| Entry |
|
|---|
| Name |
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta' subunit
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:arc00001]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
ABLL_2468
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:arc03021]
ABLL_2468
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:arc03400]
ABLL_2468
Enzymes [BR:arc01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
ABLL_2468
Transcription machinery [BR:arc03021]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
ABLL_2468
DNA repair and recombination proteins [BR:arc03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
ABLL_2468
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
complement(2550851..2555377)
|
|---|
| AA seq |
1508 aa
MSNNEKILSPIEIKELERPQDFAAFQLRLASPEKILSWSCGEVKKPETINYRTLKPERDG
LFCAKIFGPVKDYECLCGKYKKMRYKGVVCEKCGVEVTSSKVRRHRMGHIELVSPVAHIW
MVSSLPTRIGTLLGVKLKDLERVLYYEAYIVSEAGEAYYDNEKTKKVEKYDILNEEQYRT
ISDLFEHTGFEANMGGQVVRDLLENIDLFQLLTVLKEDMESTKSEAKRKTIIKRLKVVEN
FLNSGNRPEWMMLTQLPVLPPDLRPLVSLDGGKFAVSDVNDLYRRVINRNNRLKRLTELD
APEIIIRNEKRMLQEAVDALFDNGKTANAVKGANKRPLKSLSEIIKGKQGRFRQNLLGKR
VDFSGRSVIVVGPTLNMDQCGIPKKMALELFKPHLMAKLEEKGYATTLKAAKRLIESEAN
EVWECLNEIVDEYPIMLNRAPTLHKLSIQAFHPVLIDGKAIRLHPLVCAAFNADFDGDQM
AVHVPLSQEAVAEAKILMMSSMNILLPASGRAIAVPSQDMILGIYYLSLEKDGVRGEHKL
FTDVNEVKIALDMNKIDLHAKIRTKLNNKVIHTTVGRLIIHEILPSFVPVNLWNKILKKK
DIGSLVDYIYKHGGYEVTPRFLDNLKNLGFKYATAAGISISIDDIRVPETKVGHISKSKK
EVIEVQKQFSQGLLTEQERYNKIIDIWTEVNNKLGSEMMELVKTDKNGFNSIYMMADSGA
RGSAAQIRQLSGMRGLMAKPDGSIIETPIISNFREGLNVLEYFISTHGARKGLADTALKT
ANAGYLTRKLIDVSQNVRITMEDCGTHEGIEITDITSGNELIESLEERITGRVIAEDIID
PISNEILFAEGTLITEEDAKIVTEAEVKSVVIRTPLTCKAENGLCSKCYGLNLGEQRKAK
PGEAVGVVAAQSIGEPGTQLTLRTFHVGGTASATQTERELKADKEGFIRYYNIKKYVKSD
GKIIVANRRNAGLLLVEPKINAPFKGKVTVETLHEETILTISNGTETKKYYLRKNDVAKA
NELAGVSGKIEGKLYLPYRDGEEVNQNESIVEMIKDGWNIPNRIPFASELKVEDGAPITS
KIISGAKGFVKYYKLTGDYLERRHDIKAGDTVTEKGVFAVIVDGDDREALRHYISRGSHI
QLNDNVEVEKDSVISAPITNEQVVIAEWDPYANPTIAEKAGIISFEDIIPGLTVSEQFDE
LTGTSKLVVNEYIPSGYKPTVILATDDKEIIRYSLDPKTSLNIAEGKRVEVADIIGKTPK
ATQKSKDITGGLPRVSELFEARRPKNIAQLASFDGVVSFGKSLRNKQKIVISDESGNNVE
YLVEKSKQILVHEGEFVHAGEALTDGQVSPHDILRILGEKALHYFIVSEVQQVYRSQGVN
IADKHIEVITSQMLRQVSILDGGDTKFIVGDMISKKKFKLENEKIIKLGGNPAIAEPLLL
GITRAAVTSDSIISAASFQETTKVLTEAAISAKMDMLEDLKENVVIGRTIPVGTGLYKNQ
KIKFSGNE |
|---|
| NT seq |
4527 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagtaataatgaaaaaatattgtcaccaattgaaattaaagaattagaaagaccgcaa
gattttgcggcttttcaattaagattagcaagtccagaaaaaattttatcttggtcttgt
ggagaagtaaaaaaacctgaaactatcaattatagaacattaaagccagaaagagatgga
ttattttgtgctaaaatttttggaccagtaaaagattatgaatgtctttgtggtaaatac
aaaaaaatgagatataaaggtgttgtttgtgaaaaatgtggagttgaagtaacttcatca
aaagtaagaagacacagaatgggacatattgaacttgtatctcctgttgctcatatttgg
atggtttcatcattacctacaagaattggtacgttattaggtgtaaaacttaaagattta
gaaagagtattatattatgaagcatatattgtaagtgaagctggtgaagcttattatgat
aatgaaaagactaaaaaagttgaaaaatatgatattttgaatgaagaacaatatagaact
atctctgatttatttgaacatactggttttgaagcaaacatgggtggacaagttgtaaga
gatttattagaaaatattgatttattccaattgcttactgttttaaaagaagatatggaa
tctacaaaatctgaagcaaaaagaaaaactataatcaaaagattaaaagttgttgagaac
ttcttaaattctggaaatagaccagaatggatgatgttaactcaacttcctgttcttcct
ccagatttaagaccacttgtatcacttgatggtggaaaatttgctgtttcagatgttaat
gatttatatagaagagttatcaacagaaataacagattaaaaagattaacagaacttgat
gcacctgaaatcattattagaaatgaaaaaagaatgcttcaagaagcagtagatgcttta
tttgataatggaaaaactgcaaatgcagttaaaggtgcaaataaaagacctttaaaatct
ttatcagaaattattaaaggtaaacaagggcgattcagacaaaacttacttggtaaaagg
gttgacttctctggaagatctgttattgttgttggacctactttaaatatggatcaatgt
ggtattcctaaaaaaatggctttagagttatttaaaccacacttaatggctaaattagaa
gaaaaaggttatgcaacaacattaaaagctgcaaaaagattaattgaatcagaagcaaat
gaagtatgggaatgtctaaacgaaatcgttgatgaatatccaattatgttaaatagagct
ccaactctacataaactttctattcaagctttccatccagtattaattgatggaaaagca
attagattacatccattagtttgtgctgcttttaatgcggacttcgatggggatcaaatg
gcagttcacgtgcctttatcacaagaagcagttgctgaagcaaaaattttaatgatgtca
tctatgaatattcttttaccagcatcaggaagagcaattgcagttccttctcaagatatg
attttaggtatttattacctatcattagaaaaagatggggtaagaggtgaacataaatta
tttactgatgtaaatgaagttaagattgcattagatatgaataaaatagatttacatgca
aaaattagaacaaaattaaataataaagttattcatacaactgttggaagattaattatt
catgaaattttaccaagttttgtacctgtaaatttatggaataaaattttaaagaaaaaa
gatattggttctttagttgattatatttataaacatggtggttatgaagtaactccaaga
tttttagataaccttaaaaacttaggttttaaatatgctacagctgctggtatatctatt
tctattgatgatattagagttcctgaaacaaaagttggtcatattagtaaatctaaaaaa
gaagttattgaagttcaaaaacaattctctcaaggtttattaactgagcaagaaagatat
aataaaattatcgatatttggacagaagttaacaataaacttggttctgaaatgatggaa
ttagttaaaactgataaaaatggatttaattctatttatatgatggcagactcaggagct
aggggttctgcagctcaaattagacagttatcaggtatgaggggacttatggctaagcca
gatggttctattattgaaactccaattatttcgaactttagagaaggtctaaacgttctt
gaatactttatttctactcacggagcaagaaaaggactagcagatacagcgttaaaaact
gcaaatgcagggtacttaacaagaaaacttattgacgtttctcaaaatgtaagaatcacg
atggaagattgtggtactcacgaaggtatagaaattactgatattacatcaggaaatgag
ttaattgaatctttagaagagagaattacaggaagagtaattgcagaagatattattgac
ccgatttcaaatgaaatattatttgcagaaggtacactaataactgaagaagatgcaaaa
attgtaactgaagcagaagttaaatcagtagtaattagaactccattaacttgtaaagca
gaaaatggattatgttcaaaatgttatggattaaatcttggagagcaaagaaaagcaaaa
ccaggtgaagctgtaggagttgttgcagctcaatctattggagaaccaggaactcagctg
acacttagaactttccacgttggaggaactgcaagtgcaactcaaacagaaagagaatta
aaagctgataaagaaggatttattagatattataatattaaaaaatatgtaaaatctgat
ggaaaaattattgttgcaaatagaagaaatgctggattattactggttgaaccaaaaatc
aatgcaccatttaaaggtaaagtaacagttgaaactttacatgaagagacaattttaact
atctcaaatggtactgaaactaaaaaatattatttaagaaaaaatgatgttgcaaaagca
aatgaattagctggagtttcaggaaaaattgaaggtaaattatatttaccatatagagac
ggtgaagaagttaatcaaaatgaatctatagttgaaatgattaaagatggatggaatatt
ccaaataggattccatttgcttctgaattaaaagttgaagatggtgctccaattacatca
aaaattatttctggtgcaaaaggatttgttaaatactacaaattaactggtgattattta
gaaagaagacatgatataaaagcaggtgatacagtaactgaaaaaggtgtatttgctgtt
attgttgatggtgatgatagagaagctttaagacattatatttcaagaggttctcatatt
caattaaatgataatgttgaagtagaaaaagattcagttatttctgcaccaattacaaat
gaacaagttgtaattgctgaatgggatccttatgcaaacccaacaattgcagaaaaagcc
ggtattatttcatttgaagatattattcctggacttactgtttctgagcaatttgatgaa
ttaactgggacatctaaattagttgttaatgaatatattcctagtggatataaaccaaca
gtaatattagcaactgatgataaagaaattattagatactctttagatccaaaaacatcg
ttaaatattgcagaaggtaaaagagtagaagttgcagatattattggtaaaacaccaaaa
gctacacaaaaatctaaagatattactggaggtcttccaagagtatctgaattatttgaa
gctagacgtccaaaaaatattgcacaattagcatcatttgatggtgtagtatcatttgga
aaatcattaagaaataaacaaaaaattgttatttcagatgaatctggaaataatgttgag
tatttagttgaaaaatctaaacaaattttagttcatgaaggtgagtttgttcatgctggt
gaagcattaactgacggtcaagtttctccacatgatattttgagaattcttggagaaaaa
gcattgcattactttattgtatctgaagtacaacaagtatatagatctcaaggagtaaat
attgcagataaacatattgaggttattacatctcaaatgttaagacaagtatctatctta
gatggtggagatactaaatttattgttggagatatgatttctaaaaagaaatttaaatta
gaaaatgagaaaattataaaattaggtggaaatcctgcaattgctgaacctttattatta
ggtatcacaagagcagctgttacatctgattctattatctctgctgcttctttccaagaa
actacaaaagttttaacagaagctgcaatcagtgctaaaatggatatgttagaagattta
aaagaaaatgttgtaattggtagaacaattccagttggaacaggtttatataaaaaccaa
aaaattaaattttctggtaatgaataa |
|---|
