Aquimarina sp. AD10: D1816_19585 Help Entry D1816_19585       CDS       T05712                                  Name (GenBank) PKD domain-containing protein   KO K20276   large repetitive protein Organism aqd  Aquimarina sp. AD10 Pathway aqd02024   Quorum sensing Brite KEGG Orthology (KO) [BR:aqd00001]  09140 Cellular Processes   09145 Cellular community - prokaryotes    02024 Quorum sensing     D1816_19585 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  PKD_4 PKD Big_5 Por_Secre_tail Big_7 CBM_3 K319L-like_PKD RoxA-like_Cyt-c Cytochrom_D1 CCP_MauG Cytochrom_C Vgb_lyase SGL Sde0182_C Big_9 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AXT62470 LinkDB All DBs Position 4700330..4707286 Genome browser AA seq 2318 aa AA seqDB search MKSKKHTTKSWAFTFVKNNIRKLCVIVLLVTLGVAIKSFRQVYDGTAGPKMTTQTWPAGT FLANFPEGDRINTYHRNYLFMSGQAGTGVWDVSNPTAPKRIQFSDAANNGHRWWKLEGDL FYREYSVPEVEGTGYKYLDLSDMLNRKPVTSSDILYTVKDGQSNYDNLETFPHTIDGSRV FDMRTGAQVDDIPATVSLPDVVVRVGNYVFYAPQTGDISVFDFGDPKNIKFLGSFGGDIP HEQYSTGIQLWRNYLVFMSGNQGPDALVGFDISDPTNVKRGFSLHSDQITLGRYMIFQDE YGFSGRFDRGVKFNFEKMEVEQEFFPPSSDETLQFIDNQWMPIGHILVASGDDKTSIFAH QDGLDIKPPTVGHHFPVAGAINQPQATTLGFVINETLDDLTLNDQTIQVSPLGGAPIKGD VTTTSYQVVNYAPKEELLPNTTYEVKFVEGGIKDAVGNGMEEYIFYFTTGGDTTNQAPEI AGIDLNIPSPVAINTAVDFTANATDADGNTLTYRWDFGDGSPKTAWIGKTASHTYTEAGN YLVQVQVSDNNGGFVVGSQSIVVVSGTASTLPTQSGPIAVDATNRITWSVNPDNNTVTLI NADNLKVIKEVTVGQDPVNVALDNTGKAWISCRDSDEVYVLNTDGTLVSKIALPKGSHPY GIVFTPDGSRGFVSAFGSGKIIELAPSTNTIKASLDIGATPRALAITSDGEKLLVTRFIS EDAAGEVWEVNLNTFTLKNTIALAIDDFTVDNGNEGRGLPNYIAGITIHPDNTSAWSVGK KDNILRGLARDGKPLVFDNVVRTAISPINLSTSKEELTKRLDIDNHGQPSSALYTPTGNY LFVTMQGNNRIVVIDPKRGLELLKKDVGKAPQGLAIDPTTNRVFVKNFMDRTVSVFDASD MIKNGSNTLKELSTINTVTTETLSPVVLKGKQIFYDAADLRMGTDGYVSCVSCHSDGTQD GRTWDFTDRGEGLRNTISLVGRAGTEHGRVHWSANFDEIQDFENDIRFHFNGQGFMSDAD FNKGTTALSLGDTKKGKSADLDALVAYIESLNTFDPSPYRNPNGTLTTDGVAGKSLFEDL KCNSCHSGEAFTDSKTGKMHDVGTIVTNSGGRLGKKLIALDVPTLKDVWATAPYLHNGSA KTLTEIFTKYNTNDAHGATSTLSATQMMQLEAYLKQIDGSAVSPATQQTLKIASPSDGTA IDKADPIKLSVDTNITGITKIEYYVDNALVEEVTTAPFESTWTPVIWKTYTITAKVFYNN GNTASITPEVSIKYKNTIEVMFVVGDKNNLTSEDQRIKSRLEQKLGFEITLFSDEEATSP QSANPFDMALISSTVDPRELGNDLEAAKVPLMTWNPFMYGKLKLTTGELNTGFGFTTEGF STITVSDPTHPMAAGAKASTALYSITQSLPFGNPTADAIVVAKAGTKPILFGYEASLDIP SRRVAFPLRDQFMHLLTDDGLNMFDAAVLWTLHGGDANVPIGPLPDVFFESPLDGELVNT PLEIRFKTEGWSIPSQQYKLRFRIDGQDRGLVSSGGVLTDPTVLTEGPHELSLQMERSDN SLTDLGETITVIVTKDQLPKDPTAIIQSPTDGGLIGTSFDIEFSTFKWDIAPGGQHVKYF IDGVEQGSVFEIKPIPVTDLAEGKHTIKLVLAKADGTVTGDPAEITVTVDKRFSNLPDTP FSLEYRDNSTSAGTVELKPVFQIVSEATEAVNLADFKIRYWFTPDNNVPMVFNTDYSAVT GTTGSFNTTGTHDYLEIGFGSSSGSLAANGKTGEIQTRLHHSGFQAHDQSNDFSYDGGKR ALTPHVLVTLYRKGVLVWGLEPSGGPTDTNGKPTANITSNTTQGMVPLAVAFDASGSTDP DGDVLSYSWDFGNGDTAVGVTTSYEFKDVGDQIVTLTVSDGNGKTDIATTTIKVLSPAIS VEANFVATPVSGTIPLVVDFDSSSSVFPVGSTINYTWDFGDGSTSDVPNPSHTYSLSGSY AVTLTISDGINSDISSVVTITANEPNAPIAEAIFVADASTGVAPAIINFDASASTSTGGS ITSYSWDFGDNTTATGVNASHEFSVAGVYTVTLSVLDAVGTTDSTTSTITITDPGSTDSC SFGAPQSSALQTLENLSYTEVHVLGTGGPDLSNMTNFTINWNLTNNGLYQLSMNTNNGNP SWWLDLTASITSQNFNETQPAITFSGTGIANFDGVYSATVDGDNFVLVSNSGFTLYFSNN GNAPNCQTTAVVTKAVIDNAKTIKAFPNPVIDNLTLVGEQDFRGTVINIVDIAGKVLSTQ IIQTNSKQVQINMNTLESGIYFVQIRKRNNTIIKQVIK NT seq 6957 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaatcaaaaaagcatactacaaaaagttgggctttcacctttgtaaaaaacaatatt cgcaagctttgcgttattgtattattagttacactaggtgttgctattaagtcgtttaga caagtatatgatggcacggcaggtcccaaaatgactacgcaaacctggccggcaggaaca tttttagccaattttccggaaggagacagaattaatacctaccaccgtaattatttattt atgagtggtcaggcaggaacaggtgtctgggatgtatctaatccaacagcaccaaaaaga atacagtttagtgacgctgcaaataatggtcacagatggtggaaattagaaggagattta ttttatagagagtattctgtgccagaagtagaaggtacaggctataaatatctggatctt tctgatatgttgaacagaaaaccggtaacatcttcagatatattatatactgtaaaagat ggccaatcaaattatgataacctagaaacgtttccgcataccatagatggtagtcgagtt ttcgatatgagaacaggagcgcaagtagatgacattcctgcaacagtttctttacccgat gttgtagttcgtgtaggaaactatgtgttttatgctccccaaacaggagatattagtgtg tttgattttggagatcctaaaaatattaaatttctaggttcttttggtggtgatatccca catgaacagtacagtacaggaatccaattatggagaaattacttggtctttatgagcggt aaccaaggaccagatgcattagtaggttttgatattagtgacccaacaaatgttaaaaga ggattcagtttacattctgatcaaataactctagggcgttatatgatttttcaggatgag tacggattctcaggaagatttgatagaggcgtaaaattcaactttgaaaaaatggaggtt gaacaagaatttttccctccatctagcgatgaaacacttcaatttatagataaccaatgg atgcctattgggcatattcttgtagcaagtggagatgataagacttctatttttgcccat caagacggactggatattaaaccaccaacagtaggacatcattttccggttgcgggtgct ataaaccagccgcaagcaacaacattaggttttgttataaatgaaacattagatgatctt accttaaacgatcaaacaatacaagtaagccctttaggaggagcacctataaaaggtgat gtaactacaacctcatatcaagtagttaattatgctcctaaagaagaattacttccaaat acaacttatgaagtaaaatttgttgaaggaggaatcaaagatgctgttggtaatgggatg gaagagtatattttctattttaccacaggaggagatacaactaatcaagctcctgaaatt gcaggaatagatttaaatatcccttctcctgtagccataaatactgctgtggattttaca gcaaatgcgacagatgcagacggaaatacacttacatatagatgggactttggcgatggt tcgccaaaaacagcatggatcggtaaaacagcttcacatacctatactgaagctggtaat tatcttgttcaggttcaagtttcagataataatgggggctttgttgtaggttctcaatct attgttgtagtatctggaactgcttcaaccctacctacccagtcgggacctatagcagta gatgctacaaatagaattacttggtctgtaaatccagataataatacggttactcttata aacgccgataatttaaaagttatcaaagaagtaacagtaggacaagatcctgtaaatgtt gcattagataatacaggtaaagcatggatttcttgtagagattctgatgaggtatatgta ttaaatacagatggaactttagtgtcaaaaatagctttaccaaaaggatcacacccttat ggtatcgttttcacaccagacggtagtcgtggatttgtatctgcttttggatcaggaaaa atcatagaactagccccttcaacaaatacaataaaagcatctctagatataggtgctact ccaagagcattggctattacaagcgatggagaaaaattgttggtgactcgatttatttct gaagacgctgcaggagaagtttgggaagtgaacctaaatacttttacattaaaaaataca atcgcattagcaatagatgattttactgtagataatggaaatgaaggtagaggattacct aattatattgcaggtataactattcatccggataatacatcggcttggtcagtaggtaaa aaagataatattctacgtgggctagcaagagacggaaaacctttagtttttgataacgtt gtacgtacagcgatttctcctataaacctaagtacgagtaaagaagaacttactaagaga ttagatattgataatcacggacaaccttcttcagcactttatacaccaacaggtaactac ctttttgtgaccatgcaaggtaataacagaatagttgttatagatccaaaaagaggatta gaattattaaagaaagatgttggaaaagcaccgcaaggattggcaattgatccaacaaca aatcgtgtttttgtaaaaaactttatggaccgtactgtttctgtatttgacgcatctgat atgatcaaaaacggaagtaatacccttaaagaattatcaacaataaatacagttactacc gaaaccctttctcctgttgtgttaaaaggaaaacaaattttctacgatgctgcagattta agaatgggaaccgatggatatgtaagttgtgtaagttgccatagtgatggtacgcaagat ggtcgtacctgggattttacagatagaggagaaggattaagaaatacaatctctttagtt ggtagagcaggaactgaacatggtagagtacactggagtgcaaactttgatgaaattcag gattttgaaaatgatattcgattccattttaatggtcaagggtttatgagtgatgccgat tttaacaaaggaacaactgcgttatctctaggcgatactaaaaaaggaaaatcagcagat ttagacgctttagtagcctatatagaatcactaaatacatttgatcctagcccttatcgt aatcctaacggaacattaactacagatggtgttgcaggaaaatctttattcgaggattta aaatgtaattcttgtcatagtggtgaagcatttacagatagtaaaactggtaaaatgcat gatgtaggaaccatcgtaacaaatagcggaggtcgattaggtaaaaaactaatcgcctta gatgtacctacattaaaagatgtttgggcaacagcaccatatttacataatggttctgcc aaaacactaacagaaatatttacaaaatataataccaatgatgctcatggcgccacttcc accttaagtgctacgcaaatgatgcaattagaagcttaccttaaacaaatagatggatca gctgtatcgccggcaacacaacaaacactaaaaattgcatctccctcagatggaaccgct atcgataaggctgatcctattaagttaagcgtagatactaatattacgggtattactaaa attgaatattacgtagataatgctttagtcgaagaagtgactacagcaccttttgagtct acatggactccagttatttggaaaacatatacaataaccgccaaggttttttataacaat ggaaatacagcttctataactccagaagtaagtataaaatataaaaatacgatcgaggta atgtttgttgtaggtgataagaataatttaacttcagaagaccaacgtattaaatcccgt ttggagcaaaaattaggttttgagataacattgttttctgatgaagaagctacaagtccg cagtctgcaaatccgttcgatatggcattgatatcttccactgtagatcctagagaatta ggaaatgatcttgaggctgccaaagtacctttgatgacatggaatccttttatgtatggt aagttaaaactaacaacgggtgagctaaatacaggttttggatttacaacagaagggttt tcaactattacagtttctgatccaacacatccaatggcggctggagcaaaggcaagcact gccttgtattctattacgcaaagtcttccttttggaaatccaacagcagatgctattgtg gttgccaaagcaggaacaaaaccaattttatttggatatgaagcaagtcttgatatacct tcaagaagagtagctttcccattaagagaccaattcatgcatttattaaccgatgatgga ttaaacatgtttgatgcggcagtattatggacacttcatggcggggatgccaatgtcccc ataggccccctgcctgatgtgttctttgaatctccattagatggtgaattagttaataca cctttagagattagattcaaaactgaaggatggtctataccttctcaacaatataagctt aggtttagaattgatgggcaagatagaggtcttgttagtagtggtggagtacttacagat cctactgttttaacagaaggaccacatgaattatcgttacaaatggaacgtagtgataat tcactcaccgatcttggagaaacaattactgttattgttacaaaagatcagttgccaaaa gatcctaccgcaatcattcaatctccgacagatggaggtttaataggaaccagtttcgat atagaattttcaacctttaaatgggatattgcaccgggaggacaacatgttaaatatttt atcgatggtgttgaacaaggatctgtttttgaaataaaacctattcctgttaccgatctt gccgaagggaaacatactataaaattagtgttagccaaagcagatggaacagtaactgga gatcctgccgaaattactgttacggtagataagagatttagtaatttgccagacacacct tttagtctagaatatcgtgataatagcacttcagcaggcactgtagagttaaaaccggta tttcaaatagtaagtgaggctacagaagctgttaatcttgcagattttaaaattagatat tggtttactccagacaataatgtaccaatggtatttaacacagattattctgcagtaact ggtacaacaggaagttttaatactacaggaacgcatgattatcttgagattggatttggc tcctcttctggaagtttggcagcaaacggaaaaaccggtgagattcagactagattacat cattcaggatttcaagcacatgatcaaagtaacgatttctcttatgatggtggtaaaaga gctttaacccctcatgttttagtaacactttatcgaaaaggagttttagtttggggatta gagccatcaggaggcccaacagatactaacggtaaaccaacggcaaacataacttcaaat accacacagggtatggtgccattagcagttgcttttgatgcttcaggttctactgatccg gacggtgatgtactatcttatagttgggatttcggaaacggtgatacagctgtaggagta actacttcatacgagtttaaagatgttggagaccaaattgttactttaacagtaagcgat ggtaatggtaaaacagatatagctactacaacaattaaagtgctgtcgccagcaatttct gtagaggctaattttgttgctacacctgtatcaggtacaattccattagtagttgatttt gattcttcatcatcagtatttccagtaggaagtacaattaactatacatgggactttgga gatggaagtacaagtgatgtgccaaatccttcacatacatattcattatctggatcttat gcggttacgttaactattagtgatggtataaactctgatatttctagtgtagttacaatt acagcaaatgaaccaaatgcacctattgcagaggcaatttttgttgccgatgcaagtaca ggagttgctcctgctatcattaattttgatgcatctgcttcaacaagtacaggaggtagt attacctcatattcttgggattttggagataatactaccgctacaggagtaaatgcctct catgaatttagtgttgctggagtatatactgttacattaagcgttttagatgcagtagga acaacagatagtacaacaagcactattacaataacggatcctggaagtacagatagctgt agttttggagcccctcaaagttcagcgttacaaactctagagaacttaagttataccgaa gttcatgttttaggaacaggaggaccggatttgagtaatatgactaattttactataaat tggaacttaacaaataatggactgtaccagttatctatgaatacgaacaatggtaatcca tcatggtggttggatttaacagcaagtataactagtcaaaactttaacgaaactcaacct gcgataacattttcaggaacagggattgcaaattttgatggtgtgtatagcgctacagta gatggtgataactttgtattggtatcaaatagtggttttacgctgtatttcagtaataat ggtaatgcaccgaattgccaaaccacagctgttgttacaaaagcagttattgataatgct aaaacaataaaagcttttcctaatcctgttatagataatttgaccttggtaggtgaacaa gattttagaggtactgttattaatattgttgatattgccggaaaagtattgtctactcaa ataattcaaacaaattcaaaacaagtacagataaatatgaatactctggaaagtggaatt tattttgtgcaaattcgtaaacgaaataatactataatcaagcaagttattaaataa

DBGET integrated database retrieval system