_N
ARM_TT21_5th
ChAPs
TPR_Psidin_N
PRP6_TPR
Fis1_TPR_C
CNOT10_TPR
TPR_YpiA_C
PHD_4
TPR_INTS8_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QII72973
LinkDB
All DBs
Position
complement(2202367..2203743)
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MEDFFDNELVNMFEEMLEENKSVYFEADEFCEIISFYLEIYDFEYAIKALDIAFSLYPNN
IDIKIKQLEYFVKIEDLHNAFDLIEELKELCFADTDYLIATAKYWSLRNFPYKSIDFYKA
ALKNEEDEDYIYNCLGHEYLEIKEPTFALNSFKKALEYNKNDEYSLFSCIHCYDILHQHR
ECITFLNQYIDVNPYSDEAWFQLGLQYLNQNWYDKALFAFDYTVIINPKSIAGYTQKAFC
YEKLNQWEKAISVYNESLDFDDTAAFTLFKIGQAYNKLRKPIQALTSFQKAVKEDPQFDK
AWYEISDIYDSLGNNEEALHYIKKALDIESKEVNYWKKYAYLNIQLGKYEEASDSFEIII
ELEPNHFYNWLAFSELLISLGDYSKAALLLHKSFKNFHKAELYYQLSNCYFLLKNYEKSE
KFLKMALKLNPSIKQEMQEKYSILLRDNTIKYKNPGII
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaagatttttttgacaatgagctggtaaatatgttcgaagaaatgttggaagaaaat
aaatccgtttattttgaagcggatgagttttgcgaaattatttctttctacttggagatt
tatgattttgaatatgctattaaagctcttgatattgcattttctctatacccaaacaat
attgatattaaaattaaacagctcgaatattttgttaaaatcgaagatttacataatgct
ttcgatttaatcgaagaattaaaggaattatgttttgctgatactgattacttaattgct
actgcaaaatattggtctttgcgtaattttccttataaatctattgatttctacaaggcg
gcattaaaaaatgaagaagatgaagattatatttataattgtttaggccatgaatatctt
gaaattaaggagcccacgtttgctttaaattcatttaaaaaagcattagaatataacaaa
aacgatgagtattccttattttcttgcatacattgttacgatattttacatcagcataga
gaatgtataacttttttaaatcaatacattgatgtaaatccttattccgatgaagcttgg
tttcaattgggattacaatacttaaatcagaattggtatgataaagctttatttgctttt
gattatacagttataattaaccctaagagcattgccggatatactcaaaaagccttttgc
tatgaaaaattaaaccaatgggaaaaagcgataagtgtttataacgagtctttagatttt
gacgatacggctgcttttactctttttaagattggacaggcttataataagcttcgtaaa
cctatacaagcgcttacctcttttcaaaaagcagttaaagaagatcctcaatttgataaa
gcttggtatgaaatctctgacatctatgattctttaggtaataatgaagaagcacttcac
tacataaaaaaagctctggatatagaatctaaagaggttaattattggaaaaaatatgct
tacctcaacattcagcttggaaaatatgaagaagcttctgattcgtttgaaataattatt
gagcttgaacccaatcatttttataattggttggctttttccgaattactcatcagtttg
ggggattatagtaaggccgcattactattgcataaaagttttaagaattttcataaagca
gaactctactatcaactaagcaactgctatttcttattgaagaattatgaaaagagtgaa
aaatttttaaaaatggcactaaaattgaatccttccattaaacaagaaatgcaggaaaaa
tactcaattttacttagggataacacaattaaatataaaaatcccggcattatttaa
DBGET
integrated database retrieval system