Archaeon GW2011_AR20: QT11_C0001G0442
Help
Entry
QT11_C0001G0442 CDS
T03843
Name
(GenBank) PE-PGRS family protein
Organism
arg
Archaeon GW2011_AR20
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_38
HTH_23
Cactin_mid
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJF62586
UniProt:
A0A0B5HQ50
LinkDB
All DBs
Position
complement(340694..345694)
Genome browser
AA seq
1666 aa
AA seq
DB search
MPDKTTLQRRKQELLVYLEQAARYKTETIKFVGELRTKLYEDRISSAEFNYKLNLALKGR
KAEEWINYYDSLIKSYNKEISNITEKLKENQNTAFGANSVLVILFFFMIAITGIILIKPQ
ITGFVVYQPGEIINDTLTLTIPENLTINESIVKVNLNAQQNELPLSNFDIELNLVTINLE
RFNLLAEEGTLTAQIIFNNSIISEASLLIELQQITQPIIEENITNLTIPEIPQISTTEKF
DNVTIPKVPRFIEQQKIYTIEEIINEGNINIPKEKIKNINKISYASEEVTLNDNKKTLII
HKPIINSKEFNEAVPLIEKDDFTYSASFEDTAIEIEFDSPEIKQDKTNKKFKKNKASNTD
SWKISYNYLLPSQDFKARFRISSSSPIQVVEDYYGIIKAGKFNLDFTTERDNNFDIEINQ
VNSNIVYLYLNKNYSEYGKFVNDEIILDPTLTVDGTSYEVCYEFPNYTQIEVINNGVLTV
CARTTAVGSGYANITLGNDGNFSLSGNSRIEGGGMGATGGASCTGNSCSAVAGENGENWT
VGAGGTGNNGGGGGGGRRVGNADSTGGGGGGFGGTGGTGGEEAADGVQPTGGQPYGSATG
EVLFGGSGSGGSAGDAGAAAGVQGGAGLRINASAGWITIYGIINMSGANGTDGDGSDNSG
SGGGSGGHVILEARNLSLGNGAKIFADGAKGGGGGSGSCGGGGGGGGRILYIYTTAIISS
TFQNFTLGGNIGVGSNTNCDAGSGAPEPTVGTDGTIAHVSRTFPDPPEPNSPPNNVSSLV
INSTTVTQTNYTNETIQVRFNVSDINTGDTLNYSIQWIRNNKTNFTLVNLALSNPGATVE
NLQPDNTTRGDTWMVQVLVCDNNNACNAFANTTELLIISTPPNNRTPVIINSTLNLQLNL
TTENLQVRVDVNDTDTIDLLTYNITWLTEDRINFTLPNISINNPGTIVETLPHTNTTKGQ
NWSAQIVICDQSYVCSRFVNSTKLLILNSNATITQPAFNQTSYNTEQIINVSLVFSDDDQ
DANSVTFEWFKNDALIKRATNGNLANGTNSSDILTPDNFVVNDNIIVQAFAYDGERNSTL
LNSTTLTIQSANTAPNNPTALILNSSNTAHTNLTNEDLLMIFQCDDPDASDTLTFHLTAF
KDFENKFQLQGSCNDPENKTVILSHVNTTKNDTWSFSVNVSDDSSAYSATISTVVNLSIL
NTAPIIGNVTLDEADNINLVENGNKTFRFSFVVTDADNLTDIVNISAVANITRGFENTAE
AIRYNDTFVNSGDGGCNAVNLILPNSKNFSCTINVVFYDGAGAWNISVRINDSVKRTDIV
DYAFAQNNTQTFTINELTALVIYPSTISFPTIALGDVNVSARINITINNTGNDDISGREL
SGETINITAITLIGETDSTTVIPTNNFSIGTTEGMGVAPAYCDPSVSNFKNVTKLINTTA
ALSPYNNFSGPINGSYVLAQAIGAQEILQICLLDVPDDLTAGQNYSSSKSGTWSISIFFF
RRRKDKSYEKNKEAINSVIRIKIGNKLNDREFMRLINYEESILIPISIFKDNSPLEALVK
YLKENLNLSLSEIASLLNRDQRTIWITYDNASRKINGLEGLSKKLIPINVFSNRKLSILE
NTVYYLVNKGISLNNIAKILNRNYKTIWTTYSRTKNKHLEEKKQGL
NT seq
5001 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagataaaactacattacagagaagaaagcaagaattgcttgtttatttagagcag
gcagcgcggtataaaactgagacaataaaatttgtcggtgaattaagaactaaattatac
gaagataggatttcttcagccgagttcaattataaattgaatttggcgctaaaggggaga
aaggcagaggaatggatcaattattatgattcattgataaaaagctataacaaagaaata
agcaatataaccgaaaagttaaaagaaaatcaaaatacagcgttcggtgcaaattctgtt
ttagtaatattgttcttttttatgatagcaattacagggattattttaatcaagccgcag
attacggggtttgtagtttatcaacctggggaaattattaatgatactttaactttaaca
attcctgaaaatttaacaataaatgaaagcattgtaaaagtaaatttaaatgcacaacaa
aatgaattgcctttaagtaattttgatattgaattaaatttagttacaataaatttagag
cgatttaacctattggcagaagagggaactttaactgcacaaattattttcaataactca
ataataagcgaagcgagtttattaattgaattgcaacagattacgcaaccgattattgaa
gaaaacattactaatctaaccattccagaaattcctcagataagtacgacagaaaaattt
gataatgttacaattccaaaagttccaaggtttatcgaacaacaaaaaatttatacaata
gaagaaataattaatgaaggaaatataaatattcctaaagagaagattaaaaatattaat
aaaattagttatgcttctgaggaagttactttaaacgacaataaaaaaactttaataata
cataaaccaatcattaatagcaaggaatttaacgaggctgttcctttaattgaaaaagat
gattttacttattctgcaagttttgaagatacggcaattgaaattgaatttgattcacca
gaaataaaacaagataagacaaataaaaaatttaagaaaaataaagctagcaatacagat
tcttggaaaatttcttataattatttacttccttcacaggattttaaagcaagatttagg
ataagttctagctcgccaattcaagttgtagaggactattatggaattattaaagctgga
aaatttaatttagattttacaacagaaagggataataattttgacattgaaattaatcaa
gttaattctaatattgtttatttatatttaaataaaaactattcagaatatgggaagttt
gttaatgatgaaattatattagatcctacattaacagttgatggaacaagttatgaggtt
tgttatgaatttccaaattacactcaaattgaggttatcaataatggtgttttaacagta
tgcgcaagaaccacagctgttggaagcggttatgctaatattactttaggaaatgatgga
aatttttctttatcaggtaattcaagaatagaaggaggaggaatgggggctactggtggt
gcttcttgtactggtaatagttgtagtgcggtggccggagaaaatggagaaaattggact
gttggagctggtggaactggaaataatggtgggggtggtggaggaggaagaagagttgga
aatgcagatagtacaggcgggggtggtggaggatttgggggaacaggtggaactggagga
gaggaagctgctgatggtgtacaaccaacagggggacaaccttatggaagtgcgacagga
gaagttttatttggtggttctggcagcggaggaagtgccggtgatgctggagctgcagca
ggtgtacaaggaggggctggtttaaggattaatgctagtgcaggctggattacaatttat
ggtataattaatatgtctggggcaaatggaacagatggtgatggttcagataattctggt
tcaggaggcggttcaggaggacatgttattttagaagcaagaaatttaagtttgggtaat
ggtgcaaaaatattcgcagatggagcaaaggggggtggcggaggatctggttcttgtggg
ggtggaggcggtggcggaggaagaattctttatatctatacaacagccataataagtagt
acgttccaaaatttcacgcttggaggaaatattggtgttggttcaaatactaattgtgac
gctggttcaggtgctccagagcctactgtgggtacagatggaacaatagctcatgtttca
agaacttttccagatccgccagaaccaaattctccaccaaataatgtttctagtttagta
atcaattcaactacagtgacgcagacaaattatacaaatgaaacaatacaagtaagattt
aatgtttcagatataaatacaggagatactttaaactatagtatacaatggattagaaac
aataaaactaattttaccttagttaatttagctttaagtaatcctggagcaactgttgaa
aatttacagccagataatacaacaagaggagatacttggatggttcaagttttagtatgc
gataataataatgcttgtaatgcttttgctaatacaactgaattattaataataagcacc
ccccccaacaatagaactcctgtaataattaattcaactttaaatttacaattaaattta
actacagaaaatttacaagtaagagttgatgtaaatgatacagacactatagacttatta
acttataacataacttggctaacagaggatagaattaattttactcttccaaatatttca
ataaacaatccaggaactattgttgaaacattaccgcatacaaatacaacaaaggggcaa
aactggagtgcacagattgtaatttgcgatcaaagttatgtttgctctcgctttgtaaac
tcaacaaaattattaattttaaacagcaatgcaacaattactcaacccgcattcaatcaa
acaagttataatacagaacaaataatcaatgtaagcttggttttttcagatgatgaccaa
gatgcaaatagtgtaacatttgaatggttcaagaatgatgccttaattaaaagagctaca
aacggcaatcttgcaaatggcacaaactcaagtgatattttaacgccggataattttgtg
gttaatgataacataattgtacaggcatttgcatatgatggggaaagaaattcaactcta
ttaaactcgactacattaacaatacagtctgcaaatactgctccaaataatccgactgct
ttaatattaaattcaagcaatacagcacatactaatttaacaaatgaggacttattgatg
attttccagtgtgatgacccggatgcaagcgatacattaacattccatcttacagcattt
aaagattttgaaaataaattccaattgcagggaagctgcaatgatcctgaaaacaaaact
gtaattttaagccatgttaacacaacaaagaatgatacctggagcttttcagttaatgta
agcgacgatagtagtgcttactcggccacaatttcaaccgtagttaatttaagtatttta
aacacagcaccaattataggaaatgttacattagatgaagcagataatatcaatttagtt
gaaaatggaaacaaaacatttagatttagctttgttgtaacagatgctgataatttaaca
gatattgttaatatctctgctgttgcgaacataacaagaggatttgaaaacactgcagaa
gcaataagatacaacgatacatttgtaaattctggagatgggggttgtaatgctgtaaac
ttaattctgcctaacagtaaaaacttttcttgtacgattaatgttgtgttttatgatggt
gcaggagcatggaatatttcagtaagaataaatgatagtgttaaaagaacagatattgtt
gattatgcatttgcgcaaaataatactcaaacatttacaataaatgaactaactgctctg
gtaatttatcctagcacaatatcattcccgacaatcgcgttgggtgatgttaatgtaagt
gcaagaataaacattacaattaataatacgggtaatgatgatatttcaggaagagaatta
agtggagaaacaattaatattactgctataaccttaattggagaaacagatagtacaact
gtgattccaacaaataacttttcaattggaacaacagaaggaatgggtgtagccccggct
tactgtgatccatctgtcagtaattttaaaaatgttacaaaattaataaacacaacagcc
gcattatctccttataataatttcagcggaccaattaatggaagttatgtattagcgcag
gctataggggcacaagagatattacagatatgtttattagacgtgccagatgatttaact
gctggacaaaattattcgagcagtaaatcgggaacgtggagtatctctatatttttcttt
agaagaagaaaagataaatcatacgaaaagaacaaggaagcaataaattctgtaattaga
ataaaaattggaaataaattaaatgatagagaattcatgagattaattaattatgaagaa
tcaatcttaataccaatttctattttcaaagataattctccattggaggcgttagttaaa
tatcttaaagaaaatttgaatttaagcttgagcgagatagcttctttattaaatcgtgac
cagagaacaatctggattacctatgataacgcaagcagaaaaataaatggattggaagga
ttaagtaagaaattgatcccgataaatgttttctccaacagaaaattaagtatcttagaa
aatacagtttattacttggtaaataaaggaatttcattgaataatatcgctaaaatattg
aaccgtaattacaagacaatatggacaacttatagcaggaccaaaaataaacatttggaa
gaaaaaaagcaaggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
