Aquimarina sp. TRL1: HN014_02430
Help
Entry
HN014_02430 CDS
T10158
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
aqr Aquimarina sp. TRL1
Pathway
aqr02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aqr00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
HN014_02430
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
TrmI-like_N
CHU_C
I-set
Ig_3
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKX03822
UniProt:
A0A7I0NPW9
LinkDB
All DBs
Position
complement(643816..653835)
Genome browser
AA seq
3339 aa
AA seq
DB search
MRTILLPRIFLISIFLFFTSILSAQYIDIAITGGPTGTNPQIFPATSTANPVITQVRVNI
ISGTGSFAQSGDNLTFAHQNATDVVVEIEFLDASNTPVAGNYSFVINDIDGPSFESVSIP
CTDRIAFIRGEPNIALSETGGEILADGQAQSDNDAQFTYLNVNKVNVTLRATSSGWVKNL
DLNLNDFPVTNGSVIQCSNSDIDNDNVVDLDDEDDDNDGILDINEANGNNPNGDEDGDSI
PNWLDLVDNGNGGDGSTTDYTDANADGVPDVYDTDGDGVPNHYDSDSDNDGCGDAIEAGH
TDPDNDGFLGSSPVTVNVTNGRVTGQGGYTGGNVNAVTAGTAPAFTTQPSDQTVCLGDSA
NFSVAVSGSGLQFQWQENTGSGWSDISNGGSYSGATTASLTINPANTQDGNEYRVEVSKT
DYLCPETSNEVALTVNNFTTEGVVSSDQTVCTGGDPSVLTVTTSTVADGTLTHQWQSSVT
NETTGFSNISGATGTTFDPGVLTQDTWFKRIDTSVLNGVSCTDETNVIKVTVNAPPILSI
DDITADNIVNETEAGGTIAVTGTVGGGFTAGNTVTLTVNGNTYTGTVNASGNYSINVPGS
DLENDADATVDGSITIAGQDNCADSDTQVYSVDTTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELS
GDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTA
TVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADA
VAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDA
TDSATLDLTDPSAPTVVITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNG
NTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSA
PTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDIT
NGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDG
LISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGD
GGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDV
SVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDA
AGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDI
VTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSAT
LDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETI
TLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVVI
TEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVS
TSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISED
ELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVN
VTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLP
ADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVS
PDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTD
GNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTD
PSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAG
DITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVVITEDAN
NDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPS
PGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVVITEDANNDGLISEDELSGD
VDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATV
TDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVA
GDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATD
SATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDVVTVTDGNGNT
ETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPT
VAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNG
SVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLI
SEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDVVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGG
SVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSV
GLPADAVAGDIVTVTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAG
NVSPDATDSATLDLTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDIVT
VTDGNGNTETITLTAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLD
LTDPSAPTVAITEDANNDGLISEDELSGDVDVSVGLPADAVAGDVVTVTDGNGNTETITL
TAGDITNGSVSTSFPSPGDGGSVNVTATVTDAAGNVSPDATDSATLDLTDPTATLSIDDI
TTDNIVTGEEAEGVIAITGVVTGEFSEGDIVTLVIDGFVYTGTVDGSGLFSIEVPGPVLL
SDPDVTIEGSVSVTDVAGNVTEVISEKEYMLDQDGDGLTDEEEEDLGTDPTNPDTDGDGY
TDGEEVLVEDDPDTSVVPLVESDPLNACDPNGVPTGDCDGDGIENQYEDIDGDGDYTNDD
SDNDGIPDYLDEDDDGDGIATIDERPDPNGDGNPDDAVDSDGNGIPDYLQPNSVDPTAED
GIEVYTGFSPNGDGINDVFVIRGLENITNTVTIYNRWGVKVYEAESYGKDGAFFRGQSNG
RVTVQKGDNLPVGTYYYVIEYTLPTGEHKSKTGYLYINN
NT seq
10020 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaacaattttacttcccagaattttcctcattagtatttttttgttttttacatcg
atactatctgcgcaatatatagatattgccatcacaggaggaccaacaggtacaaaccca
caaatattcccagctacatcaactgcgaatccagtaattacgcaggtaagggtgaatata
ataagtggtacgggatcatttgcacaatcaggagacaacttaacatttgcacatcagaat
gcaacagacgtggttgtagaaattgaattcctggatgctagtaatactccggttgcaggg
aattattcttttgtgattaacgatattgatggcccttcatttgaaagtgtttctattcct
tgtacggatcggatagcatttattaggggagaacctaatattgcattatcagaaaccgga
ggagagattttggcagacggacaagcacaatcagataatgatgcgcagtttacctattta
aatgtaaataaggtaaatgtaacacttcgagcgacatcatctggatgggttaaaaacctg
gatttaaatctcaatgactttccggtaaccaatggttcagtgattcaatgttctaattcg
gatatagacaatgataatgtggtagatttagatgatgaagatgatgataatgatggaatt
ttagatataaatgaagcgaatgggaataatcctaatggggatgaagatggagattccatt
cctaactggttagatctggtagataatggaaatgggggagatggttctactactgattat
acagatgccaatgcagatggggttccagatgtatatgatactgatggagatggagttcct
aaccattatgattctgattccgataatgatgggtgtggagatgctatagaagcggggcat
acagatcctgataatgatggttttttaggaagttctcctgtgacagtaaatgttactaat
ggtcgggtgactggtcagggaggttatacaggaggaaatgtgaatgcggttacagctggg
acagctcctgcttttacaactcagccttctgatcaaacagtgtgtttgggagattcagct
aatttttcggttgctgtttctggttcaggcttgcaatttcaatggcaagagaatacagga
agtggctggagcgatatttcgaatggaggaagttactcaggtgctactacagcttcttta
acaattaatcctgcaaatacacaagatggaaatgagtatagagtagaagtgtcaaaaacg
gattatttatgcccggaaacttctaatgaagtggcacttacagttaataattttacaaca
gaaggagttgttagttcagatcaaacggtatgtacaggaggagatcctagtgtgttaacg
gttacgacttctactgtagcagatggaacattgacacatcagtggcaaagtagtgttact
aacgaaactactggtttttcgaatatatcaggggctacagggactacatttgatccggga
gtattgacgcaagatacttggtttaaaagaatagatacatcggtattaaatggagtaagt
tgtacagatgagacgaatgtgataaaagtaactgtgaatgctccacctattttgagtatt
gatgatatcactgcagataatatagtaaatgaaacagaagccggaggtacgattgcggta
acaggaactgttggaggaggatttactgctggaaacacagtaaccttgacagtcaatggt
aatacatatacaggaacagtaaatgccagtggtaattacagtattaatgtgccgggaagt
gatttggaaaatgatgcagatgctactgttgatggtagtattactatagcaggacaggat
aattgtgctgattcggatacacaagtatatagtgttgatacaacggatccaagtgctcct
acagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagt
ggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagctggtgatatagttaca
gttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaat
ggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggaggtagtgtgaatgttactgct
acagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggat
cttaccgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttg
ataagtgaagatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgct
gtagccggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattacttta
acagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggc
ggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgct
accgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgtgatcacagaa
gatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagt
gtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagttaccgatggtaatggg
aatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacgagt
ttcccaagtccgggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcg
ggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgct
cctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaatta
agtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatatagtt
acagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattacc
aatggaagtgttagtacaagtttcccgagtccgggagatggcggtagtgtgaatgttact
gctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgtta
gatcttaccgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggt
ttgataagtgaagatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtaggattaccagcagat
gctgtagctggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattact
ttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagat
ggcggtagtgtgaatgttaccgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagat
gctaccgatagtgctacgttggatcttactgatccaagtgctcctacagttgcgatcaca
gaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaagatgaattaagtggtgatgttgatgtt
agtgtaggattaccagcagatgctgtagctggtgatatagttacagttaccgatggtaat
gggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacg
agtttcccaagtccgggagatggcggtagtgtgaatgttaccgctacagttaccgatgct
gcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttactgatccaagt
gctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaa
ttaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatata
gttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatatt
accaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggaggtagtgtgaatgtt
actgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacg
ttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgac
ggtttgataagtgaagatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagca
gatgctgtagccggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgatt
actttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccggga
gatggcggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtcca
gatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgtgatc
acagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgat
gttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagttaccgatggt
aatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagt
acgagtttcccaagtccgggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgat
gctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatcca
agtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggat
gaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgat
atagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgat
attaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggcggtagtgtgaat
gttaccgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgct
acgttggatcttactgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaat
gacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctacca
gcagatgctgtagccggtgatatagttacagttactgatggtaatgggaatacagaaacg
attactttaacagcaggcgatattactaatggaagtgttagtacaagtttcccgagtccg
ggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagt
ccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgcg
atcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgtt
gatgttagtgtagggttgccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagttaccgat
ggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgtt
agtacgagtttcccgagtccgggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagttacc
gatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgat
ccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaa
gatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggt
gatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggc
gatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggcggtagtgtg
aatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagt
gctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgtgatcacagaagatgcaaac
aatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggcta
ccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaa
acgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacgagtttcccaagt
ccgggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgta
agtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagtt
gtgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgat
gttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagttacc
gatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagt
gttagtacgagtttcccaagtccgggagatggtggtagtgtgaatgttactgctacagtt
accgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttacc
gatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagt
gaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagct
ggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagca
ggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggtggtagt
gtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgat
agtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgca
aacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtaggg
ttaccagcagatgctgtagccggtgatgtggttacagttaccgatggtaatgggaataca
gaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccg
agtccgggagatggcggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaat
gtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcctaca
gttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaagatgaattaagtggt
gatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagccggtgatatagttacagtt
accgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatgga
agtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggtggtagtgtgaatgttaccgctaca
gttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttagatctt
accgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgata
agtgaagatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgta
gctggtgatgtagttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaaca
gcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttcccaagtccgggagatggcggt
agtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctacc
gatagtgctacgttggatcttactgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagat
gcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgta
gggctaccagcagatgctgtagctggtgatatagttacagttaccgatggtaatgggaat
acagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacaagtttc
ccgagtccgggagatggcggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggt
aatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggatcttaccgatccaagtgctcct
acagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttgataagtgaggatgaattaagt
ggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgctgtagctggtgatatagttaca
gttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattactttaacagcaggcgatattaccaat
ggaagtgttagtacaagtttcccgagtccgggagatggcggtagtgtgaatgttactgct
acagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgctaccgatagtgctacgttggat
cttaccgatccaagtgctcctacagttgcgatcacagaagatgcaaacaatgacggtttg
ataagtgaggatgaattaagtggtgatgttgatgttagtgtagggctaccagcagatgct
gtagctggtgatgtggttacagttaccgatggtaatgggaatacagaaacgattacttta
acagcaggcgatattaccaatggaagtgttagtacgagtttcccaagtccgggagatggt
ggtagtgtgaatgttactgctacagttaccgatgctgcgggtaatgtaagtccagatgct
accgatagtgctacgttggatcttactgatcctacagctacattatcgatagatgatatt
acgacagataatattgttacaggggaggaagcagaaggagttatagctattacgggagtt
gtaacaggagaatttagtgaaggagatattgttactttggttattgacggttttgtttat
acgggtacagttgatggttcagggttattttctatagaagttccgggaccggttttacta
agtgatccagatgtaacaatagaaggaagtgtttccgttacagatgtagcaggaaatgtt
accgaagtaatttcggagaaggagtatatgcttgatcaggatggagatggtttaacagat
gaggaagaggaagatcttggtacagatccgacaaatccagatacagacggagatggttat
acagatggtgaagaagttttagtagaagatgatccggatacctcagtagttccattagta
gagagtgacccgctaaatgcatgtgatccaaatggagttcctacaggagattgtgatggc
gatggtatagagaaccagtacgaggatattgatggtgatggtgattatacgaatgatgat
tctgataatgatggtattccggactatttagatgaagatgatgatggagatggtattgct
accattgatgaacgtccagatcctaatggagatggaaatccagatgatgctgtagattca
gatggcaatggtattccagattatttacagcctaattcagtagatcctacagcggaggat
ggtatagaagtttatacaggattttctcccaatggagatgggattaatgatgtttttgtg
attcgaggtttggagaatataaccaatactgtcacgatttataatcgttggggggtcaag
gtgtatgaggcagaatcttatggtaaagatggagcgtttttccgaggtcaaagtaatggt
cgagttacggttcaaaaaggtgataacctcccagttggaacttattattatgtaatcgaa
tatacattgcctacaggagaacataagagtaagacaggttacttatacataaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
