Candidatus Annandia pinicola: GFK87_00081
Help
Entry
GFK87_00081 CDS
T07601
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
apin
Candidatus Annandia pinicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
apin03032
]
GFK87_00081 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
apin03400
]
GFK87_00081 (gyrA)
Enzymes [BR:
apin01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
GFK87_00081 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
apin03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
GFK87_00081 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
apin03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
GFK87_00081 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG80314
LinkDB
All DBs
Position
84646..87180
Genome browser
AA seq
844 aa
AA seq
DB search
MIKKKKNIININIEKELKQSYLDYAMSVIIGRALPDIRDGLKPVHRRIIYAMKMMGNDYN
KNYKKSARIVGDVIGKYHPHGDIAVYDTIVRMAQSFSLRYTLIEGQGNFGSIDGDSAAAM
RYTEIRMSKISHELLKDLEKNTVNFIKNYDNTEFIPEVLPTRIPNLLINGSTGIAVGMAT
NIPPHNIKEIINGCIACIENKNIKIKELMKYIKGPDFPTAAIVNSCIGIKKAYRTGKGKI
LIRANHIIEINKKTNIKSIIINELPYQVNKAKLIEKINSLVKNKNIEGIFNLRDESDKDG
MRILINLKKHTSSKIVLNNLHSLTKLQIYFGINMVALNKGKPQTLNLKEIIDCFLQHRKE
IVINRSIFELKKIKKNIHKLKGLIIAIFNIEKIINLIKNTNEIKSVKKKLISEKWYIKNN
DKIKLLLNKNIYDSFIINNKNKKYYLTYEQVKSILDLKLYKLTNLEYSNLLKEYYKLKLK
SRNLKKIIKCKKKLMFVIKEELLKIKNDFGDKRKTKIKNFKFNLKQEDLIQKEDVVITLS
NKGYIKYQLLSLYVAQHRGGRGKIAVKVKNQDFIEKLLVTNTHNTILCFSSFGIIYWLKV
NQLPKSDRYSVGKPIKKFLNLKNNEKITAILSMSFYSNIFKKKIYIFMATSWGIVKKTLL
TAFMRPRCNGIRAIKLNKNDKLAGVSLVKDNNNIMLFSSYGKVVRFIEKEVRVTGRVSTG
MIGMKLNNNDKIVSLIIINNKKINSTILTITEKGYGKRTNIINYPIKSRATKGVVSIKVN
KRNGLVVSSTEVLNNDQVMIITNMGILLRIKVIEIKVIGRNTQGVILIKTLNKENVVSLQ
KISL
NT seq
2535 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaaaaaaaaaaatataataaatataaatatagaaaaagaattaaaacaatca
tatttagattatgcaatgtcagttataattggcagagcattaccagatataagagatggg
cttaaacctgttcatagacgtattatttatgctatgaaaatgatgggtaatgattataat
aaaaactataaaaaatctgcaagaatagttggtgatgttattggaaaatatcatcctcat
ggagatatagctgtttatgatactatagtacgtatggcacaatctttttcattaagatat
actttaattgaaggtcaaggaaactttggatctattgatggtgattctgcagcagcaatg
cgttatactgaaataagaatgtcaaaaatatctcatgagctattaaaggatttagaaaaa
aatactgtaaattttattaaaaattatgataatactgaatttattccagaagttttacca
actagaatacccaatttacttattaatggttctactggtatcgcagtaggaatggctact
aatattccacctcataatattaaagaaataattaatggctgtattgcttgtattgaaaat
aaaaatattaaaattaaagaattaatgaaatatattaaagggcctgattttcctactgct
gcaattgttaatagttgtataggtattaaaaaagcttatagaactggtaaaggtaaaatt
ttaataagagcaaatcatataattgaaataaacaaaaaaactaatataaaatcaataatc
attaatgaattaccttatcaagttaataaagcaaaattaatagaaaaaataaatagttta
gtaaaaaataaaaatatagaaggaatatttaatttaagagatgaatctgataaagatggt
atgcgtatattaattaatcttaaaaaacatacatctagtaaaattgtattaaataattta
catagtttaactaaattacaaatttattttggaataaatatggttgctttaaataaaggc
aaaccacaaactttaaatttaaaagaaattatagattgttttttacaacaccgtaaagaa
atagtaataaatagatcaatttttgaattaaagaaaataaaaaaaaacattcataagtta
aaaggattaattatagctatttttaacatagaaaaaataataaatttaataaaaaataca
aatgaaattaaatcagtaaaaaaaaaattaatatcagaaaaatggtatattaaaaataat
gataaaattaaattgttattaaataaaaatatatatgatagttttattataaataataaa
aataaaaaatattatttaacttatgaacaagttaaatctattctagatttaaaattatat
aaattaactaatttagaatattcaaatttattaaaagaatattataaattaaaattaaaa
tctagaaatttaaaaaaaattataaaatgtaaaaaaaaattaatgtttgttataaaagaa
gaattattaaaaataaaaaatgattttggggataaaagaaaaacaaaaataaaaaatttt
aaatttaatttaaaacaagaagatttaattcaaaaagaagatgtagttataactttatca
aataaaggatatattaaatatcaattgttatcattatatgttgcacaacatagggggggt
agaggtaaaatagctgttaaagttaaaaaccaagattttattgaaaaattattagtaact
aatactcataatactattttatgtttttcaagctttggtattatatattggttaaaagtt
aatcaattaccaaaatctgatagatattctgtaggaaaaccaattaaaaaatttttaaat
cttaaaaataatgaaaaaataacagctattttatctatgagtttttattctaatatattc
aaaaaaaaaatatatatatttatggcaacatcttggggtattgtaaaaaaaacattatta
acagcatttatgcgtcctagatgtaatggtattagagctataaaactaaataaaaatgat
aaactggcaggagtttctttagttaaagataataataatataatgttattttcttcttat
ggtaaagttgttagatttattgaaaaagaagttcgtgtaactggtagagtatctacagga
atgataggtatgaagttaaataataatgataaaatagtatctttaattattatcaataat
aaaaaaataaatagtacaattcttacaataacagaaaaaggttatggaaaaagaactaat
attattaattatccaattaaatccagagcaactaaaggtgttgtttctataaaagttaat
aaaagaaatggtttagtagttagttcaacagaagttttaaataatgatcaagttatgata
attacaaatatgggtatattattaagaattaaagttattgaaattaaagttattggtaga
aatacacaaggtgttatattaattaaaactttaaataaagaaaatgtagttagtttacaa
aaaatatctttataa
DBGET
integrated database retrieval system
