Rhizosphaericola mali: E0W69_007870
Help
Entry
E0W69_007870 CDS
T06233
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
arac
Rhizosphaericola mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
arac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
arac02000
]
E0W69_007870
Transporters [BR:
arac02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E0W69_007870
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES88580
UniProt:
A0A5P2G495
LinkDB
All DBs
Position
complement(1789219..1792353)
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MKYKKNGSTKSRLILLQRVYGQLLLFCTLLMITNSLHSQQTSRLLKGKIIEDSGSPISAA
TINIIGKNQKVISDDSGRFQIQIADGDSLEIRSIGHEEKKLFITDQQDIIITLAFTHTDL
NEVVVIGYQSVLKKDLTGATGVANMNNARKISAGTIAESIQGTIPGVTVRNGGAPGQNSL
IEIRGVGSFSNASPLYVIDGMLSDANVTINPDDIESLQILKDASAAAIYGSRAGNGVVII
TTKKGKNGPPIIAFSAKYGRQSIPRQMKLMDAPQYLQTVSQAYANSNATLPSFVSSQLAN
NTIDVDWQKAVYRASSYQDYNVSVSGGSPTSKYFISGGYYQNDGTVVGNSFNRASFRINS
EVKKGILTFGENLTLTASNNKYPGGGVNAFTNTSMMLPTIKVQDPSYTDPINYPSNPQGW
GMGSTDNPSYANNYLAAASLDKISIAYGKVIGNVYAGLKLTNWLDYKFNAGLEVSYDYTK
EVRDTGVWRYTNQPSPTFVSENRARFLNILLEHTLNFNKRFGLHSINGVVGFSRIAQQQD
YTTAARTNLQNFDGTLYTTIGSAVGSASVNGGTTSEWRNHGWLSRINYTYNDKYLLTLTG
RIDKSSRFAPSHRTGYFPSMAAAWRISKEKFFNVDWISDLKLRGSYGKLGFSDALGSWDY
LGLVSSTARGIYGQPQIANLGQYRAAVLNPNIRWEKRQQSDIGFDAAILNNRLSFSFDWY
RSISKDVLLQVPLANYLGTSGSPFLNSGSIRNTGVEFSATYRNNSGPFKWDVSGNFTTIK
NTVLSVGDQGVDASGKAIDYLESATFARSQVGHAMGAWYVIQTDGLFQSYEEVLNYKNVA
GVVIQPNAKPGDIKYKDLNGDGQITNADRAFEGSPWPTLQTGLQFNGTYKGFNVNVQFIG
IFGNKIYNGVRAGLDGYQLTNFRRDLSPWTPDNTNTSDPRLGVDNGVDLSIAANNMAQTD
RWLENGSYVRLRNFEIGYGFEPNWLNRLGLKTLRVSASAQNLFTITKYKGMDPDVANGNL
GQRGFDGGYWPSSRIFSLGINLEF
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatataagaaaaacggctctactaaatcgagacttatcctactgcaaagagtttac
ggtcaattattacttttttgtacgttattaatgattactaattcccttcatagtcagcaa
actagtagattattaaaagggaaaataatagaagatagtggttctccgatctcggctgct
acaattaacataattggaaaaaatcaaaaagtaatttctgatgatagtggccgttttcaa
atacaaatagcagatggagattctttggaaataaggtctataggtcatgaagagaaaaaa
ctatttataacagatcagcaagatataataattacattggcttttacccacactgacctc
aatgaagttgttgtaattggttatcaaagtgttctaaaaaaggatttgactggagcaacg
ggtgttgcaaatatgaataatgctcgaaaaatatcagcaggaacaatcgcagagtcaata
caaggaacaattcctggagtaacagtaagaaatggaggcgctccgggtcaaaattcctta
atagaaattaggggtgtcggtagtttttctaatgccagtcctttgtatgttatcgatggt
atgctctcagacgcaaatgttacaattaatcctgatgatattgagtctctacaaatactt
aaagatgcatctgctgctgctatatatggatcaagagcaggaaatggagtagttattata
actacaaaaaaaggaaaaaatggacctccaataattgcttttagtgcaaaatatggaagg
caatccattcctcgtcagatgaaattaatggatgctccacaatacttacaaacagtatct
caagcttatgctaattctaatgctactttgccatcttttgtgagctcacaattggcaaat
aatacgatagatgttgattggcagaaagctgtttatcgtgcaagtagttaccaagattat
aatgtttctgtttcaggaggatctccaacatctaagtattttatctctggtggatattat
caaaatgatggaactgtagtggggaattcctttaatagggcttcttttagaataaattct
gaggttaaaaagggtattttaacattcggtgaaaatttaacattaacagcctcaaataat
aaatatcctggtggaggtgtaaatgcatttacaaatacatctatgatgcttcctacaatc
aaagtacaagatccatcttatactgatccaatcaattatccatctaatcctcaaggttgg
gggatgggctctactgataatccttcttatgctaacaattatcttgcagctgcttctttg
gataaaataagtattgcctatggaaaagtaattggaaatgtttatgctggtctcaaacta
acaaattggttggattataaatttaatgctgggcttgaagtaagttatgactacactaaa
gaagtaagggatacaggagtgtggagatatactaatcagccatccccgacatttgtctct
gaaaatcgtgcgcgatttttaaatatattgttagaacatacattaaactttaataaaaga
tttggattacatagtataaatggtgtggtaggattttcacgtattgcgcagcaacaagat
tacaccaccgcagcaagaactaatttacaaaattttgatggaacgttatatacaactata
ggttctgccgtaggaagtgcctcagtgaacggagggacaacttcagaatggagaaatcat
ggttggcttagtaggataaattatacttacaatgataaatatttattaaccttaacgggg
cgtattgataagtcttcaagatttgcgcctagtcatagaacaggctattttccatctatg
gccgctgcttggcgtatttcgaaagagaaattctttaatgtagattggataagtgattta
aaattgagaggctcctatggtaaattaggatttagtgatgctcttggttcttgggattat
ttgggtctagtcagtagtaccgctagaggtatttatgggcagcctcaaattgctaatttg
gggcaatatagagctgctgttttaaatcccaatattcggtgggaaaaaagacagcaaagt
gatattggttttgatgcagcaatcttaaataataggctttctttttccttcgattggtat
agatccatctcaaaagacgtattactacaagtgcctttggctaattatctaggtacaagt
ggatctcccttcttaaatagtggatcaattcgcaatacgggtgtggagttttctgctact
tatagaaataattcgggaccatttaaatgggatgtttcaggaaattttaccactataaaa
aatacggtactatcagtgggtgatcaaggtgtagatgcaagtggcaaggctatagattat
ctagagtctgcaacctttgcaagatcacaagtgggtcatgccatgggtgcctggtatgtt
atacaaacggatggattatttcaaagttatgaagaagtgctcaattataaaaatgtcgct
ggagtagttatacaacctaatgctaaacccggagatataaaatataaagatttgaatgga
gatgggcagattactaatgcggatagagcatttgaaggttccccttggcctactttacaa
actggattgcaatttaatggtacgtacaaaggatttaatgtcaatgttcaatttataggc
atttttggtaataaaatttataatggcgttcgtgcgggattagatggttatcaattgaca
aattttagaagagatttaagcccttggactcctgacaatacaaatacatctgatcccaga
ctcggcgttgataacggagttgacttatctatagcggccaataatatggcacagacagat
aggtggttagagaacggctcctatgttagacttcgaaattttgaaattggctatggtttt
gagccaaattggttaaaccgacttggtctaaaaacattaagagtttccgcaagcgctcaa
aatttattcactataacaaaatataaaggaatggatccggatgtagcaaatggtaatctt
ggccaaagaggttttgatggaggatactggccttctagtcgaattttttctttaggaatc
aatcttgagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system