Aquimarina sp. AD10: D1816_15035
Help
Entry
D1816_15035 CDS
T05712
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
aqd
Aquimarina sp. AD10
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aqd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aqd02000
]
D1816_15035
Transporters [BR:
aqd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D1816_15035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
GEVED
MAM
fn3
Por_Secre_tail
InhA-like_MAM
Ig_DSCAM-DSCAML_C
CBM_5_12
Reelin_subrepeat-B
Pur_ac_phosph_N
fn3_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT61609
UniProt:
A0A3A9VLF6
LinkDB
All DBs
Position
3621331..3624966
Genome browser
AA seq
1211 aa
AA seq
DB search
MKKIYRSLNSILSFKEGDLNKWGILVLITMVLFTNEISAQTADQKSKIAQQSNLAKLGQL
EQSYARKAALEKKEAIQIANKNGWQIKMTNEDGSFSELQKIDQGLPIYFTTFNAAAARST
RANHLNSGGSLGLSLDGQGMTAHVWDGGHARVSHQEYDGPGGNNRVTIKDIASEGGTRLN
FHAAHVTGTISASGVRAEAKGMAPQTKIDGYMWNNDIAEATTAAADGMLLSNHSYGFRGD
LVPDQYFGAYIDESRAWDEVMFNAPFYLMVVAAGNDGNKDTYNAAPLDGNSSYDKLTGHS
TSKNNLVVANAQDANVNTNGTLVSVSINSSSSEGPTDDYRIKPDITGNGTNVFSTYESSN
TAYNSITGTSMASPNVTGSLLLVQQHYNNLNGNFMKAATLKGLALHTADDAGPSGPDAVY
GWGLLNAKAAAETVTTNGNESKVEELTLTNGQTYTITVDSDGSSPLLASISWTDRPGTAV
TATNSNNAVLVNDLDIRVSKGATTYSPYRLTGITTNGIGDNKVDPFERVDIANASGTYTI
TVTNKGTLTGGSQNFSLIVTGLTGTPVVCNATVPTGVNSSSVAGTTATVNWTEIAGASYD
VRYRQTGASSWTTLAATGTSQVLSSLTPSTSYEAQVRSKCSDGTNSSYSASVGFTTTAVQ
LNYCASNGQNVSDEHISNVQIGTINNTTGAGTGGYNDFTATSTSLAKGSTNTISITPTWS
GTKYNEGYSVWIDYNQDGDFTDAGEQVWSNSPSQTTPVSGDFTIPTSAKDGNTRMRVSMK
YNAIPTSCESFQYGEVEDYTINITGATADTQAPTVPTGLVASAVTETTLTLSWTDATDNV
AVTAYDVYQGTSNLGSVTTNTANITGLTANTAYQFSVRAKDAAGNESAASTTLNVTTAGS
TGTACTSGVSTFPYNEGFENTLGAWSQSTADDIDWSVDANGTPSNGTGPASATQGSYYIY
VEASGNGTGYPNKRAILTSPCFDLTATTQASFSFSYHMNGAADMGSIAVEASTDQGSNWT
SIWSQTGSQGNSWINATIDLSSYTGGGVQLRFNRVTGATWQADIAIDNISLTDTSSTPVN
QCDGVEAYSNTKAYQVGNRVTFQGSLYERTATGWTNLGSCSTTNSFVTTTDLNGPPVTNL
STKISVYPNPVMGPTINVLTQDTSTKSYVIYNILGQTVDQGRFNTSIDVQALEAGSYFIQ
VGNKNARFIKQ
NT seq
3636 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatttacagaagtctcaattctatattgagcttcaaagagggcgacctcaac
aaatggggtatacttgttttgataacaatggtgctctttacgaacgaaatctctgcacaa
accgcagatcaaaaatcaaaaattgcccaacaaagtaacctagccaaattaggacaatta
gaacaatcttatgctcgaaaagctgcattagaaaagaaagaagcgatacaaattgccaac
aaaaatggatggcaaataaaaatgactaatgaagatggtagtttctctgagttgcagaaa
atagaccaagggttacctatttacttcactacatttaatgctgctgctgctagatcaact
agagcaaaccatcttaattctggagggtctttagggcttagtcttgatgggcaaggaatg
actgctcacgtatgggatggtggtcatgccagagtatcgcatcaagaatacgatggacca
ggtggtaacaatcgtgttactataaaagatatcgcttctgaaggaggaacaagattaaat
tttcatgctgcacacgtaacaggaactatttctgcatctggagttagagctgaagcaaaa
ggcatggcacctcaaaccaaaatagatggatacatgtggaataatgatattgcagaagct
actactgccgctgcagatggaatgttattatctaaccattcctatggttttagaggagat
ttagttcctgaccaatactttggagcatatattgatgaatcaagagcatgggatgaagta
atgtttaatgcaccattttatctaatggtagttgccgctggtaatgatggtaataaagac
acttataatgcggcccctctcgacggtaattcttcttacgataaattaaccgggcattct
acatcaaaaaacaacttagttgttgccaatgcgcaggatgcaaacgtgaacactaatggt
actttagtaagtgtttctataaatagttcgagtagtgaagggcctactgatgattataga
attaaacctgatattacaggaaacggtactaatgtgttttctacttatgaaagtagtaat
actgcatataatagtattactggtacatcaatggcctctccaaatgttacaggatcactt
ttattagtacaacaacattataataacctgaatggtaattttatgaaagctgctaccctt
aaaggtttagctttacatactgccgatgatgcaggtccttctggtcctgatgctgtgtat
ggttggggattattaaatgctaaagccgcagccgaaactgtaactactaatggaaatgaa
tctaaagtagaagaattaacactaacgaatggtcaaacgtatacaattacagtagattct
gatggaagtagtcctttactagcatctatctcttggacagatagaccgggtactgcagtt
actgctacaaattctaataatgctgttttggttaatgatttagacattagagtttcaaaa
ggtgctacaacatacagtccttatagattgactggtattacaacaaacggaataggtgat
aataaagttgatccttttgaaagagtagatattgctaatgcatcaggaacatatacgatt
actgttactaataagggaactttaactggcgggagtcaaaatttctctcttatcgttaca
ggattaacaggaactcctgttgtttgtaatgcaacagttccaacaggtgttaattcatct
tctgtagcaggaactacagctacagttaactggaccgagatagcaggagcatcatatgat
gttagatatcgtcaaaccggtgcttcttcatggacaactttagcagctacaggtacttct
caagtactttctagtttaactccttcgacatcatatgaagcccaagtaagaagcaaatgt
tctgacggaactaattcttcctacagtgcttctgttggtttcacaactacagcagttcaa
ttaaactattgcgcatctaatggtcaaaatgtttcagacgagcatatatctaatgtacaa
ataggaactattaacaataccaccggtgccggaactggagggtataatgattttacagca
acttctacaagtcttgcaaaaggaagcacgaataccatttcaatcactccaacatggtca
ggaacaaaatacaatgaaggatatagtgtttggatagattataatcaagatggtgatttt
actgatgctggtgaacaagtatggtccaattcaccttcacaaactacacctgtaagtggt
gactttacaattcctacatctgctaaagacgggaatactagaatgcgtgtatctatgaaa
tacaatgctatccctacatcatgtgagtcttttcaatatggtgaagtagaagattatact
ataaatattacaggagcaacagcagacacacaagcaccaactgttccaacaggtttagtt
gcatctgcagtcacagaaacaacattaacattatcctggacggatgccactgataatgta
gctgttacagcttatgatgtttatcaaggtacttctaatcttggatctgtaacaacaaat
actgcaaatattacagggttaacagctaatacagcatatcaatttagtgtaagagccaaa
gatgctgcaggaaatgaatccgcagcaagcacgacactaaatgtaacgactgcaggaagt
actggtacagcttgtacatctggagtatctacttttccgtataacgaaggctttgaaaac
actcttggtgcatggtcacaatctacagcagatgatatcgattggtcagtagatgctaac
gggacaccatctaatggaaccggcccggcaagcgcaacacaagggtcttattatatttat
gttgaagcttctggtaatggaacgggatatccgaacaaaagagcaattttgacttctcct
tgtttcgatttaacagcaacaactcaagctagtttttcctttagctatcatatgaatgga
gccgctgatatgggaagcattgccgttgaagcgagtacagatcaaggatctaattggaca
agcatttggagtcaaacaggtagccaaggtaattcctggataaatgccactatagatctt
agttcatatacaggtggtggagttcagttgcgatttaacagagtaacgggagccacatgg
caagcagatattgctatcgataatatatcacttacagatactagtagcactcctgtcaat
caatgtgacggtgttgaagcgtatagcaatactaaagcatatcaggttggcaatagagta
acctttcaaggaagtctttatgaaagaacagcaacaggttggacaaatctagggtcttgt
agtactacaaattcttttgtcactacaacagatttaaatggccctcctgttaccaatctc
tcaactaagatttctgtataccctaacccagtaatgggcccaactattaatgttcttaca
caagatactagcacaaaatcttatgttatatataatatattaggacaaacagtagatcaa
ggaagatttaatacatctattgatgttcaggctttagaagccggatcgtattttatccaa
gtaggcaataagaatgcacgttttattaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system