Archaeon GW2011_AR20: QT11_C0001G0617
Help
Entry
QT11_C0001G0617 CDS
T03843
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core protein
Organism
arg
Archaeon GW2011_AR20
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
Big_9
Kre9_KNH
Big_13
Ig_SIBA-E_2nd
Cadherin_5
PKD_4
PKD
Big_7
Filamin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJF62759
LinkDB
All DBs
Position
complement(513878..515797)
Genome browser
AA seq
639 aa
AA seq
DB search
MKIIRLFLLLVSFLLVINTASAITTYGEFQNGLSSININDGDQVYFDFALFSINPLIKYN
VKMYDINTNLVKTFVDSTSSNNLVSDRYFITQADYINNARYSIIIDGTDAVNDADSTILT
LQIGRGFNNAPILNLIGNKQIDEGQLLQFTITATDQDNDSLTLTTNALPQGAVFTDNNDG
TGSFTWMPSFTQSGTYNVRFTASDGQFADFEDIIITVNDITANNFPNVIINAPQQNEAVS
GIYDIIWTATDPDQPANTLDMMIEYTYNGYPWQALETGQDNNDGTFTWDTAGLSNANDYT
LRVTAIDDQGNPAIDTVLFTLDNQFTPNINIIAPVENEVISGMYNILWQATDSDQNPQTL
DIKIEYRDPDNSNNRILSRVLNLFGIALTHWITLEDSQDNNDGALLWDTTQILNANYQLR
IIATDDDGNTATGFINLFSVNNIIPQTNNNPVITSVPITNSAIYQQYNYDVEAFDPDNDL
LTYSLTMSPLGMNIDVSTGLILWIPTTIGDYNVVVRVSDNNGGFADQAFIINVLTQGITV
FGRERHDFMISNVILKQDNNDLSVLVHLDNNGNREEELDIIITDAGTGKIIKQKFDLDIH
QGTWRFIPLKNIEKGRHIIKVEAISKAFKSSRYGYIYIN
NT seq
1920 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatcataagattatttttattattagtatcgtttttattagtcataaatacagca
agtgcaataacaacatatggtgaatttcaaaatggattgagttcaattaatattaatgat
ggagaccaagtttactttgactttgcattattctcaattaatccgctaataaaatataat
gttaagatgtatgatataaacacaaatctggttaaaacttttgttgattcaacatctagc
aacaatcttgtttcagaccgttactttattacacaggcagattatataaacaatgcccga
tatagtattattatagatggaacagatgcggttaatgatgctgattcaacaatattaaca
ttgcaaattggacgtggctttaataatgcaccaatattaaacttaattggaaacaaacaa
attgatgaagggcaattattacaattcacaattacagcaactgaccaagataatgattct
ttaacattaacaacaaatgctttaccacagggtgctgtttttacagacaataacgatgga
acaggttcattcacatggatgcctagcttcacccaatccggaacatataatgtaaggttt
actgcatcagacgggcaatttgcagattttgaagatattataattacagtaaatgatatt
acagcaaataatttcccgaatgttataataaatgcaccacagcaaaatgaagcagtttct
ggaatttatgatataatctggacagcaactgacccagatcaaccagcaaataccttagat
atgatgattgaatacacttacaatggatatccctggcaagctttagaaacaggacaagac
aataatgatggaacatttacatgggatactgctggattaagcaacgcaaatgattatact
ttgagggttactgcaattgatgatcagggcaatcctgcaatagacactgttctattcact
ttagacaatcaatttacgccaaatattaatattatagcaccggtagaaaatgaagttatt
tctggaatgtataatatattatggcaggctactgattcggaccaaaatcctcaaacactg
gatattaaaatagaataccgcgatccagataattcaaacaacagaattttaagcagggta
ttaaatttattcggaatagcattaacgcattggattacgctagaagattcgcaagacaat
aacgatggagcacttttatgggatacgacacaaattttaaatgcaaactatcaattaaga
attatagcaacagatgacgatgggaatactgcaacaggatttattaatttatttagcgta
aataatataattcctcagacaaacaacaatcctgtaataacaagtgttcctataacaaat
tctgcaatataccaacaatataattatgatgtagaagcatttgatcctgataatgatcta
ttaacatattcattaacaatgtctcctttaggaatgaatatagatgtaagcacgggatta
atcttatggattccaaccacaataggagattataatgtggttgtaagggtttctgataat
aacggcggatttgcagaccaagcatttataataaatgtattaacacaaggcataactgtt
tttggaagagaaagacatgatttcatgataagcaatgttatattaaagcaggataataac
gatttgagtgttttagttcatttggataacaacggaaacagggaagaagagcttgatata
ataattactgatgctggcacaggaaagataatcaagcaaaaatttgatttagatatacat
caaggaacatggagatttatcccattaaaaaatattgagaaaggaaggcatattataaaa
gttgaggcaattagtaaagcttttaaatccagcaggtatggttatatttacattaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
