Lancefieldella parvula: Apar_0870
Help
Entry
Apar_0870 CDS
T00983
Name
(GenBank) UvrD/REP helicase
Organism
apv
Lancefieldella parvula
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
PDDEXK_1
UvrD_C_2
DEAD
AAA_30
Cas_Cas4
Ser_hydrolase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACV51299
UniProt:
C8W759
LinkDB
All DBs
Position
complement(965753..969250)
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
MADTRYTPGQEKTIKTLDKPLFVAAGAGSGKTFTLTQRIVWALKEGSGADGKPYLSSLDQ
ALIITFTNAAATEIKERVREALEKEGLHSAALQVDDAWISTIHGMCSRILKIHALDLDLD
PEFEIIDDMTRNQLVTISIEEVLRELSQDESYAEFLSTYAGNRDALKSRIETLISYAQSS
PLGIDSISFVGDSSDLDVLKAELESLCGALEAFKAAIAEKKPDEAEQLQSVQSELLSKLQ
QHLVLSLTDFDQAFWEALGKAVKAVRSSKEIKMVRDEAVYQLKVCSSLFGLIQDVSEGQR
LKDVTEQVYKLFKQKKLAIGGLDNDDLLHLTAKVFEEHPEIAAVYTDKFKLVMVDEFQDT
DQQQVQMIKSLSGKDAQYLTTVGDAQQSIYRFRGADVDVFFRRQAEVPEDLQPRLVDNFR
SHNEILRFVAKVCSADGMIADFMDLSAGREEPTTPFIAHSPRVYFEVTKFVKSGSSKPGD
DISRKQLVAHQLADRINTLMQDENIQAKDVAILMSSVKEAQPYIEALRTFGIESVVSGAS
TFGEQPEVELIGSLLQTLANMYDSYEGLFPVLSSEIFNLDASDLLLLGTNFGENGQKITN
RDIAESLVNDAFNPPFEISLKLKNALEILSDARSSLSNNRVSDVLKKVVLDAGWISRLQN
KGNEGQSKIANIFAALEQIDSLQKELSVGIASVAKAFSEWCGTAKESPKVLHSSTQNAVT
FMTIHASKGLEFPVVAVVGAVSGPKASAGGEPFLHVKKDNSYQIAFSSSSKKLKNLYDGC
HEVPTSIDECKNLLKWRMFLEAQENEAEEQEQNRCLYVALTRAREAVILTSTIDLTKEGI
SPRYTRKITDALFEETPLSAGEHLFEYGGNLAGCMRVVEGSGKKDEPIQVEGLELVEPSD
VNPREEKYSQAVETFDIYEKAELSVASETTYDQRKGFFSYSSAHQQMAENFESENNQKLE
EEFKGVSQGHEADNPQPATEASVVLPGTLADDGVDPTSLGSAFHELAQIMVETQSKVDEQ
IIDRLCLKNSVPQRAVSRVKQALELWSNSEIRQEALAHDVVIAESPFTLQVDSEYGNYVE
GAIDLLAYNRGSKDALVVDYKTGDKGLSAAQIYEHHQMQANFYAYVLMQRGFTKVECAFV
CVEIEEAGQPHVARYAFDANHQPQL
NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatacacgttatacgcctggtcaagagaagaccatcaagacgcttgataagcct
ctttttgttgcagcaggtgctggttcaggaaaaacttttacgcttacacagagaattgtg
tgggctttaaaagaaggctctggagctgatggaaagccgtacttgagtagtcttgaccag
gcattgattattacgtttaccaatgctgcagctacagaaattaaggaacgcgttagggaa
gctttagaaaaagaaggcctgcatagcgctgcgttgcaggttgatgatgcgtggattagt
actatccacggtatgtgtagcagaatcttaaagatccatgcacttgatttggatcttgat
cctgagtttgaaatcattgacgacatgaccagaaatcagctggttaccatatctattgaa
gaagtactcagggagctttctcaagatgaaagctatgctgaattcctttctacttacgca
gggaacagagatgcgctgaagtcccgtattgaaacgctgatctcgtatgctcagtcatct
cctctaggaatagattctatttcgtttgtaggggacagctctgacctggatgttctaaaa
gcagagcttgagagtttatgtggtgcacttgaagcgttcaaggccgcaattgctgaaaag
aaaccagatgaagcagagcagctacagagtgttcaatctgagcttttaagtaaattgcag
caacacttggtcctctcgctcactgattttgaccaggcgttttgggaggctctgggaaaa
gccgtcaaggccgttcgatcttcaaaagaaataaaaatggtaagagatgaagctgtgtac
cagcttaaagtttgtagctctttatttgggcttattcaggatgtgtctgagggtcaacgt
ctgaaagatgttacagagcaggtctacaagctctttaaacagaagaaacttgctattggc
ggccttgataacgatgatcttttgcatctaacggcaaaggtgtttgaagagcatccggag
attgcggctgtttacacagataaattcaagcttgtaatggttgatgagttccaagataca
gaccagcagcaagtgcagatgattaagagtctctcgggtaaagatgcccaatatctcaca
acagttggtgacgcgcagcagtcaatttatcgttttcgcggcgctgatgttgatgtgttc
ttcagacgtcaagcagaggttccagaagatttacaaccccgtcttgtagataatttccgc
agccataatgagattttgcgatttgttgcaaaagtttgtagtgctgatggcatgattgct
gactttatggatctgtccgctgggcgagaagagcctacaactccgttcattgctcattca
ccacgagtgtattttgaagtaacaaaatttgtaaagtcaggaagctctaagccgggcgat
gatatttcaagaaaacaacttgtcgcccatcaacttgcggacagaattaacacgcttatg
caggatgagaatatccaagcaaaagatgttgcaattttgatgtcatcggttaaagaggca
cagccttatattgaggcacttcgtacctttggaattgaaagcgtggtttctggagcttca
acttttggtgagcagcctgaggttgaactgattggcagtcttttacagacactcgcaaat
atgtacgattcatacgaaggactatttcctgtactctcgagcgaaatttttaatcttgat
gcgtcagatttgcttctactaggtactaattttggagaaaatggacagaagattactaat
agagatatcgcggagtcattggtaaatgacgcgtttaatccaccttttgagataagtctg
aagcttaaaaatgctttagagattttgagtgatgctcgtagctccctctcaaataataga
gtttcagacgttcttaaaaaagtagttcttgatgctggatggatttctcgccttcaaaat
aagggcaatgagggacagtcaaagattgcaaatatttttgcagctcttgagcagattgat
agtttgcaaaaggagttaagcgttggtattgcttcagttgcaaaggcatttagtgagtgg
tgcggtacggctaaagagtcaccaaaggtgcttcatagcagcactcaaaatgcagtcacg
tttatgactattcacgcatctaagggattggaatttcctgttgttgctgttgtgggggca
gtttctggtcctaaggcatcagctggcggtgaaccatttttgcatgttaaaaaagataat
tcgtatcaaattgcattctctagcagttctaaaaaactcaaaaatttgtatgacggctgt
catgaggttcctacaagtattgatgaatgtaagaatcttcttaagtggagaatgttcttg
gaggctcaagagaatgaggctgaagagcaggagcaaaatcgctgtttgtatgttgctcta
acacgcgctcgagaagcagtcattcttacctcaactattgatctcactaaagagggaatt
agtccccgttatacacgcaagattacagatgccttgtttgaagagacaccactttctgct
ggtgagcatttatttgaatatggcggcaatcttgctggttgcatgcgtgtggttgagggt
tctggcaagaaggatgagccgattcaggttgaaggtttagagttggttgaaccttctgat
gtcaacccaagagaagagaaatactctcaagctgttgaaacgtttgacatttatgaaaag
gcagaactaagcgttgcctcagagactacgtatgaccagcgaaaaggcttctttagttat
tcatcagctcaccaacaaatggcagagaattttgagagtgagaataaccaaaagcttgag
gaagaattcaagggagtaagtcaaggacatgaggcagacaaccctcaaccagcaactgaa
gcttccgttgttttgcctggcacattagctgatgatggagtagacccaaccagccttggt
tcagccttccacgagcttgctcagattatggttgagactcagtctaaggttgatgaacaa
attattgatagattgtgcttgaagaatagcgttcctcagcgtgcggtatcacgagtcaaa
caagcacttgaattgtggagtaactctgaaataagacaagaagctttagctcatgatgtg
gttattgcggagtctccctttacgctgcaggttgattctgaatatgggaactatgtagaa
ggagctatcgatcttctcgcttataataggggaagcaaagatgcgctggtagttgactat
aaaacgggtgataagggccttagtgccgctcaaatttatgagcatcatcagatgcaagca
aacttctatgcttacgttttgatgcaacgtggatttactaaggttgagtgcgcgtttgtc
tgtgttgagattgaagaggctggtcagccacacgttgctcgatacgcatttgatgcaaac
catcaaccacagctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
