Arcobacter sp. L: ABLL_2542
Help
Entry
ABLL_2542 CDS
T01834
Name
(GenBank) phenylalanyl-tRNA synthase beta subunit
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
arc
Arcobacter sp. L
Pathway
arc00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
arc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
ABLL_2542
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
arc01007
]
ABLL_2542
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
arc03016
]
ABLL_2542
Enzymes [BR:
arc01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
ABLL_2542
Amino acid related enzymes [BR:
arc01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
ABLL_2542
Transfer RNA biogenesis [BR:
arc03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
ABLL_2542
Prokaryotic type
ABLL_2542
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_synthFbeta
tRNA_bind
FDX-ACB
B5
PhetRS_B1
DpnI_C
UBA_RAD5A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK74417
LinkDB
All DBs
Position
2634588..2636909
Genome browser
AA seq
773 aa
AA seq
DB search
MIITKSWLEEFIDISKISSDEICKTLNSIGLEVDSVENFSVAEKVVVGKVLEKVKHPDAD
KLNICQVDLGDRTVQIVCGAKNVDVDQFVPVATVGCDLGNNFIIKEAKLRGVESNGMICS
STELNLPKINDGILVLDNSIGELILGKELKEYSKLNDSVIEIGLTANRGDCLSIYGIARE
LSAYYNIPLLEIDKQINYNELGIGQVFEIECDSNIDSSLSFKAVDFSNFKLNLLYKFRTA
IIGKYQDNNEIKNVLTYVTHSTGVILNAYSKEKTLKNNNLSILNIKKDEKGFDTVYGIES
LSKICVEHNDIDQNDTDFIIEASYVNPELISKKVFENKVKTGEVYYKASRGSEPNIDFGI
DYLSSLISKSGALIYRGSETFIEDKEKLTLDVSIKKVNSIIGQEISKIDIEKILVSLGFE
VKDTIDNILVVKVPYYRHDIKNIADITEEIVRIIGIDNIISKPLQIDEVNRVNKTSNDLI
KKNKLRFKAIENGFFETLTYVFSSKENLEKYKFKTVRDELDLINPIVKELNTFRTTILLN
LVEACANNFKIGARSTAFFEIGTVFDENRQESKKISFIQTGSAELEDFSNAGKPKNIDFF
SFAKKILNTIGKFDLEAMISIDNSFIHPYQNANVLIDGKIVGFISKLHPSVCEDYDLSDT
FIAEIDFEAIKNDIIKTTSYSKFQSSKKDLSIITPKSLEYKEIKKVIDSLNDKNIKQFNL
IDIYNDEKLGENESLTIRFVLQNDEKTMEEEDITTTMNSILKVLNEKLSIGLR
NT seq
2322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattacaaaaagttggttagaagaatttattgatatttctaaaatttcatcagat
gaaatttgtaaaacattaaactctattggtcttgaagttgatagtgtagaaaatttttca
gttgcagaaaaagttgttgttggaaaagttttagaaaaagttaagcatcctgatgcagat
aaactaaatatttgtcaagttgatttaggtgatagaactgtacaaattgtttgtggtgca
aaaaatgtagatgtagatcaatttgttccagttgcaactgttggatgtgatttaggaaat
aactttattattaaagaagcaaaattaagaggtgttgaatcaaatggtatgatttgttca
tctactgaacttaatcttcctaaaatcaatgatggaattttagttttggataattcaatt
ggagaattaattcttggaaaagagctaaaagaatactcgaaattaaacgattcagtaata
gagattggattaacagcaaacagaggagattgtttaagtatttatggaattgctagagaa
ttaagtgcttattataacatccctttattagaaattgataaacaaataaattataatgaa
ttaggaattggtcaagtttttgaaatagaatgtgacagtaatattgattcatctttatca
tttaaagctgttgatttttcaaattttaaattaaatttattatataaatttagaactgcg
attattggaaaatatcaagataataatgaaattaaaaatgttttaacttatgttacacat
tcaacaggtgtgatattaaatgcctactcaaaagaaaaaactttaaaaaataataattta
agtattttaaatataaaaaaagatgaaaagggatttgatactgtttatggaatagaatcc
ttgagtaaaatatgtgttgaacataatgatattgatcaaaatgatacagattttattatt
gaagcttcttatgtaaatccagaattaatatcaaaaaaagtttttgaaaacaaagtaaaa
actggagaagtttattataaagcttcaagaggaagtgaacccaatattgattttggaatt
gactatttatctagccttatttcaaaatcaggagctttgatttatagaggaagtgaaact
tttatagaagataaagaaaaattaactttagatgtaagtattaaaaaagttaattcaatt
attggtcaagaaataagtaaaattgatatagaaaaaattttagtttctttaggatttgaa
gtaaaagatacaattgataatattttagttgtaaaagttccttattatagacatgatata
aaaaatattgcagatattacggaagaaatagttagaataattggtattgataatattatt
tcaaaaccactacaaattgatgaagtaaatagagtaaataaaacatcaaatgatttaatc
aaaaaaaataaattaagatttaaagctattgagaatggtttctttgaaacattaacttat
gttttttcttcaaaagaaaatttagaaaaatataaatttaaaactgtaagagatgaatta
gatttaatcaatccaattgtaaaagagttaaatacatttagaacaactatacttttaaat
cttgttgaagcttgtgcaaataattttaaaattggagcacgttcaactgcattttttgaa
ataggaacagtttttgatgaaaatagacaagaaagcaaaaaaatctcatttatccaaaca
ggttcagctgaacttgaagatttttcaaatgctggaaaacctaaaaatattgatttcttt
tcatttgcaaaaaaaatattaaatacaattggaaaatttgatttagaagcgatgatttca
atagataattcttttattcatccatatcaaaatgcaaatgttttaattgatggaaaaatt
gtaggatttatttcaaaattacatccaagtgtttgtgaagattatgatttaagtgacact
tttattgcagagattgattttgaagcaatcaaaaatgacattattaaaacaacttcatat
tcaaaattccaatcatcaaaaaaagatttaagtattattacacctaaatcattagaatac
aaagagattaaaaaagtaattgattcattaaatgataaaaatatcaaacaatttaattta
attgatatttataatgatgaaaaactaggtgaaaatgaaagcttaacaattagatttgtt
ttacaaaatgatgaaaaaacaatggaagaagaagatatcacaacaacaatgaattcgatt
ttaaaagttttaaatgagaaattgtcaatcggattaagataa
DBGET
integrated database retrieval system