Rhizosphaericola mali: E0W69_013140
Help
Entry
E0W69_013140 CDS
T06233
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
arac
Rhizosphaericola mali
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
arac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
arac02000
]
E0W69_013140
Transporters [BR:
arac02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
E0W69_013140
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CooC_C
TTR_TEN1-4
Big_1
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES89566
UniProt:
A0A5P2G183
LinkDB
All DBs
Position
complement(3048481..3051825)
Genome browser
AA seq
1114 aa
AA seq
DB search
MWIKNCRWLLMLMAMFMMVCGYAQQIKTVTGSVSDEKGTPVEGVSIRVTNGKALGMTDTK
GSFSVKIGTTVSSLTFSSVGYAEQKVAVSGDFLKVTMLTKSDSAEEVVVTTSFGIKKQAR
SLGYAVSTVSAKDLTESGATNIGSALYGKAAGVKIVQAPGGASSAVSVQVRGVSSIGLNT
QPLYVVDGVPIRLYNDLQGNLGTNANNGGFWSQPRVQSNGVLDINPEDIASLTILKGASA
SALYGSEAANGVVVITTKKGSSSRGLGVDFNEVLNTEKVAYGPDYQNEYGPGQSAFSMLN
NNVTIDGETYDPTTGFFTNNTTGAQHPYYNTYSQFGPKFDGRDVTYWDGTTRKYSANKNN
YMDFFQSGYNSNANIAVSNASDKGSYRFSYTRMDYKGIMPGSKLNKNNFNFNGTLKLSDR
VSLDVVSSFNNNYTHNRPYMLGQIFGSYSGFFSRMDDMNTFKNLYKTSDGYKYVGYTTNP
QYDESEVFKYATNATNILDYYWNAYSNSYDEHQNRFINSVTLNVAFSDHLRFRGRVGGDF
TSFNSEEKDANTIPNSLGNSGTYAITTNTYNIFYGDGTLTYNNKIGNDLDFTIMGGASGR
KQIYKSLYSTTNTGLGTEDWYSLNNSLSAVTSSTNNGNQLDIASFGTIDLNYKGLIYLEG
TGRYEATSTLPSNANNYFYPSVNGSFILSDAVKLPKFFNYAKIRASYGLVGNHPNIYQAN
VAYTQNTLNYNSSNVLYQYMVGSTFGNNNIKSEKKREAEFGLETRVLNNKLGIDLSFYTN
KVSNQILTISVPSSSGALAYLANAGDLANYGYEAALNYSAITTRNFSWTTRFNFAINKNK
LTSLPNGQTNLINNSFDGGYAIIRSSVNDALGNIYVHPKATDGNGNAIIDDNGYYTVNTS
DYQKVGNIMPKMVGGFSNSFKYKGFGLDFTIDYRLGGNMISIPTYYQMGAGMYKSTLQYR
DAAHGGIAYNVESSTTGYTNVANDNGTYHDGLILKGVTSSGATNTKVISAEQYYSNTYNW
ETAGLYENAVFKNSYIKFRELTFSYNLPKTFTQKIHFQNLQFALIGRNLFYIWKTLPHGI
DPEAGVGSSWMSQGVDIGAAAPTRSYGISLRASF
NT seq
3345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggatcaaaaactgtcgttggctattaatgctgatggccatgttcatgatggtctgt
ggctatgcccagcaaattaaaacagtaactggttcggtttctgatgaaaagggaacccct
gttgaaggtgtctctataagagttacaaatggtaaagcgctaggtatgactgataccaaa
ggtagcttttctgtaaaaattggtacaactgtaagttcattaacatttagttctgttggt
tacgcagaacaaaaagttgctgttagtggtgattttttaaaagtaacaatgttaactaaa
tcagattccgctgaagaggtagttgtaactacatcttttggtattaaaaaacaagcacgt
tctttggggtatgcagtaagtactgtttctgctaaagatttgaccgaaagcggagctaca
aatattggatctgcactttatggtaaagcggccggtgtaaaaatagtacaggctcctgga
ggtgcttctagtgcagtcagtgtacaagttcgcggagtttcttcaattggtttaaataca
caaccgctttatgtggttgatggtgtgcctattcgtttgtataatgatcttcaaggaaat
ttaggtactaatgcaaataatggtggtttttggagtcaacctagagtacagagcaatggt
gtattagatataaatccggaggatatagctagcttgactattttgaaaggggcgagtgca
tctgccttatatggctctgaagcagcgaatggtgtagttgttattacaacaaaaaaaggc
tcctcttcaagaggcttgggtgtcgactttaatgaagtattaaataccgaaaaagttgca
tatggtcctgattatcaaaatgagtatggacctggtcaaagtgcattttcaatgttaaat
aacaatgtaactatcgatggtgaaacttatgatccaactacaggtttttttaccaacaat
actacgggtgctcaacatccttattataatacttattctcaattcggtccaaaattcgat
ggtcgtgatgtaacttattgggatggaaccactagaaagtatagtgcgaataagaataac
tatatggatttttttcaatctggatataattctaatgcgaatattgcagtatctaatgca
tctgataaaggtagttatagattctcctatacacgtatggattacaaagggattatgcct
ggtagtaaattgaataaaaataacttcaattttaacggaactttgaagttgtctgataga
gtgagtttagatgttgtatcatcattcaataataattatacgcataatagaccatatatg
ttaggtcagatttttggctcttatagtggatttttcagccgtatggatgatatgaacaca
tttaaaaatctatacaaaacttctgatggatacaaatatgtagggtatacaacaaatcct
caatatgatgagagtgaagtatttaaatatgcaacgaatgcaactaacatactagattat
tattggaatgcatatagtaatagctatgatgaacatcaaaatcgttttataaatagtgta
acattaaatgttgctttttcagatcatttgagattccgtggtagagtaggtggtgatttt
accagttttaatagtgaagaaaaagatgctaataccattcccaattctttaggtaattcc
ggtacatatgctattacgacaaatacttataatatattttatggcgatggtacattgact
tataataataaaattggtaatgacttagattttactattatgggtggtgcttctggtcgc
aaacagatatacaaatctctttatagtacaacaaatacaggtctgggtacagaagattgg
tatagcttgaataattcattgtccgcagttacaagttctactaataatgggaatcagtta
gatatagctagttttggaactatagatttaaactataaaggtttgatttatttagaagga
acaggaagatatgaagctacgtcaactttgccaagtaacgctaataactatttttatcct
tcagtgaatggaagctttatattgtcagatgctgttaaattgccaaaatttttcaattat
gctaaaattagagcttcttatgggttagtgggtaatcatccaaatatttatcaggcaaat
gttgcttacactcaaaatacgttaaattataattcaagtaatgtattgtatcaatatatg
gttggttctacatttggaaataataacataaaatctgaaaagaaaagagaagctgagttt
ggtttggaaacaagagtgctaaataataaattgggcattgacttaagcttttataccaac
aaagtgtctaatcagattcttacaatctctgtaccttcgtcttctggtgcgttggcttat
ttggctaatgcaggcgatctagccaactatggatatgaagctgcattaaattattcagcg
ataactacaagaaacttttcgtggaccactagatttaattttgcaattaataaaaataaa
ttaacctcattgcctaatggtcaaacaaatttgattaacaattcatttgatggaggctat
gccatcattagatcctcagtaaatgacgcattgggaaatatatacgttcatcctaaagct
acagatggtaatggtaacgctattatagatgataatggttattatactgtgaatacaagt
gattatcaaaaagtaggtaatattatgcctaaaatggtaggtggattttctaatagcttt
aagtataaagggtttggattagattttacaatagattatcgtttaggaggaaatatgatt
tctattcctacttattatcaaatgggggcaggtatgtataaaagtacacttcaatacaga
gatgctgcacatggaggtattgcttataatgttgaatcgtcaactacaggatacacaaat
gttgcaaatgataatggtacataccatgatggtttaattttaaagggtgtaacttcatca
ggagctactaatactaaagttatttcagcagaacagtattactctaatacttataattgg
gaaactgcgggtttatatgaaaatgcagtgttcaagaatagttatattaaattcagagaa
ttgacatttagttacaatttgccgaaaacgtttacccaaaagattcattttcaaaattta
caatttgctttgattggacgtaatttattctatatatggaaaacattgccccacggtatt
gatccagaggcaggtgtaggttcttcttggatgagtcagggtgtggatattggtgcggcc
gctccaactagaagttatggtattagtttgagagcaagcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system