Candidatus Annandia pinicola: GFK87_00287
Help
Entry
GFK87_00287 CDS
T07601
Symbol
rplE
Name
(GenBank) 50S ribosomal protein L5
KO
K02931
large subunit ribosomal protein L5
Organism
apin
Candidatus Annandia pinicola
Pathway
apin03010
Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apin00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03010 Ribosome
GFK87_00287 (rplE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03011 Ribosome [BR:
apin03011
]
GFK87_00287 (rplE)
Ribosome [BR:
apin03011
]
Ribosomal proteins
Mitochondria/ Chloroplast
Large subunit
GFK87_00287 (rplE)
Bacteria
GFK87_00287 (rplE)
Archaea
GFK87_00287 (rplE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ribosomal_L5_C
Ribosomal_L5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG80489
LinkDB
All DBs
Position
complement(279810..280382)
Genome browser
AA seq
190 aa
AA seq
DB search
MDLILYKWKYMEINLKKFYKNNVIKKIMLKSYYYSVMQVPRLIKIILNIGIGSNFNDKKT
LNYALSDLTAITGRKPIITKTKKSIAGFKIRKGFPIGCKVTLRKNIMWEFLKKLIHIAIP
RIRDFRGLSKKSFDGYGNYNLGIKEQIIFPEINYNKIDRIRGLDINIITTAKNNNEAFNL
LSELNFPFRK
NT seq
573 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttaatattatataaatggaaatatatggaaataaatttaaaaaagttttataaa
aataatgtaattaaaaaaataatgttaaagtcatattattattcagttatgcaagtaccg
agattaattaaaattatattaaatataggtattggaagtaattttaatgataaaaaaact
ttaaattatgcattatctgatttaactgctattacagggagaaaaccaataataactaaa
acaaaaaaatctatagctggttttaaaataagaaaaggatttcctattggttgtaaagta
acattaagaaaaaatattatgtgggaatttttaaaaaaattaatacatattgctatacct
cgtattagagatttccgtggtttatctaaaaagtcctttgatggttatggtaattataat
ttaggaattaaagaacaaataatatttccagaaattaattataataaaattgatcgtatt
aggggtttagacattaatattataactactgctaaaaataataatgaagcatttaattta
ttatctgaacttaattttcctttccgtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system