Candidatus Annandia pinicola: GFK87_00235
Help
Entry
GFK87_00235 CDS
T07601
Symbol
rpsA
Name
(GenBank) 30S ribosomal protein S1
KO
K02945
small subunit ribosomal protein S1
Organism
apin
Candidatus Annandia pinicola
Pathway
apin03010
Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apin00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03010 Ribosome
GFK87_00235 (rpsA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03011 Ribosome [BR:
apin03011
]
GFK87_00235 (rpsA)
Ribosome [BR:
apin03011
]
Ribosomal proteins
Mitochondria/ Chloroplast
Small subunit
GFK87_00235 (rpsA)
Bacteria
GFK87_00235 (rpsA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S1
S1_RRP5
Spt6_S1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG80444
LinkDB
All DBs
Position
229731..231305
Genome browser
AA seq
524 aa
AA seq
DB search
MIKKDNYFAELFYENTKKKKIYIGSVIKGKIFNINKNNVIVDTGLKSESYIPIDEFKNIN
GDIEVKIGEIIDVVLDVIEDGYGITILSREKAKKFSSWLFLEESKRQDKHIKGIISSKVK
GGFNININGIQAFLPGSLIDMKSIKDPLFLEGMYISIKVVKIDKIRNNIVVSRKNTIDKK
YLKKNKALKDVIEGKEIIGIIKNITEYGAFIDLGGIDGLLHITDISWKRIQHPNDILNPG
EYVKLKVLKFDRINSKMSLGLKQLTDDPWKRIKNIYPKKTKILGKVTNITEYGCFVEIKE
GIEGLVHTSEIDWVNKNVNISKILKLNDKVEVIVLSIDKPRKRISLGIKQCISNPWYQFS
KIYNLGDKIEGYIKSITSFGIFVSLENQLDGLIHISDISWKPYNSKILSKYKKGDKISVI
LLNIDIKKERISLGIKQIEYNPVSDYMSSREINSTIEGKIIRIDNNGIILELEKNVKTHI
ESSEILDKDYYKENIYYKNSLKLKLLGIDHKKQTIKTSIIKKKK
NT seq
1575 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaagataattattttgctgaattgttttatgagaatacaaaaaaaaaaaaa
atatatattggttctgttataaaaggaaaaatatttaatattaataaaaataatgttata
gttgatacaggattaaaatcagaatcttatatacctatagatgaatttaaaaatattaat
ggtgatattgaagttaaaattggagaaataattgatgttgtattagatgtaattgaagat
ggttatggaataaccatactttctagagaaaaagcaaaaaaatttagttcttggttattt
ttagaagaatctaaaagacaagacaaacatataaaaggaataattagtagtaaagtaaaa
ggtggttttaatataaatattaatggaatacaagcatttttaccagggtctttaattgat
atgaaatctattaaagatcctttatttttagaaggtatgtatatatcaataaaagttgtt
aaaatagataaaataagaaataatattgttgtttcaagaaaaaatactatagataaaaaa
tatttaaaaaaaaataaagcattaaaagatgttatagaaggaaaagaaataataggtatt
attaaaaatataactgaatatggggcctttatagatttaggtggtatagatggattatta
catataactgatatttcttggaaaagaattcaacaccctaatgatattttaaatcctgga
gaatatgttaaacttaaagtattaaaatttgatagaattaattcaaaaatgtctttaggg
ttaaaacaattaacagatgatccttggaaacgtattaaaaatatatatccaaaaaaaact
aaaattttaggaaaagttactaatataacagaatatgggtgttttgtagaaattaaagaa
ggtatagaaggtttagtacatacttctgaaatagattgggttaataaaaatgtaaatata
tcaaaaatattaaaattaaatgataaagtagaagttattgtattaagtatagataaacct
cgtaaaagaatatcattaggtattaaacaatgtataagtaatccttggtatcaattttct
aaaatttataatttaggagataaaattgaaggatatattaaatcaataacttcttttggt
atatttgtatcattagaaaatcaattagatggtttaatacatatatctgatatttcatgg
aaaccttataactcaaaaattttaagtaaatataaaaaaggagataaaatatcagttata
ttattaaatatagatataaaaaaagaaagaatatctttaggaattaaacaaattgaatac
aatccagtaagtgattatatgtcttctcgtgaaattaatagtacaatagaaggcaaaatt
ataagaatagataataatggtattattttagaattagaaaaaaatgtaaaaactcatata
gaaagttctgaaattttagataaagattattataaagaaaatatttattataaaaatagt
ttaaaattaaaattattaggaattgatcataaaaaacaaactattaaaacatctataatt
aaaaaaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
