Alpha proteobacterium HIMB5: HIMB5_00002970
Help
Entry
HIMB5_00002970 CDS
T02250
Name
(GenBank) permease YjgP/YjgQ family
KO
K11720
lipopolysaccharide export system permease protein
Organism
apm
Alpha proteobacterium HIMB5
Pathway
apm02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
HIMB5_00002970
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
apm02000
]
HIMB5_00002970
Transporters [BR:
apm02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Lipopolysaccharide transporter
HIMB5_00002970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptF_LptG
Pox_A14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS47066
LinkDB
All DBs
Position
complement(287002..288081)
Genome browser
AA seq
359 aa
AA seq
DB search
MIKVYKKYLILNFITIFFKILAVFTSLGFIMGILEEINFFSEIEINFYFPIILVLLNLPS
LLYEIFPFIFLLTSQFFFINLLDKGELITLKKNGLNNLKILNLISITSFIIGMVIIILFY
NFSAVLKFKYIDLKKNYTKDNKYLATITENGLWIKDQIGNKINFINSNQFSTNTLIDVDI
IQLDQNFNFERNIKAEEVDIRKKLWKLKNSYIIKSNNDVSFKNEIYFQTNFNFQEINKLF
SNLSSLTIWKLYELKENYKTVNYSTTEIDYHLQKIISYPFLITVMTILTSILMLNIRHQK
PKILIIVIGILLSVSIYYINFFFGAMGKNEKVPLMIAVWTPILILSLISLIGLVRINEK
NT seq
1080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaagtttataaaaaatatttaatattaaattttattacaattttttttaaaatt
ttagctgtatttacttcattgggatttataatgggaattcttgaagaaattaattttttt
tcagaaatagaaataaatttctattttccaataattttagttttattaaatcttccatct
ttactttacgagatttttccttttatttttcttttaacgtcacaatttttttttattaat
ctattagataaaggtgaattaataactttaaaaaaaaatggtttgaataatttgaaaatt
ttaaatttgatatctattacttcattcattattggcatggtaataataattttattttat
aatttttctgctgttcttaaatttaaatatattgatctaaaaaaaaattatactaaggat
aataaatatcttgcaacaataactgaaaatggtttatggattaaagatcaaattggaaat
aaaattaattttataaattcaaatcaattttcaacaaatactttaattgacgttgatata
attcaacttgatcaaaattttaattttgaaagaaatattaaagctgaagaagttgatatt
agaaaaaaactatggaaactaaaaaattcatatatcataaaaagtaataatgatgtttcc
tttaaaaatgaaatttattttcaaacaaattttaattttcaagaaattaataaattattt
tctaatctctcatcattaactatatggaaattatatgagcttaaagaaaactataaaact
gtaaattattcaacgacagaaatagattatcatttacaaaaaattatttcttatccattt
cttataactgtaatgacaatattaacatcaatactaatgcttaatataaggcatcaaaag
cctaaaattttgattattgtaattggtatattgttatcagtttcaatttactatattaac
ttcttttttggagcaatgggtaaaaatgaaaaagtacctttaatgatagcagtttggact
ccaattttaattttaagtttaatatctttaattgggttagtaagaataaatgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
