Ahaetulla prasina (Asian vine snake): 131191871
Help
Entry
131191871 CDS
T09329
Symbol
NOTCH3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3 isoform X1
KO
K20995
Notch 3
Organism
apri
Ahaetulla prasina (Asian vine snake)
Pathway
apri04330
Notch signaling pathway
apri04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apri00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
131191871 (NOTCH3)
04371 Apelin signaling pathway
131191871 (NOTCH3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
NODP
NOD
EGF_3
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131191871
NCBI-ProteinID:
XP_058026431
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(119092447..119163631)
Genome browser
AA seq
2417 aa
AA seq
DB search
MGSASRFPGPRRAWLVCGFLMVAWLARLAVGAAVQCLDGNKPCENGGTCVVYSNGIAACL
CQPGLIGDHCQFQDPCHQSPCANGGSCESTLRDGTVHYQCTCPKGFRGQDCSLFDACASK
PCVNGGRCTNWNGRYNCTCPSGYQGRNCRSDVDECRVSGLCQHGGTCLNTPGSFRCQCQA
GYTGQHCESISTPCAPSQCLNGGTCRQTGDLSYECACLPGFEGHNCEINVDDCPDHMCMN
GGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTNGGHSCVCVNGWT
GESCSENIDDCQTAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICD
TNPMNGRAICTCPPGFSGGACDQDVDECSIGANPCEHFGKCVNTQGSFHCQCGRGYTGPR
CETDINECLSMPCQNDATCLDRIGEFTCICMSGFSGTYCEININECESNPCVNGGVCKDM
VNGFSCTCPSGFSGSMCQIDIDECASTPCQNGAKCVDRPNAYECRCTEGFEGVLCEKNID
DCSPDPCHHGTCVDGIASFTCTCVAGYTGYRCENQINECHSNPCQHGGKCIDLVNKYLCH
CQPGTSGANCEINFDDCASNPCDYGNCRDGINRYDCICKPGFTGPLCNIEINECASNPCK
NGGTCVDGEDGFSCLCPEGFHDPHCYSEVDECSSSPCVHGTCHDDINGYQCKCEPGWTGT
NCDVNHNECESNPCQHYGTCTDYVNGYRCKCKEGFQGTYCQININDCASSPCLNQGTCID
GIASYTCLCDLPYTGRNCENVLAPCFPNPCENNGVCDHTPDYEGFTCSCAPGWQGQQCHI
DINECDQNPCRNRGTCTNTLGSYRCACRPGYTGINCEMDIDDCTPNPCLNGGGCQDGISS
FTCTCLPGFTGPRCATETNECLSNPCRNGATCTDYVNSYTCTCSPGWAGLHCEHNVQECT
DSSCFNGGTCLDGVNSYTCHCRAGFTGTHCQHEIDECQSQPCLNGGVCHDGVQSYRCTCP
QGYTGPQCQSLLDLCSRSPCQNGGHCIQSGATLSCDCPGGWTGRYCDIPNVSCEVVARNR
GVTKDQVCHYGGRCVDAGNTHYCSCKKSYTGSYCESEVNHCQHSLCRNGGTCRSFVGGYI
CECPLGFEGKNCEFDIDECQSHPCQNGGTCIDLTSRYICSCPPGTLGVLCEINEDDCATN
PNIRVPKCLNNGTCVDRVGGYRCSCPPGFTGERCEGDINECQSNPCHPRNTLDCIQEARD
YQCICKPGYTGRHCKNIVNACESQPCQNGGQCKLAVNLPLGYTCHCPRSYSGINCERSVF
SCREFFCFNGGSCRASPLGAHCYCLPGWTGPDCRLRANSSCVNQPCHNGGVCHEIANSPY
FQCLCPGDYTGVRCQTARTARPSLHPELHCPLEECAAKAGDSYCDKMCNSPACRWDGGDC
SLLVDNPWKQCESPQCWQYFNNSQCDELCNTVECLYDNFDCKNRERTCNPIYEKYCSDHF
ADGNCDQGCNNEECGWDGLDCAREVPEHLAEGVLIITVLLHPDELLRTSTIFLQKLSAIL
RTSLRFRMDENGNYMIKPYYGTGRRLRRELGQEIIGSEVTLEIDNRLCYQASNKCFPDAE
SAADYLAALSAVERLEFPYPLKAVKGTRDTVGTDPFKLLPLVVVAALILLVILVLGVLVA
RRKREHSTLWFPEGFSLKKESSNKNRREPVGQDALGMKNIGKGESLIPDSSEDWLEAECP
EAKRLKVLPAHCETLADLRTGAAKVEEPALDCEDPVDCRQWTQHHLVAADIRMPPSMALT
PPQGEFDTDCMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGGMETDLAEEEEADDSSANIISDLICQGA
NLSAQTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNAQDNTGRTPLHAAVTADAQGVFQ
ILIRNRSTDLDARMGDGSTALILAARLAVEGMVEELIACHADVNAVDELGKSALHWAAAV
NNVEATIALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANREITDHMDRLPR
DVAQERLHHDIVQLLDDYNTVRSPQGILPAGHSLSPLMCPPNSFLPSLKPTPQGKKSRRP
STKNVTAGSSASLARESKEAKARAKKLNLECQGSLLESSVTLSPVDSLDSPYVPNPASPG
VFHTANTSLSVPSTPMVHGMMDPPFAVSLARLSDLGDGTLLSMNRLSVPPGRMGLSLGMV
SPVAMPFEWRARIPTSQCQPIIGVVHPAASHPNLHQSGQAFPPGLLLPNHMAMGLSSQGL
PNPAPAQAKEAPQPMPPPPAAVRSNQPVSPQEGQGQVAPPRGGPPPYLKAAGVEDYPTPP
SQHSYTQGQDATPKHFLHPPSEHPYLTPSPESPEQWSSPSPHSLSDWSESTPSPTVLGPS
HTQLPSAEPSAKMQVFA
NT seq
7254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggctcggcgtcccggttcccaggccctcggcgggcatggctggtttgcggctttctg
atggtcgcgtggttggcccgcctggcagtcggggcagctgtccagtgtctagatggcaat
aaaccctgtgagaatggtgggacctgtgttgtttactccaatggaattgctgcttgccta
tgccagcctggtctgattggagaccactgccagtttcaagatccatgtcatcaatcgccc
tgtgccaatgggggttcatgtgaaagcaccttgcgtgatggcactgtgcactaccaatgt
acctgtcccaagggcttccgaggtcaggactgctctctgtttgatgcatgtgccagcaaa
ccatgtgtcaatggtggccgctgtactaactggaatggcagatataattgcacatgccca
tcaggttaccaaggccgcaattgtcggagtgatgtagatgaatgtcgggtgtctggtctg
tgtcagcatggtggtacctgtcttaatacacctggctccttccgctgtcagtgtcaagct
ggttatacaggacagcactgtgagagcatctctacaccttgtgctccttctcagtgtctc
aatgggggcacttgccgtcagacgggagatctcagctatgagtgtgcttgcttacctggt
tttgaaggacacaactgtgaaattaatgtagatgactgtccggaccacatgtgcatgaat
ggaggcacttgtgtggatggtgtcaacacctacaactgccagtgtcctccagagtggaca
ggtcaattctgtactgaggatgtggatgaatgccagctgcagcccaatgcttgccacaac
gggggcacttgcttcaataccaatggaggccattcatgtgtctgtgtcaatggctggact
ggggagagctgtagtgagaacattgatgactgccagacagctgtctgttttcatggtgct
acttgccatgatcgtgtggcatccttctattgcgcatgtcctatggggaagacaggcctc
ctttgtcacttggatgatgcctgtgtcagtaatccttgccatgaagatgcaatttgtgac
accaacccaatgaatggccgtgccatctgcacctgcccaccaggttttagtggtggagcc
tgtgatcaagatgtggatgaatgctctattggagctaatccatgtgagcattttggcaaa
tgtgtgaacacacaaggctccttccattgtcagtgtggacgtggttatacaggtccacgc
tgtgagacagacatcaatgaatgcctctccatgccttgccagaatgatgccacctgcctt
gatcgtattggagagtttacatgcatctgcatgtcaggtttcagtggtacttactgtgag
ataaatatcaacgagtgtgaaagcaatccctgtgtcaatgggggtgtctgcaaggatatg
gtcaatgggttcagttgtacctgcccctcaggcttctcgggttctatgtgccaaatagac
attgatgaatgtgccagcacaccatgccagaatggtgccaagtgtgtggataggcccaat
gcttatgaatgtcgttgtacagaaggttttgaaggggttttgtgtgaaaaaaacatagat
gactgctccccagatccttgccaccatggcacttgtgtagatggcattgccagtttcacc
tgtacatgtgtggctggttacactgggtatcgctgtgagaaccagatcaatgagtgccac
agtaatccctgtcagcacggaggcaaatgtattgacctagtaaataagtacctctgccac
tgtcagccagggacctcaggtgctaactgcgaaataaactttgatgactgtgccagcaat
ccttgtgactatgggaactgccgtgatggcatcaatcgttacgattgcatctgcaaacct
ggcttcacaggtcctctgtgcaacatagagattaatgaatgtgcatccaacccctgcaag
aatggtggtacctgtgtggatggtgaagatgggttctcttgcctttgtcctgagggtttc
catgacccacactgctactcagaagtggatgagtgcagcagcagcccctgcgtgcatggc
acatgccatgatgacatcaatgggtaccagtgtaaatgtgagccaggctggactggaacc
aattgtgacgtgaaccacaatgagtgcgaatccaatccgtgtcagcattatgggacctgc
acagattatgtcaatggttatcgttgtaaatgcaaagaaggcttccaggggacttactgc
cagatcaatataaacgactgtgcttctagcccctgcctcaaccagggcacctgtattgat
ggcattgccagttatacttgtctgtgtgacttgccctatactggacggaactgtgagaat
gtcttggctccttgcttccctaacccatgtgagaacaatggtgtttgtgaccatacacct
gattatgaagggtttacttgcagttgtgcaccaggctggcaagggcagcaatgccatatt
gacattaatgaatgtgaccagaacccatgtcgaaacaggggcacttgcaccaacaccctt
ggcagttatagatgcgcctgccgccctggctacactggcatcaattgcgagatggatatt
gatgattgcacacctaatccttgcctgaatggcggcggctgtcaggatggcatcagttcc
ttcacatgcacttgcctgccaggtttcacaggaccacgctgtgcaactgaaaccaatgag
tgcctgagcaacccctgccgcaatggggccacctgtacagactatgtcaacagctacact
tgtacttgttccccaggctgggctggcttacactgtgagcacaatgtgcaggagtgcact
gacagctcttgcttcaatggtggaacatgcttggatggagtgaattcatacacatgccac
tgtcgtgctggcttcacaggcacccactgccagcatgagattgatgagtgccagtcacag
ccctgtctcaatggtggggtgtgccatgatggtgtgcagtcctatcgttgcacctgtcct
cagggctatacaggtcctcagtgccagagccttctggatttgtgtagccgctccccctgt
caaaatggtgggcattgcatacaatcgggtgctactttatcctgtgattgccctggaggc
tggactggccgttactgtgacatcccaaatgtttcttgtgaagtggtagcgaggaaccga
ggtgtgaccaaggatcaagtgtgccattatggaggccgttgtgtggatgctggcaataca
cactactgtagttgcaagaaaagctacactggcagctactgtgagagtgaagtcaatcac
tgccagcacagcctatgtcggaatgggggtacctgccgcagttttgtgggaggttatatc
tgtgagtgtcctctaggctttgaggggaaaaactgtgaatttgatattgatgaatgtcag
tcacacccatgccagaatggtgggacttgcattgacctcaccagtcgctacatttgttcc
tgcccaccaggaacactaggtgtcttatgtgaaataaatgaggatgattgtgctacgaat
cctaatatccgtgttcccaaatgcctcaacaatgggacctgtgtggacagagtaggtggt
taccgttgcagctgcccaccaggctttacaggcgagcgttgtgagggagatataaatgaa
tgtcaatccaatccctgccatccacgcaacaccctggactgcattcaagaagcccgtgac
taccagtgcatctgcaagccaggctacaccggccgccactgcaaaaacattgtgaatgca
tgtgaatcgcagccttgccaaaatggtgggcaatgtaaactggcagtaaacttgcctctc
ggatatacctgccattgccctcggagctactcgggcatcaattgtgagcgcagtgtgttc
tcttgccgagaattcttctgtttcaatggtggcagctgccgggcttcacctctgggtgcc
cactgttactgccttcctggatggactggacctgattgtcgcctccgtgccaatagcagt
tgtgtgaatcaaccttgccacaatgggggtgtctgccatgagattgccaattccccttat
tttcagtgcctttgtcctggcgactacacaggtgttcgctgtcaaacagcacgcaccgca
cggccatcactgcaccctgagctccattgtccattggaagagtgtgctgcaaaggcaggg
gactcctattgtgacaagatgtgcaatagcccagcttgtcgctgggatggaggtgactgt
tctcttttggtggataatccttggaagcagtgtgagagccctcagtgctggcagtatttc
aacaatagccagtgtgatgaactctgcaacaccgttgagtgtctttatgataattttgac
tgcaagaatcgtgagcgcacctgcaaccctatttatgagaaatactgctcagatcacttt
gctgatgggaattgtgaccaaggctgtaataacgaagagtgcggctgggatgggctggat
tgtgcccgggaagtgcctgaacacttggcagagggtgttctaatcatcaccgtgctgctt
caccctgatgaactgctccgcaccagcaccatcttcctgcagaagctgagtgccatttta
aggacctccctgagattccgtatggatgaaaatggcaactacatgatcaaaccttattat
ggaaccggacgacgactacgtagggaactgggccaagaaataattgggtctgaggtcacc
cttgagattgacaatcgtctttgctaccaagcttcaaacaaatgcttccctgatgcagaa
agtgctgctgattacctggctgccctgtcggcagtagagcgtctagagtttccatatcca
ctcaaagccgtgaaaggtacaagagatacagtcggcaccgacccattcaagttattgccc
ttggtggtggtagcagccctcattctcctcgtgatcctggtactgggtgtgctggtggcc
cggcgtaaaagagaacatagcactctctggtttcctgaaggtttcagtctgaagaaagag
agtagcaacaaaaaccggcgtgagcctgtgggtcaggatgccctgggcatgaagaatatt
ggcaaaggggagagcctgataccagacagctcggaagactggctggaagccgaatgccca
gaggccaagcgtcttaaggtattgcctgctcattgtgagactttggctgacttgagaacc
ggagctgcaaaggtggaagagccagccctagactgtgaagacccagtggattgccggcaa
tggacacagcaccacttggtggcagcagatattcgtatgcctccatctatggccctgaca
ccaccccagggtgaatttgacactgactgcatggatgtcaatgtccgtgggccagatggg
tttaccccacttatgttggcctccttttgcggtggtggcatggagactgatctggctgag
gaagaggaagcagatgactcctctgccaacattatctcagacctcatctgccagggggct
aacttgagtgcccaaacagaccgcacaggggagactgcgctacatttggctgctaggtat
gcccgggctgatgctgccaaacgcttgcttgatgctggtgccgataccaatgctcaagat
aacacaggacgtaccccacttcatgctgcagtgactgctgatgcccaaggagtcttccag
atcctgatccggaatcggtctacagatttagatgctcgaatgggagatggttcaactgca
ctgatcctggcagcaaggttagctgttgaaggcatggtggaagaattgatcgcatgtcat
gctgatgtcaatgccgtggatgaattgggaaaatcagccctgcactgggcagcagctgtc
aataatgtagaggctacaattgctctgctaaagaatggggccaacaaggacatgcaggac
agtaaggaggaaacaccactgtttctagcagctcgggaaggcagttatgaggcagccaaa
attctactggatcactttgccaaccgtgagatcactgaccatatggatcgactgccacgt
gatgtggctcaggagcgcttgcaccacgatattgttcaacttttggatgactacaacact
gtgcgcagcccacagggaatcctgcctgctggtcactctctctccccactcatgtgccct
cccaatagcttcttacctagcctgaagcccaccccacagggcaagaagagccgtcggcct
agcacaaagaatgtgacagcaggaagcagtgccagtctggcacgggagagcaaagaggcc
aaggcgcgtgccaagaagctcaatttggagtgtcaaggctccctcctggagagctctgtc
accctgtctccagtcgactcattggactctccctatgtgcctaaccctgcctcacctggg
gtctttcacaccgccaatacctcgttgtcggtgccctctacccccatggtccacggcatg
atggacccaccctttgctgtcagcttagcacgccttagcgacctaggggatggcactctg
ctttccatgaaccgcctctctgtgccacctggccgcatggggctcagtctaggcatggtg
agccctgtggccatgccttttgagtggcgtgcccgtattcccacttctcagtgccaaccc
atcataggggtagtccaccctgctgcttcccatcccaacctgcaccaatctggccaagct
ttcccaccaggattgcttttgcctaaccacatggccatggggcttagctctcagggcttg
cccaacccagctccagcccaggccaaggaagctccccagccaatgcctccgccaccagct
gctgtgcgcagtaaccaacctgtctcaccccaagagggccagggtcaggtggcaccacca
cgcggagggcccccaccatacctgaaggcagcaggggtagaggattatccaaccccacca
tcgcagcacagttatacgcaggggcaggacgcaacacccaagcacttccttcaccctccc
agtgagcacccgtacctgactccttcaccagagtccccggagcaatggagtagtccctcg
ccacattccttgtctgactggtctgaatccacacccagcccaactgtattagggccaagc
cacacccagcttccttcggcagagccctccgctaaaatgcaggtgttcgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
