Agrilus planipennis (emerald ash borer): 108745099
Help
Entry
108745099 CDS
T07419
Name
(RefSeq) small subunit processome component 20 homolog
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
apln
Agrilus planipennis (emerald ash borer)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apln00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
apln03009
]
108745099
Ribosome biogenesis [BR:
apln03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
108745099
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
GNC1_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108745099
NCBI-ProteinID:
XP_025831519
UniProt:
A0A7F5R6D0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2688 aa
AA seq
DB search
MKNKSSRHKESNLFKFQPFSERISNLDIYVFHKVGHENELQVDELQCRFYETLQKWSVLN
LSEGFSQFKKDVNAQFLITLPQLIHNKENVIEVLLKYLDMKNPMFLQPLLELTSALVEDL
RNEFYPYFLRFLKTLIDLLYLKDAEGVEWVFTCLAYIFKFLWKFLSRDITIVLNSVLPLL
SDDKPDYIVDFASESFSFVARKVGDLEAFLELILETVHSRKDAIIGCSKLLFEIIHGSSG
YFHSCAELWLPFMFRSLANNKYSQIVLFEIVEHIVANILQHILPEKADLFWNTSITVLNE
FYNNLSSDSQLIGFACENLLRIIHQAIKFKNGIFLKNSQKIVNQLVKLFNISKSNESLLR
TVVQLCSTVLVARNIDLSQEQTSQIIANVQSLNLRSAYLCFVDSLIDYSGFDLLIFPNFV
RFCVNATELETDSLNTLTKIILKKSPFCNNGILLDAWKRYPISLSCQQDKSFFLKNMLHK
LNDMENEVNNYLSAVICLPHINLKSSEIEKKLVENSELLLELLHSKQKEMTSENKKEYLF
LLMCTVQCMVHLNVHYMLNCDKIVETLLPFCSDVHLIESLQILSLYLSKLKEDKMCLSFQ
MLLKINEHLEDNFTSPFHDVRLLITHIYSLFENLPYFIEIGTDSKEVWNLFSICFQIEST
EFQIHTVNGQLQLIEKLSFQSTQMQMCKLTPFKLVPLKYLCGLLYVNFQLLWNPVSKIIS
TYAINAMEISEFWTVFGTQLKLVNQDVNSSSVAKIKFLDEYVNSTLLNMNVREEKIDYCN
YRILLWKTMAIFPEIAEAKTRDTSELLLSFIKNEYNNLAMDFSKTWNIKLHNIGKENNSK
ENVIECSDQDKEKKYKQNIKSKERTISAILNVFAKIRSPMSMFRESELKQLYLDLLSYKN
SEVQKLALDCLMTYRHEYLMAYKEQLYNLVDDKNFKNEISLFRINKDSSVIQEKHRQSLI
PIILKIVFTKMTSKSGLRTGGKGFGQIRRNLVLRFLSGCYENEIEMFVHMSFKFYSKYIY
GDQFSVIINISNECNLEKFVPLKRLQSSVNLLTLILEELGGSLSDNLLQYLLKILMVIGA
FVKGIFSQISLVHAGYRDILKKLRSSLLRVLEKFFDHFDKYPWSSEEIDTVFEIFVWPYL
EQLEIEGIHSPSALLRLFLQWGSRPRYFELLIKYYADDNDFTAMAFIIRLLLKKSTHASV
SKVIMEMINYLLTFKDNEYEQDTLRILVNSTLSLKNNPVHQNLEKKNLSLGSYIVLPHVP
SILIMIKNKLHSRKGLTTTELSVLCSISEFVWDCESSKAVLDLMIPLFSKMFDLPDDNLL
KFIMIIDNLTQKIDQPQKYLTKLLPYFGEVSYKPARKQLCEIFNKAKTKSDTAAFNTLAR
IINELNAWDDKWIDQPNFEKRIECFKEINLLMESKNVEIELGLAIFYNCCYMLKYESDIS
LKEKSSHYWKIISNELLKNFYDKTFYLLDEHLFVIICEGIKSKNEEFRNECIQLLGYIAR
HCPDSHIVLKQLNKLTSETDLEVDFFENLTHLQIHRHVRALLKFVDVFTNNVDSQCNRTL
IQFIFPLVSWYLCNEKYVSKNSLIDASIEAVKTICKLLPWNQYGNLLRMYMNKLRYKTIF
KKQLVRVIVAILDAFNFDLRSGCAKSIEEIASYQEFEKKENIQVSETKKEEAMVTEDEKS
LDQQMEVEVMSDYPEMEIDECVHSIHTDASEKVFLLSSATASKVIHTIQKIFLPQLFRLL
AEYSHYDSFHKLNKKKTLNEKEEDDLQKIPISLALVKLLQKLPKEILDKNLPMIFMKLAT
FLKSHLGSVRRIARETFEQIMCVVGPKYLNTFLDAIQPLLLRGFQVHVLVYTVHGVLASL
KEMYEPGDMDKIIITVLNICKADLFGTLAEEKEVEKIRVKIPEAKTTRSYETLQILALFV
TEKYLMDIIVPLRSVLLNLRSFKNNKKMQECFRYIALGLVANKFITYEYLMKISYGIISQ
NIPELFSTQANKKKIGEKYKQNALLTERSDCLIIPPVVMDKYEAKGMVARVSDNMNNYVL
VTFGLNICLNLIKMDHPNNTCYKSFMDPFIKLFRDCLSSHHVKLNILALKCLIGIAKWDL
PSFREYMQEINENIFKILHKYAVTGLNKGDNFDLVLISFKFMAVLLRDVKYYIIDKEHLK
MLLFYVEQDLHENDRQINALMLLKAVTSRKFDLPEIYTVMNKVAKISITSTSSQVQNYAS
QVFLHFFINYPFGKKMDSYIGFYLSQINYEYQSGRQSALSMIQNLINSFPMSLLKAQSGS
IMVTLSTQLINDDVPECRKNIVNCLTNMFKRLAKPERDPLFDIVKLWLLDEKINHRRLAI
QLCGIFIDVEKSNFESRIPPLMPILLSQFNEKEKSFTVSLSKAESLNVGLDQWTKDHYLF
QLLQTLLKLYFHCSATFKQMKEMEIFASYAQSLLNYPHEWVRLSSAQFLGFVLSDINIEE
LADCIKHNKSNKSGGYLYSDPRINIKSLTFDLCAILQTDAKHQELSEQVIKNLVFIARIC
EKVQFKEEEEQLPDLFWLLKRMRKISNWELVHSPKETFIRKSVFKWIAGISTVLENNQVR
LVLPILLPPLIREMTVADTDNTLQQLSKEVANILKQRVGEDFYSAEVSKAKQKLLLKQAE
RRRVNKQMAVADSELHAKKKIKRNLKKKESKKKTLAIIKNKIHRKVKK
NT seq
8067 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaatcatcacgacacaaggagagtaacttatttaagtttcaaccattttct
gaaagaatatcaaatctagatatctacgttttccataaagttgggcacgaaaatgaattg
caagttgacgaacttcagtgccgattttatgaaactctacagaaatggagtgttcttaat
ttgagtgaaggcttttcccagtttaagaaagatgtaaatgcacaatttttgatcaccctt
ccacagttaatccacaataaggagaatgtgatcgaagtattattaaagtatttggatatg
aagaatcctatgtttctgcaaccacttttagaattaacatcagctttagttgaagattta
agaaatgagttctacccatattttcttagattcttaaaaactctgattgatcttctatat
ttaaaagatgcagaaggggtagaatgggtatttacatgtttagcatacatattcaaattt
ttgtggaaatttttatcaagagatataactattgtgctaaatagtgttttacctctactt
tccgatgacaaaccagactatattgttgactttgcatctgagagtttctcatttgtagca
cgcaaagttggggaccttgaagcgtttttagaactaattctagaaacagttcattcaaga
aaagatgcaataattggatgcagtaagctactatttgaaattattcatggtagctcgggt
tattttcatagttgtgcagaattatggttaccatttatgtttcgctcgttagctaataac
aaatattcacaaatagtgctttttgaaattgtagagcatattgttgcaaatatactgcaa
catatacttccagaaaaagcagatctgttttggaatacaagcattactgttttaaatgaa
ttttacaacaatttatcttctgattctcagctaataggttttgcctgcgaaaatctttta
aggattattcatcaagcaattaaatttaagaatggaatttttttgaaaaattcacaaaaa
attgttaatcaacttgtgaagctttttaatatctcaaaatcaaatgagtctctcttacga
acagttgtgcagttgtgttctacggttcttgtagcacgaaatatagatttatctcaagaa
cagacaagccaaataattgcaaatgttcagtcattaaatctgaggagtgcatatttgtgt
tttgttgatagtttaattgattattcaggatttgatttgcttatttttcctaactttgta
agattttgtgttaatgcaactgaattggaaacagatagtctaaatacattgactaaaatc
attttaaagaaatctcccttttgcaataacggcattttattggatgcatggaaaagatat
ccaattagtttgtcttgtcaacaagacaagtcgttttttttaaagaatatgttgcacaaa
ttaaatgacatggaaaatgaggtaaataattatttatctgctgtaatttgtttacctcat
ataaacttgaagtccagtgaaattgaaaaaaagttggtggagaacagcgaattactttta
gaattgctgcattcaaaacaaaaagaaatgacctcagaaaataaaaaggagtatctattt
ttattaatgtgtactgtacaatgtatggttcatcttaatgttcattatatgctaaactgt
gacaaaatagtggaaacattattaccattttgtagtgatgtacatttaatcgaaagttta
caaattttaagtctttacttaagtaaactgaaagaagataaaatgtgtttaagctttcaa
atgttgttgaaaattaacgaacatttagaggataattttacttcaccttttcatgatgta
cgacttttgattacacatatttattcattgtttgaaaatcttccctatttcattgaaatc
ggcaccgattctaaggaagtttggaatttatttagcatttgttttcaaattgaatcaact
gagtttcaaattcatacagttaatggtcagttgcaacttattgaaaagctgtcatttcaa
agtacgcaaatgcaaatgtgtaaattaacaccctttaaattggtacctttaaagtacctt
tgtgggttgctgtatgtgaattttcaacttttgtggaatccagtttccaagataatttca
acttatgccatcaatgctatggaaataagcgaattctggacagtttttggaactcaacta
aagttggtgaatcaagatgtgaacagctcgtcagtagcgaaaatcaagtttttggatgaa
tatgtcaacagtacattgctgaatatgaacgtacgggaagaaaaaatagattactgcaat
tatcgaatactgttatggaaaactatggctatctttccagaaatcgcagaggcgaaaact
agagatacttcagaattacttttgtcatttataaaaaatgagtacaataatttggcaatg
gatttttcaaaaacatggaatattaagttacacaatattggaaaagaaaataattcgaag
gaaaatgtaatagaatgttcagatcaggacaaagagaagaagtataaacaaaatataaaa
agcaaagaaaggaccatttctgcaattttaaatgtttttgcaaaaataagaagcccaatg
tctatgttccgagaatctgaactcaagcagctgtacttagatttattatcttacaaaaat
agtgaggtacaaaagttagcattagactgtttaatgacataccgacatgaatacctaatg
gcatacaaggagcaattgtataatctcgtagatgataaaaattttaaaaacgaaatatcc
ctcttcagaatcaataaggactcttctgttatacaggaaaaacatcgtcagtcccttatt
cctattattttaaaaattgtatttaccaaaatgacttctaaaagtggcttaagaactggt
gggaaaggtttcgggcagatacgcagaaatttagtcctccgtttcctttcgggatgctac
gaaaatgaaattgagatgtttgtacatatgtccttcaaattttactcaaaatatatttat
ggagatcaatttagtgtgattataaacatttctaatgagtgtaatttggaaaagtttgtt
ccgcttaaacggcttcagagtagtgtcaatttacttactttaatattagaagaactgggg
ggttctttaagtgacaatctattacaatatttattgaaaatattaatggttattggagca
tttgtgaaaggcattttttctcagatctcattagtgcacgcaggctatagggacattttg
aaaaagttgaggtcatctttattaagggtactcgaaaaattttttgaccacttcgataaa
tatccatggtcatctgaagaaattgatactgtttttgagatttttgtatggccatattta
gaacaattggaaatcgagggcattcacagtcccagtgcgttacttcgtttatttttacaa
tggggatcaaggccaagatattttgagttattaattaaatattacgcagatgataatgac
ttcactgcaatggcttttataataagattgctgctcaaaaaatcgacgcatgcttctgta
agcaaagtgattatggaaatgataaattatttgttgacatttaaagataatgaatatgag
caggataccttacgaatattggttaatagtacgttgagcttgaaaaataatccagtacat
caaaatttagaaaaaaagaatctaagccttggaagttacattgtgttacctcatgtgcca
tctattttgattatgataaagaataaattgcacagcagaaaaggcttgaccacaaccgaa
ttgtctgttttgtgcagtatttctgaatttgtgtgggactgtgaatcgagtaaggctgtt
ttggaccttatgataccgcttttctcaaaaatgtttgatttacctgatgataatctttta
aaattcataatgattattgataacttaactcaaaagattgatcagcctcagaaatactta
acaaaacttttgccctactttggtgaagtttcctacaagcctgctaggaagcaactctgc
gaaatttttaacaaggctaaaacaaaatccgatactgcagcatttaacactttagcgaga
attataaacgaactcaatgcgtgggacgacaaatggattgatcaaccaaattttgagaaa
agaatagaatgctttaaagaaattaatttgttaatggaatctaaaaatgtagaaatagaa
ttaggattagcaatattttacaattgttgttacatgttaaaatatgaaagtgatatttct
ctaaaggagaaatccagtcattactggaaaataatatccaatgagctattgaaaaacttt
tatgataaaacattttatttattagatgaacatttatttgttattatctgcgaggggatt
aaaagtaaaaatgaagaatttaggaacgaatgtattcaacttttagggtacattgctaga
cattgtcctgattcccacattgttttaaaacaattgaataaacttactagtgaaactgat
ttggaagtagatttctttgaaaatctcacgcatctccaaattcacagacatgttcgagct
ttactgaaatttgtagatgtatttactaataacgttgatagtcaatgcaatcgaacatta
attcaatttatttttccactcgtgtcgtggtatttgtgtaatgaaaaatacgtctcaaaa
aacagtctcattgatgcttctatagaagctgtaaaaactatttgtaaacttttaccgtgg
aaccagtatggaaatttgttaagaatgtatatgaacaaactaagatataaaaccattttt
aaaaagcagttagtccgtgtaattgtggccatattagatgcatttaattttgatctacgt
agtggttgtgcaaaaagcattgaagagattgctagctatcaagaatttgagaaaaaggag
aacatacaagtttcagagacgaaaaaagaagaagcgatggtaactgaagacgaaaaatct
ttagatcagcaaatggaagtggaagtgatgtctgactaccctgaaatggaaatagatgaa
tgtgtgcattcaattcatactgatgcttctgaaaaagtattcctattatcatctgcaact
gcatctaaagtgatacatactattcagaaaatatttttgccacaactgtttaggcttctg
gcagaatattcacactacgattcgtttcacaaacttaataaaaagaagactcttaacgaa
aaggaagaagacgatttacaaaaaattcccatttcattagctttggttaaattgttacaa
aagttgccaaaagaaatactggataaaaatttaccaatgatttttatgaaactagcaact
tttttaaaatcacacttaggaagtgttcgtcgaattgccagggaaacatttgagcaaatt
atgtgcgtggtgggaccaaagtacttaaacacatttttagatgcaatacaacccctacta
ctaagaggatttcaagtgcatgttcttgtttatactgtacatggagtgttggcttctctg
aaagaaatgtatgaacctggtgatatggataaaataattattactgtattaaacatttgc
aaagctgatttatttggaactctggctgaagaaaaggaagtagagaaaatacgagtaaag
attcctgaagctaaaaccaccagaagttacgaaacactccaaattttggctttatttgtt
accgaaaaatatttaatggacataatcgtaccgttaagatcagtattgttgaatttgcga
tcgtttaaaaataataaaaaaatgcaggaatgctttcgatatattgcactgggattggta
gcaaataaattcatcacgtatgagtatctaatgaaaatttcatatggaataatatcgcaa
aatataccagaacttttttcaacacaagcaaataaaaagaaaattggcgaaaaatacaaa
caaaatgcacttttgacggagagaagtgattgtcttattattccacctgtggtaatggac
aaatatgaagcaaaaggaatggtagcgagagtttctgataacatgaataactatgttctg
gtaacatttggacttaacatttgccttaatttaataaaaatggaccatccaaataacact
tgttataaaagttttatggacccatttatcaaactatttcgagattgtttgagttctcat
catgtgaagttaaatatattggcattaaaatgtctaattggaattgctaagtgggatcta
ccgtcgttcagagaatacatgcaagaaataaatgaaaacatttttaaaattcttcacaag
tatgcagtaacaggactgaataaaggagataatttcgatttggtgctaatttcttttaag
tttatggcagtattgcttagagatgtgaaatactatataatcgacaaagaacatcttaaa
atgcttcttttttacgtggagcaagacttacacgaaaacgatagacaaatcaatgccttg
atgttactgaaagctgttacatctagaaagtttgatttgcccgaaatttataccgtaatg
aataaagtggcaaaaatcagtataacttcaacgagctctcaagtgcaaaattatgcctct
caagtttttttgcacttttttataaattatccctttggcaaaaagatggattcgtatatt
ggtttctatctttctcaaataaattatgaatatcagtcggggcgccagtcagccttatcg
atgattcagaatttaattaattcatttcccatgagtctcttaaaagctcaaagtgggtca
attatggttactttgagtacacaactaataaacgacgatgttcccgaatgtagaaaaaac
attgtaaattgtttaacgaatatgttcaaaagattagctaaacctgaacgagatccgtta
ttcgatatcgttaaattatggttactggacgaaaagattaatcatagacgattagctata
cagctttgtggtattttcatagatgtagaaaaatctaattttgaatcacggatacctccc
ctaatgcccattttattatctcaattcaatgaaaaagagaaaagttttacggtgtcatta
agcaaggcagagtcattaaatgtaggattggaccaatggacaaaagatcactacttgttt
cagttattacaaactttattgaaattatattttcattgttcggcaacttttaaacaaatg
aaagaaatggaaatttttgcatcatacgcacagtcactacttaattaccctcatgaatgg
gttcgactctcatccgcacaatttttgggttttgtactctcagatattaatatagaagaa
ttagctgattgtataaaacataacaagtctaacaaaagtgggggatatctttacagtgat
cctagaatcaatattaaatcccttacattcgatttgtgtgcaatacttcaaactgatgct
aaacatcaagaactgtctgaacaggttataaagaatttagtttttatagcacgaatttgc
gaaaaagttcaatttaaagaagaagaagagcaacttccggacttattttggttgttaaaa
aggatgagaaagattagcaattgggaattagtacattcaccaaaagaaacatttatcaga
aaatcggtctttaaatggatagcaggaataagcacagtcttagaaaataatcaagtcaga
ttggtactaccgatacttttacctccactgataagagaaatgacagtcgctgatactgat
aacacgttgcaacaattgtcaaaggaagtagctaatattttaaagcaaagagttggtgaa
gatttttactctgcagaagtatcgaaagcaaaacaaaaattattattaaaacaagccgaa
aggagaagggttaataaacaaatggcagttgcagactctgagttacatgcaaagaaaaaa
attaaaaggaatttaaaaaagaaggagagtaaaaagaaaactcttgctattattaaaaat
aaaatacacagaaaagtaaaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system