Amphimedon queenslandica (sponge): 100641176
Help
Entry
100641176 CDS
T02284
Name
(RefSeq) NFX1-type zinc finger-containing protein 1-like
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
aqu
Amphimedon queenslandica (sponge)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_19
AAA_30
SLFN-g3_helicase
ResIII
UvrD-helicase
PhoH
nSTAND3
NPHP3_N
EloA-BP1
AAA_22
RNA_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100641176
NCBI-ProteinID:
XP_011404801
UniProt:
A0A1X7UL49
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2025 aa
AA seq
DB search
MNSSSSDEEIHIPQINLRERAHGASPFVGGFRRGSRGFRPGGWRGRTDRPGGFRSDISDE
SLDPGSSRGRGDRGRRGRGRDRFQRSDRARGNDYSSGDRHSAADGPNKRGRGGKDGSRGR
GRGGSRSAHVHRMEFSDLVDLAKSPPSEVVNKIQDDLKGFQESLNSCNKVPEKVKERYIA
AIISLLLKICQSSDEKANMIIAEFLSDRCSEFHVLLKHYVSETLLSQTNTHNMVSQLLLL
FKQLLTRMPLSAWHILPINDFHEVVMTTSVDYNEHFMVTDLKALYTEAKQRHMEKKKSSE
IHFEWDNSLYRTIPIVPTMDEICSSDPPRLRSNIINGAYTDWEHYYDVQFRLLREDFVAP
LRRGVTLYLSQERTGRLTDINVYKDVYILKPEFTENGICYKVQFDVSRFRQRKSWAHSKR
LIFGSLLCFSPKNNQFRETVYFATVVERKPEDLVKGYFYVQFENSQEIFQHIHKTCFVVI
ESRAYFEAIRHILVSLQKAETGTMPFKRYLIDNNPRPVNRPSYLQNGTYYDITWLYPESK
QKSHLSLEIDITDEHSWPTEDQLELDASQINAIRMALTQEISVIQGPPGTGKTYIGYKIV
QTLLQNRDIWDPTHSSPILVMCYTNHALDQFLQGIIHQKIYLEDNTDEILLHYPYDMHSK
VERVPDVVRIGGRSKSEEIQKHSLWNARGNTVPYYKLRNLRELKDDITTEALKIPLHSNA
NVMYDVVNEYMVGREGMDLLRDVINPSHFYELSLLGEEFDDIGLSLELWLGFWTLPTETA
HQFSISSSIPPDTEHEYTSAPDDQSACDDDDVMLENEEENIDIIGEAEIEESNRQLDDVG
FKRLKLEDKHVSIKEDDILSQHIKQEDKDHSQFKIEKKDSREIKKILQAIRYIDPLEEDE
EIEIADVRNLPMISKYRLFRLWVVKLQRMLTDVTQRKLISLEEKCRAYKEAQMEVDRIAL
EKADVIGMTTTGAAKYQHILHLVKPKIVIVEEAAEVLESHIVSALNAGTEHLILIGDHKQ
LRPKPNEYELAKKHHLEISLFERLLLNNLPHATLLIQHRMRPQISSLVCPFIYDELIDHE
TVTTYENIRSCDKNMFFFNHKHPETEIEHLLSHSNVGEAKLVVSLCRHLLKQGYKPSQIT
VLTAYTGQLLCVRDMMPKKNFEGVQVVNIDNFQGEENDIILLSLVRNNELKKVGFLKEEN
RVCVALSRARMGFYCFGNFDMLRAVVPIWDRILSYIESEGCFGSSFPIHCHNHPQYKISI
EKAEDFIIHFPDGGCNIPCIYRLNCGHHCRRRCHVNDPNHEQYCCKEPCDKLCHRDLHPC
PLRCSDACKRCTYLISQVMPSCGHIQDMECYKNPAEEQCHNPCSKKCPNGHICHKKCSEY
CGNCIVLVDKIIPRCKHIVQMYCFLDPSIAICYEKCQKIYEGCNHKCPKKCFEDCSVSCE
KQIEKVLPCSHIDVIPCSMDPALAKCTKPCQRKRECGHPCKGVCGESCSSYKCSEPVKLT
LPCGHISTITCHNCSTENVYECNKPCEKILSCGHPCKRTCSSPCTTQCTQRVSFTCCKGH
HTYKVRCFEAKNADLVCDKKCVEKLPCGHACTNKCGEECSSCAQSVDKHCPCGHKHKFKC
GEYGVCSCKKKCPIILQCGHKCSGDCGECYTKRMHPPCMHQVQVNRFCGHFGSAPCIGLF
DQCQQSCRLSVCPHNKTPCDHKCYEPCHAAQCEEKCIVECSHSKCTQICSEVCSVPSCTK
PCTKLLDKCHHSCSTVCGEECISECCPKCSGKKFSEKVKGLGKKANITTEAIIKLNCGHI
YSVNYLNQRFTPKGDQDTLICPLLCPACSKPFVLPYYWQMTQERAKDIKQVKRQLPTNPV
TYSPDRHRLAFRKVTLDAETACALKLFSNAMELKSQLNITTFIENMLKQTKCKLTMQIVT
DIESELFRLSLLTLAKHVPETTLSKQPLHSLLQQMDEDHNLRLTYEMYEEYLPAIRSNSV
YEVVPVSLPKITKGQWYKCRHAGHIYFVPAKYGANCPECTECHSK
NT seq
6078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagcagtagcagtgacgaggaaatacatattccacaaataaatcttagggaaaga
gcccatggagcatctcccttcgttggtggttttagaagaggaagtcgtggttttagaccg
ggtggatggagaggaagaactgatagaccaggaggttttagaagcgatatatcagatgaa
agtttagaccctggaagcagcagaggaagaggtgatagaggacgaagaggaagaggaagg
gacagatttcaaagaagcgacagagctagaggaaatgattattcttctggtgatagacat
agtgcagcagatggaccgaacaaaagaggaagaggagggaaggatggtagcagaggaaga
ggaagaggtggaagtcgctctgctcatgtacacagaatggagttttctgatttggtagat
ttagccaagtctccaccttcagaggttgttaataaaattcaagatgatcttaaaggtttc
caagagtccttgaatagctgtaataaagtacctgaaaaagtaaaggagcgatacattgct
gcaattattagtctgctcttaaaaatttgccaatcgagtgatgaaaaggctaatatgata
attgccgaatttttaagcgacagatgctctgagtttcatgttcttcttaagcactatgtc
tccgaaacacttctttctcaaactaatactcataatatggtatctcagcttttgttgctg
tttaagcagttattaacacgtatgcctttgtcagcatggcatattctgcctattaatgat
tttcatgaagttgtaatgaccacatcagttgattacaatgagcattttatggtaacagat
cttaaagcactctatactgaagctaaacagcgacatatggaaaagaaaaaatcgtccgag
attcattttgaatgggataacagtctttatcgcactatacccattgtacctacaatggat
gagatatgctcttccgatcctccacgactgaggtccaatattatcaatggagcgtacact
gattgggagcactactatgatgtacagtttcgtcttttacgtgaagattttgtagctccg
ctacgaagaggtgtaaccctttatctttcacaagagaggactggacgattgacagatatt
aatgtttacaaagatgtctatattctaaaaccagagttcactgaaaatggaatatgttat
aaagttcagtttgatgttagtcggtttaggcagcgaaaaagctgggcacattcaaagcgc
ctgatatttggttcacttctctgtttctcacccaagaacaatcaattcagagaaaccgtt
tattttgcaacagttgttgagagaaagccagaagatttagttaaagggtatttttatgtt
caatttgaaaatagccaagaaatttttcagcacattcataagacctgttttgtcgttatt
gagtccagagcctattttgaagctattcgtcacattcttgtgagcttgcaaaaagcagaa
acaggcacaatgccattcaagcgttatctaattgataataatcctagaccagtaaacaga
ccatcatatcttcaaaatggaacgtactatgatattacttggttgtatcctgaatcaaag
caaaagtcacaccttagccttgaaattgatatcacagatgagcattcttggcctactgaa
gatcaattagaattagatgcgtcacaaattaatgcaatcagaatggcactcacacaagag
atctcagtcattcaaggcccacctggcactgggaagacatacattggatacaaaattgtt
caaacattgcttcaaaatcgggatatttgggatcccacacattcatctccgatcttagta
atgtgctatactaatcatgctctggaccagttcttgcaaggtattattcatcaaaaaata
taccttgaagacaacacagatgaaatattattgcactacccatatgatatgcattcaaaa
gttgagcgtgttccagatgttgtaagaattggtggtaggagcaagagtgaggagatccag
aaacatagcctatggaatgcccgaggaaatactgtgccttattataagcttcgtaatctg
cgagaactgaaagatgatattactacagaagcattaaaaatacctctgcatagcaatgca
aatgtaatgtatgatgtagtaaatgagtatatggttggcagggagggtatggatttactg
cgagatgtcattaatccgtctcatttctatgaattaagccttcttggtgaagagtttgat
gacattggtttatcattagagctatggctagggttttggacattaccaactgagacagct
catcaattttccatttcatcttctataccacctgatacagaacatgaatatactagtgct
cctgatgaccagtctgcatgtgatgatgatgatgtcatgttggaaaatgaagaagaaaat
attgacataattggtgaagctgagattgaagaatctaataggcagctagatgatgtaggc
tttaagcgtttaaaattggaggataaacatgtttcaataaaagaagatgacatccttagc
caacatattaaacaagaagacaaagaccacagtcaattcaaaatagaaaaaaaggacagc
agagaaataaagaaaattctgcaagcaattcgttatattgaccctctggaagaagatgaa
gaaatagagattgctgatgtaagaaaccttccaatgataagtaagtacaggctctttaga
ttatgggttgtaaagttacaacggatgctaactgatgttactcaaagaaagcttatttca
ttagaagaaaaatgtcgtgcatacaaagaagctcaaatggaagtagatcgtattgcttta
gaaaaagctgacgtcattggtatgacgacaactggagcagcaaaataccaacatattcta
caccttgtcaaacctaaaatagtaatagttgaagaagcagctgaagtattagagtctcat
attgtatcagctcttaatgctggtacagagcatctcatattgattggagaccacaagcaa
ctgcgtcctaaaccaaatgagtatgagttagcaaaaaaacatcaccttgaaatttcactt
tttgaaaggttgctgctcaacaatcttcctcacgctactcttcttattcaacatagaatg
agaccacagatatccagtttagtttgtccttttatatatgatgagctgattgaccatgaa
accgtcacaacctatgaaaatatcagaagttgtgacaaaaacatgtttttctttaatcac
aagcatccagaaacagagatagagcatttgcttagccactcaaatgtaggtgaagctaaa
ttagttgtttctttatgcaggcatcttctaaaacaagggtacaaaccatcacagatcaca
gttctaacagcttacactggacagctactctgtgtgagggatatgatgcctaaaaagaat
tttgaaggtgtgcaggttgtcaatattgataattttcaaggagaagagaatgacattatc
ttactatcactggtgcggaacaatgaattgaaaaaggttgggttccttaaagaagaaaat
cgtgtctgtgttgctttatcgcgggctagaatgggcttctactgctttggaaattttgat
atgcttcgtgctgttgttccaatttgggatcgtattctaagttacattgagagtgaagga
tgttttggctcaagttttcctatccactgtcacaatcatcctcagtataaaattagcatt
gagaaagctgaggactttattattcattttcctgatggtggctgcaatattccttgcata
tatcgtcttaattgtggacatcactgtagacgtcgttgtcatgtgaatgatccaaatcat
gagcagtactgctgcaaggagccttgtgataagctatgccatagagatttgcatccttgc
ccacttagatgctctgatgcttgtaagcgttgcacttaccttatatctcaagtaatgcca
agttgtggtcatatccaagacatggaatgttacaaaaatcctgctgaagagcaatgccat
aacccttgtagtaaaaaatgtcctaatgggcatatatgtcataaaaagtgctcagaatat
tgtggaaattgtatagtacttgtggacaaaattattccaaggtgcaaacatatagtacaa
atgtattgtttccttgatccatcaatagcaatctgttacgagaaatgccaaaaaatttat
gaaggttgcaatcacaagtgcccaaaaaagtgctttgaagattgctctgtttcttgtgag
aaacaaattgagaaagtccttccttgttctcatattgatgtcataccttgctcaatggat
ccagcattagcaaaatgtactaaaccttgtcagcgaaaaagggaatgtggacatccttgc
aaaggagtctgtggagaaagttgttcaagttataaatgctcagagccagtgaagcttact
ctaccttgtggtcatatatctactatcacctgtcataattgctcaacagaaaatgtttac
gagtgtaacaaaccatgtgaaaagatactatcttgtggtcacccatgtaaaagaacctgt
agctctccctgcactactcagtgtactcaaagagtttcatttacttgttgcaaaggtcat
cacacttacaaagtaagatgttttgaagctaagaatgcagatttagtttgtgataaaaaa
tgtgttgagaaattgccttgtggtcatgcatgcactaacaagtgtggtgaagaatgttca
tcttgtgctcaaagtgttgataaacactgtccctgtgggcacaaacataagttcaaatgt
ggtgaatatggagtatgttcttgtaaaaaaaagtgtcctataattcttcagtgtggacac
aagtgttcaggagattgtggagagtgttacactaaacgaatgcatcctccatgcatgcac
caagtacaagtcaacaggttttgtggtcactttggttcagctccatgcattggattattt
gatcaatgccagcaatcttgtcgtctctcagtctgccctcacaacaaaacaccttgtgat
cacaagtgttatgagccttgccatgctgcacaatgtgaggaaaagtgcattgttgagtgt
tcccacagtaaatgcactcaaatttgcagtgaagtctgtagtgtaccaagctgcactaaa
ccctgtactaaattattggataagtgtcatcattcttgctcaactgtttgtggtgaagaa
tgcattagtgagtgttgcccaaaatgtagtggtaagaagttttctgagaaagtcaaaggc
cttgggaaaaaagcaaatattaccacagaagctattatcaaacttaattgtggtcacatt
tattctgtaaactatttaaatcaacggtttacacccaaaggagatcaagacacattaata
tgtcctctcctttgtcctgcatgttctaagccttttgtattaccctattactggcagatg
actcaagagagagctaaggatatcaaacaagttaaaaggcaacttccaactaatccagtt
acttattcaccagatcgccatcgtttagcatttagaaaagttactcttgacgctgaaact
gcctgtgcattaaaacttttctctaatgctatggaactgaaatctcagctcaatattaca
acatttattgaaaatatgctgaaacaaacgaaatgtaaactaacaatgcagattgttact
gatattgagagtgagttatttcgattaagccttcttactttagcaaaacatgttccagaa
actactttaagtaagcaaccacttcatagtctactgcagcaaatggatgaagatcacaat
ttgaggctaacttacgagatgtatgaagagtatttaccagcaattcgtagcaacagtgtt
tatgaagtagttccagtatctttaccaaagataactaaaggacagtggtataaatgcagg
catgctggtcacatttacttcgttcctgccaagtatggagccaattgtccagaatgtact
gaatgtcactcaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
