Aquimarina sp. AD10: D1816_05545
Help
Entry
D1816_05545 CDS
T05712
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
Organism
aqd
Aquimarina sp. AD10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reprolysin_5
Reprolysin_3
Por_Secre_tail
Reprolysin_4
Reprolysin_2
FRG1
Fascin
Reprolysin
Peptidase_M64
Peptidase_M10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT59841
UniProt:
A0A3A9VJ72
LinkDB
All DBs
Position
complement(1301203..1303194)
Genome browser
AA seq
663 aa
AA seq
DB search
MHQDSSSSKLKLLTMKNILTIVFALITAIGFAQKQPHNPSERIQQEKTNGTVFENVDLFT
TVNKQKSKTKIPSELKDYTLFSFDKGKEAAFKSKAPVAMTLTIPGQKKAMSLELVKTKIT
TDDYQIIEMPSGKIVTPDNNVLHYRGIVKGVPNSVVAISFLSAEISGIISIGEKPSNLVI
GKLKNSNEQIIYEDKDIRHLNDFVCRIEDNPEKSEQLQDNTQGKAAVKCPKIFFDIANDI
VRDKGGAQGASDFIEAIFNQVSVLYANDDISIRLSGVKAWTSAAPFDGLTNYRNYRNRNS
FNGDLGHFVTYNFSGGVAWVNALCGSYKYAVSGIRKSFSNVPTYSWSVEVVAHELGHNLG
SPHTQACKWNNNNTAIDGCYGTEGGCARPGLPSGGGTIMSYCHLTNVGINFNKGFGPQPK
ALIQRTINSKSCVQTCDGGPGNDGSVTFQGNNNRYISSENGSNPMTCNRTVVGSFEKFTV
VDAGGGQVALKGNNGRYVSSENGGAPMTCNRTRIGSWEKFTIVDAGGGKKALKGNNGKYV
SSENGGAPITCNRTRIGSWEKFTINGLRNNTAIPQVAGLQNEIGMFPNPVKNLLTITMGT
FADEMSKVLVKDINGRTLQSTAVSNEAKVNGVQVLDLSNMVTGVYFVQITNSNRIITQKV
FIE
NT seq
1992 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatcaagattcttcatcttcaaaattaaaacttctaacgatgaaaaacattttaaca
attgtgtttgccctaataacggcaattggttttgcacagaagcaaccccacaatcctagt
gagagaatacagcaagaaaaaactaatggtactgtatttgaaaacgtagatctttttacg
acagttaataaacaaaagtcaaaaactaaaatcccatcagaattaaaagactatactctt
ttttcttttgataaaggaaaggaggccgcttttaaatctaaagctcctgttgcgatgact
cttactattcctggccaaaagaaagcaatgtcattagaacttgtaaaaacaaaaataact
acagatgattatcaaattattgaaatgccctctggtaaaattgtaacaccagataataat
gtactacattatagaggtattgtaaaaggagtacctaattctgttgttgctataagtttt
ttaagcgcagaaatatctggtattattagtattggtgaaaaaccaagcaatttagtgatt
ggtaaacttaaaaatagtaacgaacagatcatttatgaagataaggacataagacacctt
aatgattttgtttgtaggatagaagataatcctgaaaagagcgagcaacttcaagataat
acccaaggtaaagcagcagtaaaatgccctaaaatattcttcgatattgcaaatgatatt
gttcgtgataaaggaggtgcacagggggcttcagattttattgaagctatttttaatcag
gtttcagtattgtatgcaaatgatgatattagtattcgtctttctggagtaaaagcttgg
accagtgcagccccatttgatgggttaactaattatcgaaattatagaaatcgaaatagt
tttaatggtgatttaggacattttgtaacctataacttttctggaggtgttgcctgggtc
aatgcgttatgtggttcttacaaatatgcagtttcgggtattagaaaatcttttagtaac
gtacctacatactcatggtctgtagaggtagttgctcacgaattgggacataatttagga
tctccacatacccaagcttgtaagtggaataataataataccgctatcgatggctgttat
ggaacagaaggcggttgtgcaagacccggattaccatctggcggaggtactattatgagt
tattgtcaccttactaatgttggtattaattttaataaaggctttggtccacagccaaaa
gctttgattcaaagaactataaattcaaaaagctgtgtgcaaacttgtgatggtggtccg
ggtaatgatggatcagtaacttttcaaggtaataataatagatatatttcttcagaaaat
ggaagtaatccaatgacatgtaataggacggttgtaggttcttttgaaaaatttactgtt
gtcgacgcgggtggaggacaagtggcattaaaaggaaataatggaaggtatgtttcatct
gaaaatggaggggctcctatgacatgtaatcgaaccagaataggttcttgggagaaattc
actatagtagatgcaggtggaggtaaaaaagctctaaaaggaaataatggaaagtatgtt
tcttctgagaatggcggtgctccaataacctgtaatcgaacaaggataggttcttgggag
aaatttacaataaatggattaagaaataataccgctatacctcaggtagctggtttgcag
aatgaaataggaatgtttcctaatcctgtaaaaaacctattaactattacgatggggaca
tttgcagatgaaatgtcaaaagtgttggttaaagatattaacggtagaactttacagtca
acagctgtaagtaatgaagctaaagtaaatggagttcaagtacttgatcttagtaatatg
gttacaggagtttattttgttcagattacaaattctaatagaataattactcaaaaagtt
tttatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
