Aquimarina sp. ERC-38: NBT05_17430
Help
Entry
NBT05_17430 CDS
T09583
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
aqe
Aquimarina sp. ERC-38
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aqe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aqe02000
]
NBT05_17430
Transporters [BR:
aqe02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NBT05_17430
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Big_1
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZO80711
LinkDB
All DBs
Position
4209517..4212003
Genome browser
AA seq
828 aa
AA seq
DB search
MNTIKLITFLLFLTASSISFAQVSVKGTVVDSQNTPMPGVSIMLKNAEKTFGRLTDESGQ
FEINAPSGTYNIEIRYLGFQPYKKNLDLNDKPLFDLGTIQLNEGTEQLQSVEVVGRARTD
YNSDYSFSSTKVAIKNRELPQAVSTITKELMNDRQAFQIADAIKTSSSVTHTGNYNHFNI
RGIIQAEDGQLINGLRTRQYYFLQPITSHIERAEVIKGPSSVSFSSVDPGGSVNLVTKKP
LKESRNEVSATAGSFGTLRATADFTGPLNESGSLLYRLNAAVQEARSFRNLVQNNQFLIT
PSITFLPNSTTALNVEMIYSNGVGNLDRGQPLFGAINGEFDLNSTDIETNVAAANDFYAS
KEFMVISNFSKKITDNIGFNASYMKQTWEEDLAEHRVAGSAAVDINGNSIPTLAELRYTE
RQQFWVTDNYGAFINFDLENEKITNKLLVGYDGSRWERTIGGASNGARRYLRLDGTATGF
DPAEAALFETIEIDGVLAPRPNVAHFNLADPNNTARETSNYRISEFAIPANLTTSNGIYI
QNQFKIGRFSALLNLRYDWYEDIFDYESDDEQSFKNEAFIPRIGLTYKATDAVSVYGSYV
QGFQPQSNTVTLSPFTGDFFFAASPASFDPLESNNIEFGAKGEFFGGRLATSASIYQITQ
KNLLLQDPNDESVLTERGEQRSRGFEWDLNGHVLPNLQLSASYAYIDAEIVEDDDPALVG
ERIGGAPEHSANLWGRYDFTSGALRNMGVGLGMEYRGERFSWFGDRLLLPAYTVFDAALY
YRPTGIDMQIALKFNNLLDETYWNGALNASRVFPGAPRNILLTTTYKF
NT seq
2487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacacaattaaattaataactttcttattattcctaacagccagcagtatttctttt
gcgcaagtaagcgttaaaggaactgtggttgactcccaaaataccccaatgccaggagtc
tcaattatgttaaagaatgctgaaaaaacctttggcagacttacggacgagtccgggcaa
tttgagattaacgcaccttccggaacatataatatcgaaatccgctacttagggtttcaa
ccctataaaaaaaatttggatttaaatgataaacccttatttgacctgggaaccattcag
ttgaatgaaggtaccgaacaattacaaagcgtagaagtagtaggtcgagcccggacggat
tataatagtgattactccttttcgtctactaaagtggctataaaaaaccgggaattacca
caagcagtatctacgattactaaagaattaatgaatgaccgacaagcctttcagattgca
gatgctataaaaacttctagtagtgtgacccacaccgggaactataaccactttaatatc
agggggattatccaggcagaagacggacaattgattaacggtctgagaacacgacaatat
tattttttacagcccattacttctcatattgaaagagcagaagtcattaaaggaccatcc
tcggtttccttttcaagtgtagacccggggggatcggtaaatttagtaactaaaaaaccc
ttaaaagaatcaagaaatgaagtaagtgctacagccggaagttttggtacccttcgagct
accgcggattttaccgggccgttaaatgagtccggctctctactataccgcctgaatgcg
gcggttcaggaagcccggtctttcagaaatctggttcaaaacaatcaatttttaatcaca
ccttctattacgtttttacccaatagtacgaccgcacttaacgtagaaatgatttacagt
aatggtgtaggaaatttggatcgtggtcagccactttttggggctatcaacggagaattt
gatttgaatagtacggatattgaaaccaacgtggcagcagcaaatgacttttatgcttct
aaagaatttatggtcatcagtaattttagtaagaaaataacagataacattgggttcaac
gcctcttatatgaagcaaacctgggaagaagacctggctgaacaccgggtagcaggttcg
gctgcggtagatattaatggaaatagcatccctactctagctgaattgcgttatacagaa
cgacaacaattttgggtgactgataattacggtgcttttatcaactttgacctggagaat
gaaaaaattactaataaattattggtaggatatgacggtagccgatgggaacgtactatt
ggcggagcttccaacggagcaagacgctacttaagattagacggtactgctactggattt
gatcccgcagaagcagcactgtttgaaaccatagaaattgatggagtacttgcccccagg
ccgaatgttgctcattttaacttggcggatcctaataatacggcaagagaaacgtcaaat
tacaggatttcagagtttgctattccggcgaaccttactacctctaatggcatttacatt
cagaaccaatttaaaataggccggttttcggctttgctaaacttgcgttacgactggtat
gaagatatatttgattatgaatcagacgatgaacaatcctttaaaaacgaagcttttata
cccaggataggcttgacctataaagctacggatgccgtaagtgtctatggttcgtatgta
cagggatttcaaccgcagtcgaatacggtgaccttatctccatttacaggggactttttc
tttgctgcttctccggccagttttgaccctctggaaagtaataatattgaattcggagca
aaaggtgaatttttcggcggaaggttagcgaccagtgcctccatatatcaaatcacccaa
aaaaacctgttattacaggaccctaatgacgaatccgttttaaccgaacgaggggaacaa
cgtagtcgtggttttgaatgggatttgaatggtcacgtattacctaatctgcagttaagt
gcttcctatgcctacatcgatgctgaaattgtagaagatgatgaccctgctttagtcggt
gaacgtatcggaggagctccggaacatagtgcgaatctttggggcaggtatgattttacc
agtggcgcactacggaatatgggagtgggattaggtatggaatatcgcggagaacgtttt
tcatggtttggagaccgtttactactaccagcctatactgtatttgatgctgcactatat
tatcgtccaacgggaattgatatgcagattgccttaaagtttaataatttattagacgaa
acctattggaacggtgccttaaatgcctctcgggtttttccgggagcacctagaaatata
ctcttgactacaacctataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system