Rhizosphaericola mali: E0W69_010665
Help
Entry
E0W69_010665 CDS
T06233
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
arac
Rhizosphaericola mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
arac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
arac02000
]
E0W69_010665
Transporters [BR:
arac02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E0W69_010665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES89101
UniProt:
A0A5P2GC06
LinkDB
All DBs
Position
2451597..2454536
Genome browser
AA seq
979 aa
AA seq
DB search
MRKGQLFKCSIFVLFTILIKSQVFAQAGKVKVSGQVTADTSSADGISIVLQSTNKVIGKT
NASGSFQVNVLANSTLLFSKSGFDNQTFLVNSDTTLNVALHPFTNIMPEVVVIGYGTAKK
SDLTGSIVTVSSKDFQKGSITTPDQLIAGKAAGVTVTSNSGAPGAGSTIRIRGGTSLNAS
NSPLIVIDGVPLDNNSVYGASDPLSLINPNDIASFNILKDASATAIYGNRASNGVIIITT
KSGTSGRLKVDFNAVLSQAVKRNEVKLLNGNQIRQIVNEKGTDAQKALLGTANTNWQDQI
FQKALGGVYNLGISGGIKKLPYRLSVGFTGQDGILKTSNLKRTSVDLNIRPTFFNNTLHI
DFNVKGIYMTNRFANESAIGAALSMDPTQPVYANNTLGGFYEWTDGNGVPIQQAVKNPLA
QLLMYKSTSVVRRSIGNMKVDYHLPSLPELTMNVNGGYDISSSDGSSFIPEYAALDYQQG
GSVTKYQQRKTNYVFDAYLNYKKYFDKIQSNVDFTGGYSYQEFFSGAPGFNNTNVAGTVL
STSIADSSRNVLLSFYGRLNYTFKEKYLLTATVRRDGTSRFSPNNRWGTFPSIALAWKIK
EESFLKNVNAVSDLKLRLGYGVTGNQDVGSFYPYLPIYRVSSNVAQYVFGNTGYYTYRAE
AYDPNIKWETTASYNAGIDFGFFKNRLTGSIDAYYKKTSNLLADIQTAAGANLSNHVLTN
VGNIESKGIELALNAKIVQGNKFNWSVNTNVAYNNNKILKLSNVSDSTTQGILSGTISGG
SGNSIQIQTVGYSLNTFYVYKQAYDKNGKPEEGVYADVNNNSGNLFYRYKSPNPKVTLGF
TSNFDYDKWSLSFTLRGNFGNYVYNNVKASGDAYNSISNTQGYIGNANRDYLHTGFTNSQ
YFSDYYVENASFVRMDNVNLGYDFGDVFNHKARLSVSGTVQNVFVITKYTGLDPEVYSGI
DNNAYPRPRTYSLGVNLQF
NT seq
2940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaaaaggacaattgttcaaatgttcaatttttgtactatttacaatattgataaaa
tcacaggtttttgcacaagcaggaaaagtaaaagtttcggggcaagttaccgcggacact
agctctgccgatggaatttctatagtacttcaatccacaaataaagttataggaaaaaca
aatgcatccggttcatttcaggtaaatgtactcgctaattccactttacttttttctaaa
tctggatttgataatcaaacatttttagtcaattctgatacaactctaaatgtagcatta
catccatttaccaatatcatgcctgaggtagttgtgattggttatggtactgcaaaaaaa
tctgatttgacaggatctatagttactgtaagtagcaaagactttcaaaaagggtcaatt
actacacctgaccagttaattgctggtaaagcagcaggtgtaacagttacatctaatagt
ggtgcgccaggcgcaggtagtacgatcagaatcagagggggtacttcattgaatgcaagc
aatagtccacttatagttatagatggagtgccgttggacaataactctgtttatggtgca
tcagacccattaagtttgatcaatcccaatgatattgcgtccttcaacattttaaaagac
gcctctgcgaccgcgatttacggtaatagggcctctaatggtgttattatcatcacaact
aaaagtggtacatctggtcgactaaaagtagatttcaatgcggtactatcacaagcagta
aaacgtaatgaggttaagttgttaaatggaaaccaaatacgtcaaattgtaaatgaaaaa
ggaactgatgcacagaaagcattattaggtacggcaaatactaattggcaagatcaaatc
tttcaaaaagcattaggaggagtctacaacctcggcatttctggaggaatcaaaaagtta
ccttacagattatctgtaggttttactgggcaagatggtattcttaaaacaagtaattta
aaacgaacatctgtagatctaaatatcagacctacatttttcaataatacattgcatata
gattttaatgtaaaaggcatttacatgaccaatcgatttgccaatgaatcagccatcggc
gctgcattgagtatggatccaacacaacccgtgtatgccaacaatacacttggtggattt
tatgaatggacagatggtaatggtgtacctatacaacaagctgtaaagaatccattagca
cagctacttatgtacaaaagtacaagtgtggttagacggagtattggtaatatgaaagtg
gattatcacctaccctctttacccgaacttactatgaatgtaaatggaggttacgacata
tcatctagcgacggtagctccttcattccagaatatgcagcattagactatcaacaagga
ggttctgtaactaaatatcaacagagaaaaacaaactatgtatttgatgcttacttaaat
tataaaaaatattttgataaaatacaaagtaatgttgattttacgggaggttattcttac
caagaattttttagtggcgctccaggatttaacaataccaacgttgcaggtactgtatta
agtacttcaattgctgactctagcagaaatgtactactttctttctatggaagattgaac
tatacatttaaagaaaaatatttgttaactgcaacagttagacgtgatggtacatctaga
tttagtccaaataatcgttggggaacatttccttctattgcattagcatggaaaattaaa
gaagaatcatttttgaaaaatgttaatgctgtatcggatttaaaactaagattaggttat
ggtgttacagggaatcaagatgtagggtctttttacccatatcttccgatatatcgcgta
agttccaatgttgcacaatatgtatttggcaatacaggatactatacctacagagcagaa
gcgtatgatccaaatattaaatgggaaactacagcatcttataacgcggggatcgacttt
ggattctttaaaaatagattaactggttcgattgatgcttattacaaaaaaacaagcaat
ctattagcggatatccaaactgctgctggtgctaacttgagtaatcatgtacttactaat
gtcggtaatattgaatcaaaaggtatagaattggcattgaatgcgaaaatcgttcaaggt
aacaaattcaactggtcagtaaataccaatgttgcctacaacaataataaaattttaaaa
ttatccaacgtatctgacagcactacacaaggtattctaagcggtacgatcagtggaggt
agcggtaattcaattcagatacaaacagtaggttatagtttaaatactttctacgtatac
aaacaggcatacgacaagaatggcaaaccagaagaaggtgtatatgcggatgtaaataat
aattcaggtaatttattttaccgatataaatcaccaaatccaaaagttacattaggattt
acttccaactttgattatgataaatggagtctatcatttacgcttagaggaaactttggc
aactacgtatataataatgtaaaagctagtggagacgcctataatagtatctcaaataca
caaggatatattggtaatgccaacagagactatttgcatacaggctttacaaatagccaa
tatttttcagattattatgtagaaaatgcgtcattcgtaagaatggacaacgtaaatctt
ggatatgattttggagatgttttcaatcacaaagctagactttcagtgagtggaacagta
caaaatgtatttgtaatcactaaatatacaggtttagatcctgaggtatatagtggtata
gacaacaatgcatatccacgtccacgtacatattctcttggtgttaatcttcaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
