Aquimarina rhodophyticola: ACE939_13650
Help
Entry
ACE939_13650 CDS
T11453
Name
(GenBank) OmpA family protein
Organism
arho Aquimarina rhodophyticola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHH95346
LinkDB
All DBs
Position
3158912..3160312
Genome browser
AA seq
466 aa
AA seq
DB search
MKHLSRFLVASLLVLGFSTANAQDQNNPWAVSIGVNAVDIFPTGGDLLTQGEIFDEYFNA
ADHWNILPSVSKISVGRYIGDGFTFTVGGTVNKIENAGENPFTGEDISVGDLSYYAADGM
ISYSFKNILNTKWFDPYLGVGGGYTWLDDIGAGTLNGSLGFNFWLTENLALNVQSTYKHV
FEEYDVSNYPPTHFQHSAGLTFAFGGKDTDGDGVYDKDDECPEVPGLKEFNGCPDTDGDG
ITDGKDDCPDVAGTAEFNGCPDTDGDGVSDPNDECPTVAGLADLNGCPDADGDGIADAKD
GCPNEAGPAANNGCPYQDKDGDGVLDKDDNCPDVAGTVANNGCPEVTEEVQKTLNEYAKT
ILFDLGKSSIQKQSYGVLNDIVGILQEYPNSKFTVEGHTDSSGSNKTNQRLSDARANSVK
NYLTENGVDQFRLSAVGYGEDKPIASNKTRAGRAQNRRVEINLVKE
NT seq
1401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatcttagcagatttttagtggcttcgttattagtacttgggtttagtactgcg
aatgcacaagatcaaaacaacccttgggcagtatcgattggcgttaatgctgttgacata
tttcctaccggaggagatttactcacgcaaggagaaattttcgacgagtatttcaatgca
gctgatcattggaatatccttccttctgtatctaaaatatctgttggcagatacataggt
gatggatttacctttactgtaggtggtacagttaacaaaattgaaaatgctggagaaaat
ccttttacaggagaagatatatctgtgggtgatttatcttactatgctgcagacggtatg
atctcttacagttttaaaaatattttaaacactaagtggtttgatccttatttaggtgtt
ggtggtggatatacttggttggatgatattggtgcaggaactttaaatggttctttaggt
ttcaatttttggttaaccgagaatttggcattgaacgtacagtctacatacaagcatgta
ttcgaagaatatgacgtaagtaattatcctccaacacactttcagcattctgcaggtcta
actttcgcatttggtgggaaagatactgatggtgacggagtatatgataaagatgatgag
tgtccagaggttcctggtttaaaagaatttaatggatgtcctgatactgatggtgacggg
attacagatggtaaagatgactgtccagatgttgcaggtactgcagaatttaacggatgt
cctgatactgatggtgatggagtatctgatcctaatgatgagtgtcctactgttgctggt
ttagctgaccttaatggttgtcctgatgctgatggtgatggaattgctgatgctaaagac
ggttgtcctaacgaagctggtcctgctgcgaataatggatgtccttaccaagataaagat
ggtgatggagtattagataaagatgataactgtccagatgttgctggaacagtagcaaat
aatggatgtcctgaagtaactgaagaagttcaaaaaactttaaatgagtacgctaagact
atcttatttgacttaggtaaatcttctatacagaaacaatcttatggtgtacttaatgat
atcgttggtatcttacaagaatatccaaactctaaatttactgtagaaggtcatactgat
agctcaggtagtaacaaaactaaccagagattatctgatgctagagctaattctgttaag
aattacttaactgaaaatggtgtagatcagtttagattatcagcagttgggtatggagaa
gacaagccaatcgcttcaaataaaactagagctggtagagctcaaaacagacgtgttgaa
atcaacttggtaaaagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
