Aquimarina sp. AD1: D1815_20920
Help
Entry
D1815_20920 CDS
T05625
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
aqa
Aquimarina sp. AD1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT58100
UniProt:
A0A3A9YP59
LinkDB
All DBs
Position
complement(4886993..4890139)
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MKNFLGYFIKYPVAVNIFIVGFLIFGFLGYQKMNSSFFPLSDAKTIQITVTYPGASPEEV
EEGVVEKIERNLKGIIGIDRVSSVSQENSASVIIEILSGFDINLVLDEVKNAVDRVPSFP
KTIEPPVIETIKPTRPAISFIITGKDIPLRILKEYAQNIENDLLRIDGISQISLTGFPDE
EIEISISEAKLRNYNLTFEEVAKSIAEANISISGGSIKTKDEEFLIRADNKRYFADNLNN
IVIKSSADGSKVYLRDIAKLNDTFSENPDKLFYNGEQAVQIDLKNTNSEDLISSVESVKN
YIKKFNTENENIELKSTFNTADLIEDRISLLLENAIVGMLLVLILLSFFLRPSVAFWVAF
GLPISFFGMFILLPNYGVTLNMLSMFGMILVIGILVDDGIVIAENIYSRRKKGESPIQAA
VNGTLEVLKPILSAITTTILAFSVFFFLDGQIGDFFGDIALVVTLTLLVSLIEALLILPS
HLAHSKDIKNINKISKFNKLGERFMDYLLDKIYIPVYKKCLQNKFLSFTIIFFLFIITIG
AFTSGIIKLSFFPTNASDQIVATINTPQGTSERVTDSIATYIENNVWKINKDLGPNEINE
SHITGTVKRIGSSSSSSSITINLSPSETRSISSIEITDKIRASVGNIPILEKLSFNSGAN
VGGAPISVSLQGKNIEQINKAKEILYTELSKNPNVKDIIDSSPKGIKEINLKLKDNAQLL
GLSYNSLMTQVRNAFYGNEVQRIQRGQDEVKIWVRYDKQNRSTISNLNTIEISTSNGRVP
LSEVASYTIERGEVAINHLNGIREVTVEADIDNAKVSAADIMMDLKTRVAKGIEEKYLEV
TVSAEGQNREVNKIADSATAVFPAIIFLIYVVIVFTFRSFSQPFILLALIPFSIIGVAWG
HYLHGFPMSILSYLGIVGLIGIVVNDGLVFTNKFNSFLKEGLKFEEALYQTGRARFRAIF
LTSITTIAGLAPLMLERSLQAQFLIPMAIAISYGIAIATILTLFILPIFLSFSNTIKVYI
KYIRTGKKPTREEVERAIIEQKVANEKF
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactttctcggttactttataaaatatccagttgctgtaaacatttttatagta
ggttttctaattttcggctttctcgggtatcaaaaaatgaattcctcattttttccttta
tccgatgctaaaactatacagattacagttacttatccaggagcttctcctgaagaagtt
gaagagggtgtcgtagaaaaaattgaacgtaatcttaaaggtattataggtattgataga
gtaagttctgtttctcaagaaaatagtgcttctgtaatcattgaaattctgtctggtttt
gatattaatttggtattagatgaagtaaaaaatgcagtcgacagagtcccctcgttccca
aaaactatagagcctccggttatagaaacaattaaaccaacaagaccagctatctcattc
attattactggtaaggatattcctttacgaatattaaaagagtatgcccagaatatagaa
aatgacctactcaggattgatggaatttcgcaaatctcattgacaggatttcctgatgaa
gagatagaaatttctatctctgaagcgaaacttagaaattataatctgacgttcgaagag
gttgctaagtctattgcagaagctaacattagtatttctggaggttccataaaaacgaag
gatgaagagtttttgattagggcagataacaaaaggtattttgcagataaccttaataat
atagttataaaatcatctgctgatggatcaaaagtataccttagagatattgccaaacta
aatgataccttcagcgaaaatccagataagctcttttacaatggagaacaagcggttcaa
attgacttaaagaatacgaattccgaagatttaattagtagtgtagaaagtgtaaaaaac
tacataaaaaaatttaacaccgaaaatgaaaatattgaattaaaatcaactttcaacacg
gcagatctaatagaagataggatttctctcctactagaaaatgccattgtcggaatgtta
ttggtcttaatactcttatctttctttttacgacctagcgtggcattctgggtagctttt
ggattaccgatatcttttttcggaatgttcatcctcttacccaattacggagttactctc
aatatgctttctatgtttgggatgattctggtaataggtatattagtggatgacggtatt
gtaattgccgaaaacatttacagccgacggaaaaaaggagaatcaccaatacaagcggct
gtaaacggtacattagaagtattaaaacctattctttctgctattacaactaccatattg
gcattttcagtattcttttttttagatggtcaaataggtgacttttttggagatattgcg
ctagttgtcaccttaacattattggtgtctctaatcgaagccctattaattctaccctcg
catttagcccattctaaagacattaagaatatcaataaaataagtaagtttaataaactt
ggtgaacgattcatggactatttactggataagatatacattcctgtttataaaaaatgt
ttacagaacaagtttttatcgtttactatcatcttctttttatttataatcacaattggc
gcatttacaagcggtatcataaaactaagtttttttcctacgaacgcaagtgatcaaatt
gttgcaacaataaacaccccccaaggaacaagtgaacgtgttacagattcaattgccact
tatatagaaaacaatgtttggaaaatcaataaagatttaggtccaaacgagataaatgaa
tcccatattacaggaacagtaaagcgtataggttcaagcagttcatctagtagtattaca
atcaacttatctcctagtgaaacacgttctatttcttccatagagattacggataaaatt
cgtgcttctgtaggtaatattccgattcttgaaaaattatcttttaattctggagctaat
gttggtggggcacctatttctgtatccttacaaggtaaaaacattgaacaaattaataaa
gccaaggaaatcttatatactgaattaagtaagaacccaaatgttaaggatattatagat
tctagtccaaaaggtatcaaagaaattaatttgaagctaaaggataacgcacaacttttg
ggcttaagttacaatagtttaatgacccaagttagaaatgctttctatggaaatgaagta
caacgaattcaacgaggtcaggatgaagtgaaaatctgggtacggtacgataagcaaaac
agatcaactatcagcaaccttaatactattgaaattagcacctctaatggacgggttccc
ttatcggaagtagcctcgtatactattgaaagaggtgaagtagccattaatcacttaaac
ggaattcgagaagtaactgtagaagcggatatcgataacgccaaagtcagtgcagcggat
atcatgatggatttaaaaacaagagttgccaaaggcatagaagagaaataccttgaagtt
acagtttctgcagaaggtcaaaatagagaagttaataaaattgcagactctgcaactgca
gtttttcctgccattatttttttgatatatgtagttatagtattcacttttagatcattt
agtcagccatttatattattggcacttattccttttagcatcattggagtggcttggggt
cattatttacacggctttcctatgagtattttatcatatttaggtattgttggtttaata
ggtattgtagtaaatgatggtttggtatttactaataaatttaattcatttttaaaagaa
ggtttgaagtttgaagaagctctttaccaaaccggaagagcacgttttagagctattttc
ttaacctcgataactactatagcaggtcttgctccattgatgttagaaagaagccttcag
gcacagtttttaataccgatggccattgctatttcttatggaatagcgatagcaaccata
ttaacactattcattctgcccatttttctttcgttttctaatacaattaaagtgtatata
aagtatataagaacaggtaaaaaaccaaccagagaagaagtagaacgtgcaatcatagaa
caaaaagtagcaaatgaaaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
