Candidatus Annandia pinicola: GFK87_00319
Help
Entry
GFK87_00319 CDS
T07601
Symbol
mnmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase MnmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
apin
Candidatus Annandia pinicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
apin03016
]
GFK87_00319 (mnmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
apin03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
GFK87_00319 (mnmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
GFK87_00319 (mnmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Ras
Roc
Dynamin_N
Arf
AAA_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG80512
LinkDB
All DBs
Position
complement(300785..302173)
Genome browser
AA seq
462 aa
AA seq
DB search
MKNIINKNFNNLDTIIAQVTPYGNSGVGIIRISGKKTEYISNKILNKIIKPRIANYLIFR
DHKNNILDKGIAIFFKKPYSFTGEDILELHCHGNPISLISLMNYIINKFNIRFAKPGEFS
YRAFLNNKIDLIQAESIMDLINSNSKFAVKSSINSLNGNLSLCINNIIKEIIKTRIYIET
IINFSEYETEVIPIFKISNKLNKIIKIIKNICYESKLGKLKQHGIKIVILGKPNSGKSTI
FNLITKKNISIVTNIPGTTRDIIRKNIYINGIPIQIIDTAGLRKSYDIIEKIGIEKTKKE
INNADHLLLVIDSNISKNYKIKELFFNVYNKIDKNKITIIENKIDIKKKKADIIKNKKGY
NIIKMSALTGLGKNILFNHLTKISYFNKDLSTIFINNKRHIKILKKTLEYIKQSKYLLDT
GNYIDIIANKLNLAQKEISKITGNFTTKDLLKNIFSKFCIGK
NT seq
1389 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatataataaataaaaattttaataatttagatactattatagcacaagttaca
ccatatggtaatagtggtgttggtattattagaatatctggtaaaaaaactgaatatatt
tcaaataaaattttaaataaaataataaaaccccgtatagcaaattatttaatttttaga
gatcataaaaataatattttagataaaggtatagctattttttttaaaaaaccttattct
tttactggcgaagatatattagaattacattgtcatggaaacccaatttctttaatatca
ttgatgaattatattattaataaatttaatattcgttttgctaaacctggagaattttca
tatagagcttttttaaataataaaatagatttaatacaagctgaatctataatggattta
ataaattctaattcaaaatttgcagtaaaatcttctataaattctttaaatggtaactta
tcattatgtattaataatattattaaagaaataataaaaacaagaatatatatagaaact
attataaatttttcagaatatgagactgaagttattccaatatttaaaatttcaaataaa
ttaaataaaattatcaaaattataaaaaatatatgttatgaatcaaaattaggtaaatta
aaacaacatggtattaaaatagttattttaggaaaaccaaattctggaaaatctactata
tttaatttaattacaaaaaaaaatatatctattgtaactaatattccaggaacaacaaga
gatataataagaaaaaatatatatattaatggaataccaatacaaataatagatactgct
ggcttaagaaaatcttatgatattatagaaaaaataggtatagaaaaaactaaaaaagaa
ataaataatgcagatcatttattattagttattgatagtaatatttcaaaaaattacaaa
ataaaagaattattttttaatgtatataataaaattgataaaaataaaataactataata
gaaaataaaatagatattaaaaaaaaaaaagcagacattataaaaaataaaaaaggatat
aatattattaaaatgtctgctttaactggtttaggaaaaaatatattatttaatcattta
acaaaaatttcatattttaataaagatttatctacaatatttataaataataaacgtcat
attaaaatattaaaaaaaacattagaatatataaaacaaagtaaatatttattagataca
ggaaattatattgatattattgctaataagttaaatttagcacaaaaagaaattagtaaa
ataacaggaaattttacaacaaaagatcttttaaaaaatatattttctaaattttgtatt
ggtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system