Alpha proteobacterium HIMB5: HIMB5_00005700
Help
Entry
HIMB5_00005700 CDS
T02250
Name
(GenBank) Beta-barrel assembly machine subunit BamA
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
apm
Alpha proteobacterium HIMB5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
apm03029
]
HIMB5_00005700
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
apm02000
]
HIMB5_00005700
Mitochondrial biogenesis [BR:
apm03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
HIMB5_00005700
Transporters [BR:
apm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HIMB5_00005700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
POTRA_1
POTRA_TamA_1
DUF1830
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS47335
UniProt:
J9YWI0
LinkDB
All DBs
Position
519812..522049
Genome browser
AA seq
745 aa
AA seq
DB search
MKKLFTLVLFLILYSFQVKSIEINKVEIKNNDRISKETIITYGDIELGKNYTESDLNNII
KNLYNTNFFNTINFTINNDILIINVEENKLIQSVIIKGVKSNRIKESVLENLYSKDKAPF
LIDKVKQDLTRIKTSLNYIGYYLAEVNSKTIDNDNNTVDLVFEINLGDKSKISKIEFVGD
KKIKDRILRNIIISEESKFWKFITNKKYVNENTIKRDKRLLKNYYLNEGYFDVKIESASV
KFKDDKTFKLKFKIDAGEKFYVNSVKLNLPLDYNKENFLAVQNSLDKMVNEFYSLNKITK
TINEIDKISLSRQYDFINADLQEIVVDKNKIDLIINIKESEKFYVERINVFGNNITFENV
IRSKLEIDEGDPYNELLSAKSMNNLRASGLFKEVNSEIREGSEFNTKILDITVEEKPTGE
ISVGAGAGSDGGTVGFSVSENNFLGKGIKLGSSLRITDDSITGKFSVNNPNFNYTNKSLS
TVFESTVIDKMTENGYETHKTGFSFGSGFEQFENIYFTPTISNYYEDLTTSSKASSNLKK
QSGSYLESKFSYSLDYDMRNQRYQTFDGFRSTFRQTLPLYSDEYSFSNSYDFKKWHRFSN
NMVTSINFFGKHVNSITNDDVRITNRFYLPRNKLKGFKSRQIGPKDGKDYVGGNYAAAVN
FDTTIPGILDTLENIDVKYFIDAANLWGIDYSDTVDDSNEVRASTGLTVDWFTPIGPLNF
SLAQDLNKANSDKTERFQFNLGTTF
NT seq
2238 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactatttaccttagtattgtttttaattttatattcttttcaagttaagtcg
attgaaattaacaaggttgagattaaaaacaacgatagaatttccaaagaaacaattatt
acatatggagatatagagcttggcaaaaattatacagagtctgatttaaacaacataatc
aaaaatttatataatactaatttttttaatacgattaattttaccattaataatgacatt
ttaattattaatgttgaagaaaataaattaattcaatcagttataatcaaaggagtaaaa
tctaatagaattaaagagtctgttttggaaaatctatattctaaagataaagctcctttt
ttgattgataaagtaaaacaagatttaacaagaattaaaacttcattaaattatattggt
tattatttggcagaagtaaattcgaaaactatagacaatgataataatacagtcgattta
gtttttgaaataaatttaggtgataagtctaaaatttcaaaaattgaatttgttggtgat
aaaaaaataaaagatagaattttaagaaatataataatttctgaggagagcaaattttgg
aaatttataacaaataaaaaatacgtaaatgagaatacaattaagagagataaaagactt
ctaaaaaattattatttaaatgagggttattttgatgttaaaattgaatctgcctctgtt
aaatttaaagacgacaaaactttcaaacttaaatttaaaatagatgcaggtgaaaaattt
tatgtaaatagtgtaaaattgaatttacctttagattacaataaagaaaattttttagca
gtacaaaattctttagataaaatggtaaatgaattttattctttaaataagataactaag
acaataaatgaaattgataaaatttccttatcaagacaatatgactttattaacgctgat
ttacaagaaatagttgttgataaaaataaaatagatttaataattaatattaaagaaagt
gaaaaattttatgtagaaagaataaatgtatttggtaacaacattacctttgaaaacgtt
ataagatctaaattagaaatagatgaaggtgacccttataatgaacttttaagcgctaaa
tcaatgaataatctgagagcttctggattatttaaagaagttaactctgaaattagagaa
ggatcagaatttaatactaaaatattagacataacagttgaggagaagccaacaggtgaa
atttctgtaggtgctggtgcaggttctgatggaggcacagttggtttttcagtatcagag
aataattttttaggaaaaggaataaagttaggaagctctctaagaattacggacgactcg
attactggtaagttttcagtaaataatcctaattttaattatacaaataaatctttatct
actgtttttgagagtactgttattgataaaatgactgaaaatggatatgaaacccacaaa
actggtttttcttttggttcagggtttgaacaatttgaaaacatctactttacccctaca
atttcaaattattatgaggatttaacaacaagttctaaagcaagttcgaatttaaaaaaa
caatcaggctcatatctagagtcaaaattttcttatagtttagattatgatatgagaaac
caaaggtatcaaacttttgatgggtttagaagcacatttagacaaaccttacctttatat
tctgatgaatattcatttagtaattcttatgattttaaaaaatggcatagattttctaat
aacatggtaaccagcattaatttttttggcaaacatgtaaattcaatcacaaatgatgat
gtaagaataacaaaccgtttttatcttccaagaaacaagcttaaaggttttaagtcaaga
caaataggaccaaaagatggaaaagattatgtaggaggaaattatgcagcagctgtaaat
tttgacacaacaattccgggtattttagatacgttagaaaatattgatgtaaaatatttt
atcgatgcagctaatttgtggggaattgattattcagatacagttgacgatagtaatgag
gttagagcatctacaggtctaactgttgattggtttactcctattggcccactaaatttt
tctctagctcaagatcttaataaagcaaattcagacaaaactgaaagatttcagtttaat
ttaggtacaacattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
