Aquimarina sp. ERC-38: NBT05_15130
Help
Entry
NBT05_15130 CDS
T09583
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
aqe
Aquimarina sp. ERC-38
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Ig_7
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZO80275
LinkDB
All DBs
Position
complement(3630758..3633466)
Genome browser
AA seq
902 aa
AA seq
DB search
MQTIDGDSTPGPDGIINLYTELGIPSGTGTWQARPRYAGTLDQSTGNVRTWEFLNATTNI
TREEYRFELFTAACGNTPAIVADLILGPYAGEAAPPQANGANAEICETDRLDLFETLTQN
EFIPAPHLNGRWEYIGSSSGANFKGSFDLNGSTFSAVVPKNDDDRSTDNEIFELRYTVSN
TTDCTANSKGETIVKVSVVRQVDPGTGNLIEICEEDITAGNWDTDINLNDDAYLVGEDKE
GYWLSELDLTGQLENEQDSIINIREIYDDLIANRGARFGCASYSFTYFVPQRSAVCTERR
ASVSFQIFEELRPFEQSPGIPELCINQIPSTYDLYNLIDFEDDGTNNFSYNDDNYVSWRQ
VSGPADLGILTQPNSLSDFIPDYDYHLGTINLNAGVPGSYTFEYAVAPKINCTGANEILD
PFVTDSLDLTFDLTPCSVLSTLITIELLPFDYAGENTEDLIFCNTDTSINLVSLLDTNGR
DTIVPGGVWRDSIGNPIQNEFVFPVIDSVQRFNFTYTTTTAKSCTDSANLKFAVYKQANA
GDGTDITLCSDDLNVTLFDLLTQTPDTIGRWTGPFGYESEDHRGVFDANNTMLPVLGQGT
YTYLIEGNEGCPDSDQATVNVTIIDPVPIGEDIFVSYCILDGRVNLYDVLDRQTTRTGVF
RDIENTAALSADGVVTFEQLPNPNNEVNKIYNFQYVVPNLAPCDESTLNVEVTIIDLPEP
VVPNPQFCILDAKRLDDIEVDVDNFNWYATLESDTPITDNPILLDNDVYYIANVDVDNCE
SDRVTVTVDILNTGERFANGDICTLEFQDGVSPDNNNQNDTFSLFVEEEFNIPEAFPDFN
LQIFNRYGTLVYEADKNTEEFRGESNTSVRLGDDLPSGTYFYIFNPNFDNNLPMQGSFYL
AR
NT seq
2709 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaactatagatggcgatagtactcccggaccagacggaattatcaacctgtacacc
gagttaggtatcccttccggtacaggtacctggcaggcacgtcccagatacgctggtact
ctagatcaaagtaccggaaatgtaagaacctgggaatttctaaacgctacgactaatatt
actcgtgaagaatacaggtttgagttgtttaccgcagcctgtggtaatacaccagcgatt
gttgctgatttgattcttggtccctatgctggtgaagcggctccaccacaagctaatggt
gccaatgcggaaatatgtgaaacggatcgattggatttatttgaaaccctaacacaaaac
gaatttatccccgcaccacatttaaacggtagatgggaatatataggaagtagttcggga
gctaattttaaaggatcctttgatttaaacggttctacttttagtgccgttgtccctaaa
aatgatgatgatcgttctacggataatgaaatttttgagttaagatatactgttagtaat
accacagactgtactgctaatagtaaaggagagactatagtaaaagtttctgtagtacgt
caggtagatcccggaaccggaaatttgatagagatttgtgaagaagatattaccgccggg
aactgggatacagatattaatttaaatgatgatgcgtatctggtcggtgaagataaagaa
ggatactggttatctgagttagaccttaccggacaacttgaaaacgaacaggattctatt
attaacataagagagatctatgatgatttaatagcaaatagaggagctcgttttggttgt
gcatcctattcctttacctattttgtaccccaacgttctgcggtttgtacagaaaggaga
gcttcggtatcttttcaaatttttgaagaattaaggccttttgagcaatccccgggtatc
cctgagctatgtatcaaccaaattccgtctacatatgacctttataatttaatagatttt
gaagacgatggtactaataattttagctataatgatgataattacgttagctggagacag
gtttccggtccggcagatttaggaattttaacccaacctaattccctatcggactttata
ccggattatgattatcatttgggtactattaatttaaacgcaggagttcccggaagttat
acatttgagtatgcagtagctccaaaaattaactgtactggcgctaatgagattcttgac
ccctttgttacggattcactggatcttacttttgaccttactccctgtagtgtattatct
acccttattaccattgaattattaccttttgactatgctggagaaaatacagaagactta
atcttttgtaatacggatacatcaattaacctggtaagcttactggatacaaacggtcgt
gatacaatagtgcctggcggggtttggagagattctattggaaaccctattcagaatgaa
tttgtatttccggtaatcgactcggtacaacgctttaattttacctatactaccactacg
gctaaaagctgtacggatagtgctaaccttaagtttgccgtttataaacaggcaaatgcg
ggagatggtaccgatatcacactatgttctgatgatttgaacgtaacattatttgactta
cttacgcaaactccggatactatcggtagatggacaggacctttcgggtatgaatccgaa
gatcaccggggtgtatttgatgctaataatacgatgttacctgtattgggtcaaggtact
tatacgtatttaatagaaggaaacgaaggttgtccggattcggatcaggcaaccgtaaat
gttaccattatcgatccggttcctatcggtgaagacatctttgtttcgtattgtatattg
gatggtcgtgtcaatttatatgatgtattagaccgtcaaactaccagaaccggagtcttt
cgggatattgaaaacacagcagccttgagtgcggatggagttgtcacttttgagcagtta
cctaatccgaacaatgaggtaaataaaatttataattttcaatacgttgttcctaacctt
gctccctgtgatgaatctacgttaaacgtagaagtgactattattgacctgccagaaccg
gtagtacctaatcctcaattttgtatcctggatgctaaacgtctggatgatattgaagta
gatgtagataactttaattggtatgcaaccttagaaagtgatacacccatcacagataat
cctatcttactcgataatgatgtatactatattgctaatgtagatgtagataattgtgaa
tcggaccgggtaacggtaaccgtagatatcttaaacaccggagaacgctttgcaaacgga
gatatttgtaccctggagtttcaggatggcgtctcaccggataataataatcagaacgat
actttttctttatttgtagaagaagagtttaatatacccgaagcctttccggattttaac
cttcaaatttttaaccgttacggtacgctggtatacgaagcagataaaaatacggaagaa
tttagaggagaaagtaatacttccgtccgtctgggagacgatttgccatcaggtacctac
ttttatattttcaacccgaactttgataataaccttccgatgcagggaagcttttaccta
gcccgataa
DBGET
integrated database retrieval system