Aquimarina rhodophyticola: ACE939_05055
Help
Entry
ACE939_05055 CDS
T11453
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 3 N-terminal domain-containing protein
Organism
arho Aquimarina rhodophyticola
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3
Beta-lactamase
Glyco_hydro_3_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHH96724
LinkDB
All DBs
Position
1143182..1146103
Genome browser
AA seq
973 aa
AA seq
DB search
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DBGET
integrated database retrieval system