Aquimarina sp. AD10: D1816_09550
Help
Entry
D1816_09550 CDS
T05712
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
Organism
aqd
Aquimarina sp. AD10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_6
Por_Secre_tail
GH115_C
CBM_35_2
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT60584
UniProt:
A0A3A9W741
LinkDB
All DBs
Position
complement(2324691..2327729)
Genome browser
AA seq
1012 aa
AA seq
DB search
MKLKTQIILIVVCLAIFNVANAQRPFFNKSKDLLIAQFDSKPDPDDIHAQAALGSMLAHS
DFNGVKYYGVAGAYGRQGGQFIDSDELFDMVFGSANWTDADADRNGSVTRIANRVVPILN
NGGKVWVQEAGQSNITRDWIVEVKKRVNNDVVKNNVIVVQHSEWNQNHADNTTNKPAANP
VIINFIKNNSRYFYIDDGNAPFGGFGDHGPWETPEYRSRDKKWLNQARNSPNAKAKQLWN
EATRVVLKRYPGGVPYDWSFMKNGGIDYSDCVENWWIFNIGSNADSVTKFWNRYVINTTG
SNPDPDPDPSNCDKTYEEKNGIVAVEAENFVKQSKTKDREWFVIGAGTTGTPTPDPDPIH
SNGASGGKYIELLPDTRVTHGDPLVTGVSFSDTPGVAAIVDYKIKFNSPGKYFVWVRAHS
TGSEDNGVHVGIDGNWPASGARMQWCTGKNAWTWESKQRTAANHCGVAQQIFINVPTAGI
HTISFSMREDGFEMDKFILSKAYTKPTGTGAAPIAANCDNPNPNPTSIAVPGTIQVENFV
AKNGDVKAENTPGGGRNLGFIKNNNYTEYNINVANAGSYKLEAFTSSNGVGGNIVASVAG
NNLATIAVPVNNDWHNYSTPVSGNVNLAAGVQKIRFTYTGPAGFLFNFDRAVFTLNTPAN
SANCNVAPANLAVSGSNATSVTISYANTANDTRTFELRAFPKGGFTGNINTGGVGFASGA
AGSTSITMNGLQSGTSYDFVLRALCSGGTPGASPLAPTIVGSTTGGGSTPTTSTTTLTPV
NDSYLQGSTNFNSNIIRIENGNRVGYLMFDLSGISGTITDAKLKFTVAGDAGNGNLNVNL
GNSNNWNETNLSNGNKPANGVLLGSINKTYTIGNTETVALQANSISGNAVSLVLNATGGN
DFAIASKENTAATVPQLIVTYQSSKTGDDNIIANENAIIMYPNPTTDVLRLNGVSEIAKI
TVSDIAGKQVLFEMKSSENERVLDVSGLQSGMYFVTVQQQNQNKRVLRFSKR
NT seq
3039 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactcaaaactcaaattattttaattgtggtctgtctggccatatttaatgtggct
aatgcccaacgtccgttttttaataaaagcaaagatcttttaattgctcaatttgatagt
aaacctgatccagatgatatccatgcacaggctgcattaggatctatgttagcacatagt
gactttaatggtgtaaaatattatggggttgcaggagcttatggaagacaaggaggacaa
tttattgattcagatgaactatttgatatggtattcggtagtgctaattggaccgatgcc
gatgcagatagaaatggttcggtaacaagaatcgctaatagagtagtccctattcttaat
aatggcggtaaagtttgggtccaagaagcgggccaatcaaacattactcgtgattggatt
gtagaggtgaaaaaaagagtaaacaatgatgttgtaaaaaacaatgttattgttgttcaa
cacagtgaatggaatcaaaaccatgcggataatacgactaataaacccgcagcaaatcct
gtaatcataaactttataaaaaataactctaggtatttttatatagatgatggaaatgca
ccttttggaggttttggtgatcacggaccgtgggaaactcctgaatacagaagtagagat
aaaaaatggttaaatcaagcaagaaactctcccaatgcaaaagcaaaacaactttggaat
gaagctacaagagtagtccttaaaagatatccaggaggagtgccttacgattggtctttt
atgaaaaatggaggtattgattattctgactgtgtagaaaactggtggattttcaatata
ggaagtaatgcagatagtgttactaaattttggaatagatatgtaatcaataccacagga
tcaaacccagatccagatccggatccttcaaactgtgataaaacatatgaagaaaaaaat
ggaatagtagctgttgaagctgaaaactttgtaaagcaatcaaaaacaaaagacagagag
tggttcgttattggtgcaggtaccacaggaactccaacacctgatcctgatccaattcat
tcaaatggtgctagtggaggtaaatatatagaattattacctgatacacgtgtaacacat
ggtgacccattggtaacaggagtaagtttttcagatactccaggagtagcagcaattgta
gattataagattaaatttaattcaccaggtaaatattttgtttgggtaagagcacactct
acaggatctgaagataatggagttcatgtaggaatagatggtaattggcctgcatctgga
gctagaatgcaatggtgtacaggtaaaaatgcatggacttgggaaagtaagcaacgtact
gcagcaaatcactgtggagtagcacaacaaatttttatcaatgttcctacagcaggaata
catacaatctctttttctatgagagaagatggttttgaaatggataaatttattttatca
aaagcatatacaaaaccaacaggtactggtgcagccccaattgctgcaaattgtgataac
ccaaatcctaatccaacttcaatagctgttccaggaacaatacaagtagagaattttgta
gctaaaaatggagatgtaaaagcagaaaatacgcctggtggaggacgaaacctaggtttt
attaaaaataacaattatacagagtataatattaatgttgctaatgcaggatcgtataaa
ttagaagcgtttacatcatcaaatggtgtaggaggaaatattgtagcttcggttgcagga
aataatctagccacaattgccgttcctgtaaataacgattggcataattatagtactccg
gtttcaggaaatgtaaatttagctgctggggttcaaaaaattcgatttacatacactggt
cctgcaggtttcctatttaactttgatcgtgcagtattcactttaaatactccggcaaac
tcggctaattgtaatgtagctcctgccaatttagctgtttcaggttcaaacgctacttca
gtaacgatatcttatgctaatacagctaacgatacacgtacttttgaattaagagcattt
ccaaaaggaggatttacaggaaatattaatactggtggtgttggctttgcgtctggagca
gcaggtagtacttcaataactatgaatggcttacagtctggaacctcttatgactttgtg
ctaagagcattatgtagtggtggtactcctggagcaagtccgcttgcacctactattgtt
ggaagtacaactggtggtggatcaactccaaccacttcaacaactacattaacacctgtt
aacgatagttatttgcaaggaagtactaattttaatagtaatattattagaatagaaaac
ggaaatagagttggatacttgatgtttgacctttctggtataagtggtacaattacagat
gctaaattgaaatttactgttgctggagacgctggtaatggtaacctaaatgttaattta
ggaaattctaataattggaacgaaacgaatctgtctaatggtaataagcctgctaacgga
gtactgttaggttctatcaataagacatatacaattggcaatactgagacagttgcttta
caagcaaattcaatttcagggaatgctgtgtcgttagtgcttaatgctacaggaggaaat
gatttcgcaattgcatcaaaagaaaacactgcagctactgttccacaattaatagtaaca
tatcaatcaagtaaaactggtgatgataatataatagcaaatgaaaatgcgattattatg
tatccgaacccaactactgatgtgttaagacttaatggggtttctgaaatagcaaaaata
actgtatctgatatagcaggtaaacaagttctttttgaaatgaaatctagtgaaaatgaa
agagttttagatgtatctggacttcagtcaggaatgtactttgtaacagtgcagcaacaa
aaccaaaataaacgcgtattgagattctcaaaacgataa
DBGET
integrated database retrieval system