Amphimedon queenslandica (sponge): 100640409
Help
Entry
100640409 CDS
T02284
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase dbp2-like
Organism
aqu
Amphimedon queenslandica (sponge)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
DUF4809
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100640409
NCBI-ProteinID:
XP_003385512
UniProt:
A0A1X7V7K1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MSRGSFGRYPSSSSRRRSRSRSPRRQSYSNDSRYGGYGGYSGYSGSSHHGHGYNSGPSGY
HKERSDYRNLDTYVPRKTRWDTEKLPSFRKNFFREHPNSVARPQSEVAEYCRSRNMFVKG
QNIPKPCLKFEEANFPEYMYDVMKRQGFVEPTPIQAQGWSMALSGSDVVGIAQTGSGKTL
AYSLPGLIHIENQPRLQKGEGPIVLVLAPTRELAIQVQNVVQEYSKVVGLRTCCVYGGAP
KVPQLREISSGCHFVIATPGRLIDFMESGKVSLKRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIF
DQIRPDRQVLMWSATWPKEVQGLAGDFLKNYIQVNIGSLELCANHNITQVVEICEEFQKE
SKLNSLLESIMGQKENKTIIFVETKRRVDEITRKLRYGGWPAICIHGDKVQTEREWVLNE
FRSGKAPILLATDVASRGLDVTDIKYVINFDFPGNTEDYVHRIGRTARAKNTGTAYSFFT
KQNARQAKDLLDILREAGQSINPKLYDMMEFAKTMIKEKSRMRYQARHSGGVGSSGGSKP
MNGHGGRGRGGKFPRGKGSSPWSSATNGPSAANGGTANGYSGMYSGGGYGSYSQQPPALN
MYPPPPPPPPPRGLEQNAAQFSMPMMYYPVPPHVPIQQPPVPPTTASQ
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgcgaggttcatttggtcgttacccctcttcatcctctagaagaaggagtcggagt
agaagtcctagacgacagtcttacagtaatgattctaggtatggaggttatggtggttat
agtggctatagtggcagttctcatcacggacatggctacaattcgggaccttcaggctat
cataaagagagaagtgactatcgaaatttggatacttacgttcctcgcaagactagatgg
gacactgagaaacttcctagttttcgtaaaaacttttttcgggagcatccaaattctgtg
gctcgtcctcaatctgaagttgctgaatattgcagatcaaggaatatgtttgtgaaaggt
caaaatattccaaagccttgtcttaagtttgaagaggcaaattttcctgagtacatgtat
gatgtaatgaagcgtcaaggatttgttgaacccactcctattcaagctcagggttggtca
atggcattaagtggctctgatgttgttggtattgcacaaactggctctggaaagacgtta
gcttattcccttcctggtttgattcacattgaaaatcagcctagattgcaaaagggagaa
ggtcctattgtccttgttttagctcctactcgtgaattagccatacaagtccagaatgtt
gtgcaagaatacagcaaagtagttggattacgtacgtgttgtgtatatggaggtgcacct
aaagtcccacagcttcgagaaatatcaagtggttgccactttgttattgctacccctggt
cgattgattgattttatggaatctgggaaagtgagcttgaagagatgcacttacttggtc
ttggatgaggctgatagaatgttggatatgggttttgagcctcagataaggaaaattttt
gaccaaattcgtcctgataggcaagttcttatgtggagtgctacatggccgaaggaagtg
caaggattagctggtgatttcttaaagaattacattcaagttaacattggctcattagaa
ttatgtgctaatcacaatataacccaagttgtggaaatatgtgaagagtttcaaaaggaa
agcaaattgaattccttgcttgagtccatcatgggtcaaaaggaaaacaaaacaattata
tttgttgagacaaaacgtagagttgatgaaattactaggaagcttcgttatggaggttgg
ccagctatttgtattcatggcgacaaggttcaaactgaaagagagtgggttttaaatgaa
tttcgttctggtaaagctcctattttgttggctactgatgtagcttcaagaggattagat
gtaactgacattaaatatgtgatcaattttgattttcctggtaatactgaagattatgtt
catcggattggacgaacagctcgtgccaaaaacactggcactgcatacagcttctttaca
aaacagaatgcaaggcaagcgaaagatctgcttgatatactaagagaagccggacaatct
ataaatcccaaactttatgacatgatggagtttgctaaaacgatgataaaagaaaagtct
cgtatgcggtatcaagcacgtcattcaggtggagttggctcaagtggtgggagtaagcct
atgaatgggcatggtggtagaggacgaggaggaaagtttccaaggggaaaaggaagtagt
ccttggagctctgctactaatggacccagtgctgctaatggaggaactgctaatgggtat
tctggcatgtactctggtggaggatatggaagctattctcagcagccaccagctttgaat
atgtatccacctcctcctcctcctcctcctcccagaggattggagcaaaatgcagcgcag
ttctcaatgccaatgatgtattatcctgtcccaccacatgtacctattcaacaacctcct
gttccacctactactgcatcacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
