Agrilus planipennis (emerald ash borer): 108733784
Help
Entry
108733784 CDS
T07419
Name
(RefSeq) protein patched
KO
K06225
patched 1
Organism
apln
Agrilus planipennis (emerald ash borer)
Pathway
apln04341
Hedgehog signaling pathway - fly
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apln00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04341 Hedgehog signaling pathway - fly
108733784
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sterol-sensing
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108733784
NCBI-ProteinID:
XP_018320591
UniProt:
A0A1W4W9C1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1183 aa
AA seq
DB search
MASADSQADPERHRSDLYVRPGWVDAAVALIQIEQGKARGDRGILWIRVRLQRQLRSLGT
FLEAHAGKVIFVSLLVIATFCVGLKSATFHSDILQLWAEPSQPEETPSVEVLSTHQIVVQ
TVVDPEGRLLHSRGLLEHLNMIRQATQVTVTMFDITWKLKDICQSPSVPDFDVHYIEQMF
ENMMPCTIITPLDCFWEGSKLLGPEYPVHIPYGIGKNVKWTNLNPSRLVAQIKEKESRFD
YHSLEDYFRRAGITSGYQEKPCLDPFDPDCPLMSPNRNSSHPLDVGAELTSGCYGFAAKY
MHWPEDLIVGGVVKNKTGHIKQAQALQTVVQLMGEHELYEFWSDTYKVHHIGWNQEKASM
VLNAWQKRFSLEVERLTKVNSSSYNFNTFSTSSLNRVLAEESKTDFLKLVIALTAVVIYG
WLCQSFLAALGILLLSSSAAASLGVCSLLGLPMNLLSTHVLPFVTVGLAMREIFLLLSTQ
KRNVSPSEVLQRSGPTILVTAISNAAAFIAAAIVPIPALRVFCMQCAVIVLFHGAILLLV
FPAFLALKVRCKKSDMPCLRSESKNSSAPINNNNNEDLESGVNLISPESLCKKKNNLVPS
VVIYYSKNFLLKPFFKVTLCLTYAILIIFCVFNGLKLEYDVRLSTFLPRHTQEYKYLEAH
NRFFGFYNFYLVTTELEYPLNQPLLYEYHASLTKVPHVMKDSNGGLNMNDFWLANFRDFL
LDLQQEFDVNRKNKCLNSEKWFPNATEKAVLAFKLLAQTGVVEFPVDKSQILNKRLVEGD
VIDPKAFYNYLSVWNSNDQMSYSSSQANLTPKPFQYYSTKTEYDLKIPKSQPLIYTQMPF
YFKNLRTTGKIIDTLKQVKEISASFVAKGLKNYPIGLIFSFFNQLLVLDKLLLMQLAFML
GEITIFTCFLVHWSKLWCLLFCILTSMLMMCLMNINALTGTLGTLYFVIISRNVVLVLSG
FLNAVGNRERRVRLSLEVNAEPIFKGDIGLLTCVAILSLSNLEFIRYHIFMTLVMSVCSS
LGFSLLLFPVVLSLVGPKAEVQPLENSERISTPPPPPPPQAPTRSPIYVKPTRRNSPSKT
TREPSLTTITEESCNQSIVVEPQVTVEYSSPESSSSGPYTTKVTATANIKVEVVTPIYRS
KCSGCRTKCGRHKPQCHCCKQDSDNSDSSSSSNDSEPSCRTTS
NT seq
3552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctcggctgactcgcaagctgacccggaacgacatcgctccgatctttatgtgcgc
ccggggtgggtggatgctgctgtagcactgattcaaattgaacagggcaaggcaagaggc
gatcgcggtatcctatggatacgcgtgcggcttcagagacaactgcgttcacttggtaca
ttcctagaagcgcatgctggaaaagttatcttcgttagccttcttgtcattgccaccttc
tgcgttggattaaaaagtgctacctttcattcggacattttgcaattgtgggctgaacct
agtcagcccgaggagactccttctgttgaggttttatcaacacatcaaatagttgtacaa
acggtggttgatcccgaaggtagacttcttcatagtaggggccttcttgaacaccttaat
atgataaggcaagctacgcaagtcaccgtcactatgttcgatatcacctggaaacttaaa
gatatttgtcaatctcctagtgttcctgactttgatgtccattatattgaacaaatgttt
gaaaatatgatgccatgcactatcataactcctttagattgtttttgggaaggatctaaa
cttttgggacctgaatatcctgtacatatcccctacggtattggtaagaatgtaaaatgg
acaaatttaaatccgagccgtttggttgctcaaataaaagaaaaagaatctcgctttgat
taccattcgttagaagattactttcgacgagcaggaattacctcaggttatcaagagaaa
ccttgtttagacccttttgatccagattgccccttaatgtcacccaatagaaattctagc
caccctttagatgtcggagcggaactcaccagcggttgctatggttttgcagcaaaatat
atgcactggcctgaagatttaattgttggaggtgttgtaaaaaataaaactggtcacatc
aaacaagcccaagcacttcaaacggtagttcaactgatgggagaacacgagctatacgaa
ttttggtcagacacatacaaagttcatcacattgggtggaatcaagagaaggcttctatg
gttttaaatgcatggcaaaagcgattttcattggaggtagaaagactaaccaaagtcaat
tcatcgtcgtataattttaatactttctctacaagtagtttaaatcgcgtacttgcagaa
gaatctaaaacagactttttaaaattggtaatagcacttacggcggtcgttatttatgga
tggctgtgtcaatcgttccttgcagcgttaggaatcttgttactttccagttcagcagct
gcaagtttaggagtttgcagccttcttggacttcctatgaacctactgagtactcacgtt
ttaccattcgttactgtaggtcttgcgatgagggagatctttttgttgttatccacgcag
aaaagaaacgtgtcaccatcagaagtactacagaggtcggggccaacgattctggtaaca
gcaattagcaacgctgcagccttcattgccgcagcaatcgtaccaattcctgcattgagg
gtattctgcatgcaatgtgccgtcatcgtcctttttcatggtgctatcctgctactagtt
ttcccggcttttcttgctttaaaggtgagatgcaagaaatctgatatgccatgcttaaga
agtgaatcaaagaattcttcagcacctattaacaataacaacaacgaagatttagagagc
ggtgtaaatctaatttcgccagagagtctttgcaagaagaaaaacaatttagtgccatca
gttgttatttactactcgaagaattttcttttaaaaccgttttttaaggtgacattgtgt
ttaacatatgctatactaataatattttgtgtcttcaatggacttaaattagagtacgat
gttcgactttcgacatttttaccaagacatactcaagaatacaagtatttggaagcacac
aataggttttttggattttataatttttatttggtgactaccgaactggaatatccttta
aatcaaccattgttatatgaatatcatgcatctcttacaaaagttcctcatgtcatgaaa
gactcgaatgggggcctgaatatgaatgacttttggcttgctaactttagagatttttta
ttagatcttcagcaagaattcgatgttaataggaagaataaatgtttaaacagtgaaaaa
tggtttccaaatgctacagaaaaggctgtgctggcttttaaattgttagctcagactgga
gtcgtggaatttccagttgacaaaagtcaaatccttaataaacgactcgtcgagggagat
gtaattgatccgaaagcgttttacaattatctttctgtatggaatagcaacgatcaaatg
tcttattctagttctcaagcaaatttaactccaaaaccgttccagtattacagcactaag
actgaatatgatttaaagattccaaaatctcaacctcttatatacacacaaatgccgttt
tactttaaaaatttaagaacgacagggaaaataatcgatacgttaaaacaagtaaaagaa
atatcagcgtcgtttgttgccaaaggccttaaaaattatcctataggtttaatattttca
ttttttaatcaacttctcgttttagataaattacttttgatgcaattggcttttatgtta
ggagagataacaatttttacgtgtttcttagtacattggtcaaaattgtggtgtttactt
ttttgtattttaacaagtatgttaatgatgtgtttgatgaatattaatgctctgacaggt
accttaggaaccctgtattttgtaataatcagtagaaatgttgtactagtattgtcgggg
tttttaaatgcagtaggaaacagggaaagaagagttagattatcattggaagtaaatgca
gaacctatttttaaaggtgacattggtctccttacttgcgtggcaattttatctttatca
aatttagaattcattagataccacatatttatgactttagtgatgtccgtgtgttcgtct
ttgggtttttcgttactacttttccccgtcgttctttcactggtagggccaaaagctgaa
gttcaacccttagaaaatagcgagcgaatttctacgcctcctccgcccccacctccacag
gctccaacccgttcgccaatatatgtcaaacccacaagacgtaattcaccatcaaaaact
actcgagagccaagtttaacgacgattacagaagaaagttgtaatcagagtattgtcgtt
gaacctcaggtcactgtggaatacagtagtccagaatcgagttctagtgggccctataca
acaaaagttacagcaacggcaaatataaaagtggaagtcgttacacctatataccgatca
aagtgtagtggttgtagaactaaatgtgggagacataaaccgcagtgtcactgttgtaaa
caagactctgataatagcgatagtagcagtagcagtaatgattctgaaccctcatgtaga
acaaccagctag
DBGET
integrated database retrieval system